Amber轨迹生成PDB文件

将prmtop和dcd轨迹导入vmd中迹扮，随后用vmd生成每一帧的友败PDB文件

此tcl脚本可用于将每一帧的构象与初始时刻的构象align，并生成每一帧的PDB文件。如果不进行align，则为好州颤斜体部分。

PDB文件是在我们编译工程的时候产生的，它是和对应的模块(exe或dll)一起生成出来的。

一般可能不会意识到PDB文件的重要性，因为如果只是我们本地进行开发，总是能够进行调适。

这里我要引入两个概念：Private Build和Public Build。

Private Build指的是在开发机器上的编译，Public Build指的是在负责编译的机器上的编译。

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