. 查到的 ACE 晶体数据在 PDB 数据库中的 ID 编号是多少

. 查到的 ACE 晶体数据在 PDB 数据库中的 ID 编号是多少,第1张

PDB数据库存储结构数据启蔽手的文件是PDB文件,每一个蛋白质或核酸都对应着一个编号,即PDBID, 文件的扩展名为.pdb。

PDB文件可以由各种3D结构显示软件打开,比如pymol,Swiss-PDB viewer,VMD等。PDB文件里面的信息是有严格的格式的。各行数据,如标识,原子名,原子序号,残基名称,残基序号等,不仅要按并衡照严格的顺悄嫌序书写,而且各项所占的空符串长度,及其所处的各行的位置都是严格规定。

PDB文件是在我们编译工程的时候产生的,它是和对应的模块(exe或dll)一起生成出来的。

一般可能不会意识到PDB文件的重要性,因为如果只是我们本地进行开发,总是能够进行调适。

这里我要引入两个概念:Private Build和Public Build。

Private Build指的是在开发机器上的编译,Public Build指的是在负责编译的机器上的编译。

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程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息,使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。当用 /ZI 或 /Zi 编译 C/C++ 程序时或用 /debug 编译 Visual Basic/C#/JScript .NET 程序时将创建 PDB 文件。

在 Visual C++ 中,/Fd 选项用于命名由编译器创建的 PDB 文件。当在 Visual Studio 中使用向导创建项目时,/Fd 选项被设置为创建名为 project.PDB 的 PDB 文件。

如果使用生成文件创建 C/C++ 应用程序,并指定 /ZI 或 /Zi 而不指定 /Fd 时,则最终将生成两个 PDB 文件:

VC70.PDB (更笼统地说就是 VCx0.PDB,其中 x 表示 Visual C++ 的版本。)该文件存储各个 OBJ 文件的所有调试信息并与项目生成文件驻留在同一个目录中。

project.PDB 该文件存衡此储 .exe 文件的所有调试信息。对于本机代码,它驻留在 \debug 子目录中。对于托管代码,它驻留在 \WINDEBUG 子目录中。

每当创建竖数 OBJ 文件时,C/C++ 编译器都将调试信息合并到 VCx0.PBD 中。插入的信息包括类型信息,但不包括函数定义等符号信息。因此,即使每个源文件都包含公共头文件(如 <windows.h>),这些头文件中的 typedef 也只存储一次,而不是在每个 OBJ 文件中都存在。

链接器将创建 project.PDB,它包含项目的 EXE 文件的调试信息。project.PDB 包含完整的调试信息(包括函数原型),而不仅仅是 VCx0.PDB 中的类型信息。这两个 PDB 文件都允许增量更新。

Visual Studio 调试器使用由链接器直接创建的 project.PDB 文件并将此 PDB 的绝对路径嵌入到 EXE 或 DLL 文件中。如果调试器在该位置无法找到 PDB 文件或者如果路径无效(例如,如果项目被移动到了另一台计算机上),调试器将搜索包含 EXE 的路径,即在解决方案的“属性页”中指定的“符号路径”(“调试符号文件”页 ->“通用属性”文件夹)。调试器不会加载与所咐纤迅调试的二进制不匹配的 PDB。

搂主看看帮助先,自己找答案也是很有乐趣的。


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