如何打开.nii文件及其他

如何打开.nii文件及其他,第1张

matlab打伍悄开nii格式的图像

方法有两种:

①Tools for NIfTI (ANALYZE) MR image

这个Matlab程序包用于处理核磁共振图慎游像,可以读取显示、保存、制作该图像。

具体如下宽橘销:

help load_nii_img

>>[hdr,filetype,fileprefix,machine] = load_nii_hdr('output.hdr')

>>[img,hdr] = load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine)

cd ('F:\Tongren\liuzhaohui\')

nii = load_nii('talairach.nii')

idx = find (nii.img==43)

nii.img(:) = 0

nii.img(idx) = 1

%tnii = make_nii(nii.img)

save_nii (nii,'43.nii')

②SPM方法:

help spm_read_vols

V = spm_vol_nifti('output.hdr')

[Y,XYZ] = spm_read_vols(V)

方法如下:

读取NIFTI,使用自带的niftiread函数

filename = 'test.nii.gz'

img = niftiread(filename)

这样读取出来的只有一个数组,也就说只是单纯读了一个图像。另一种方法是使用matlab官方给出的一个工具包,不过我没有试过。

如果想读取其他信息:

info = niftiinfo('test.nii.gz')

结果是一个结构体:

需要得到拿个信息只需要按照友茄查看结构体的方法就可以了。

读取dicom只读一张图片很简单,

img_path = 'test'%有没有扩展名dcm其实都可以

img = dicomread(img_path)

同样这样读出来的也只有一个数组,表示的是图像本身,如果想查看其他信息,可以使用dicominfo函数

img_info = dicominfo(img_path)

dicominfo返回的是一个结构体,其中包含了非常多的信息,其中一部分:

更多的时候需要读一个文件夹内的所有dicom图片,比如动态成像中不同的时间帧,或者三维成像中不同的切片,转化成.nii格式或者mat文件用作后续橡雹处理。

读取所有dicom图片的方法和读取普通图片其实是差不多的,就是先把所有文件名存成一个梁告帆list,然后一个一个读,存到一个多维的数组中。

在matlab中: addpath('/usr/local/谈团敏matlab.etc/')load_nii('或裂文件名')save_nii(nii,'文件名'含枝)ex: SROInii.hdr=data.hdrSROInii.img=SROIsave_nii(SROInii,'SROI.nii')


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原文地址: http://outofmemory.cn/tougao/12142017.html

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