【生信基础】conda 安装R和R包

【生信基础】conda 安装R和R包,第1张

conda 安装R环境首闹丛,主要命令如下:

2.激活创建的环境,后面安装的包和软件都会在此环境中进行者樱

3.安装所需要的包

4.关闭此环境

安装完R环境后,export 相应的path,如下

安装相关的包,例如ballgown:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))

install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("ballgown")

注意,如果不export 相应的path,R安装包时很容弯岩易找不到相应的程序,如:

/bin/sh: x86_64-conda_cos6-linux-gnu-c++: command not found

电脑r安装不了程序(R程序安装)

电脑应用 电脑知识网 2022-11-06 09:46:07 1 0条评论

1. R程序安装

将 Windows XP 启动盘插入软盘驱动器,或将 Windows XP 安装光盘插入 CD-ROM 驱动器,然后重新启动计算机。 按照提示,单击以选中从 CD-ROM 驱动器启动计算机所需的所有选项。 出现“欢迎使用安装程序”屏幕时,按 R 键启动故障恢复控制台。 如果您使用的是双启动或多启凯弊弊动计算盯族机,请从故障恢复控制台中选择要访问的安装。 按照提示,键入管理员密码。如果管理员密码为空,则只需按 Enter 键。 在故障恢复控制台命令提示符处,键入下列几行命令,并在每行之后按 Enter 键: md tmp copy c:windowssystem32configsystem c:windows mpsystem.bak copy c:windowssystem32configsoftware c:windows mpsoftware.bak copy c:windowssystem32configsam c:windows mpsam.bak copy c:windowssystem32configsecurity c:windows mpsecurity.bak copy c:windowssystem32configdefault c:windows mpdefault.bak delete c:windowssystem32configsystem delete c:windowssystem32configsoftware delete c:windowssystem32configsam delete c:windowssystem32configsecurity delete c:windowssystem32configdefault copy c:windows epairsystem c:windowssystem32configsystem copy c:windows epairsoftware c:windowssystem32configsoftware copy c:windows epairsam c:windowssystem32configsam copy c:windows epairsecurity c:windowssystem32configsecurity copy c:windows epairdefault c:windowssystem32configdefault

2. r软件安装教程

1、原因其实很简单,主要是上次cad2008软件没有卸载干净导致,电脑还认为电脑上还安装有改款软件,那么解决问题的办法是就将cad2008彻底卸载干净就解决问题了

2、想彻底卸载完cad2008软件,需要删除安装程序和注册表相关内容才行,且前面已经将安装程序卸载掉了,接下来主要讲的是删除注册表内容,点击键盘上的“微软+R”键调出“运行”对话框,然后在里面输入“regedit”命令,卜州进入注册表。

3、待进入注册表之后,在注册表按照HKEY_LOCAL_user/software/autodesk找到Autodesk文件,将其删除。

4、待audodesk被删除之后,然后按住键盘上的CTRL+f组合键,分别找到以7d2f开头的文件,然后并将这些文件删除即可彻底清除cad2008软件。

5、待注册表按照上面步骤也清理干净之后,尝试重新安装cad2008软件,发现很顺利就进行了安装程序。

3. 安装r软件

我们并不需要上英文网站去搜索下载包,R环境提供了一个函数,install.packages,可以直接下载安装包。

举例来说,不加参数执行install.packages()将显示一个CRAN镜像站点的列表,选择其中一个镜像站点之后,将看到所有可用包的列表,选择其中的一个包即可进行下载和安装。

完成包的安装后,每次使用前,需要使用library()命令载入这个包。例如,要使用gclus包,执行命令library(gclus)即可。注:加载时,可能会提示需要添加另外的程辑包,直接添加即可。x,y是变量,ac,sil是gclus提供的方法。

至于包中各项参数如何使用,可以通过命令help(package="包名")来输出某个包的简短描述以及包中的函数名称和数据集名称的列表。

4. r软件怎么安装程序包

我们知道WIN8系统应用默认安装路径是在C:Program FilesWindowsApps(这是一个隐藏的文件夹)通过注册表直接更改应用默认安装路径。

1.按下【Win+R】打开运行,输入regedit启动注册表编辑器,2.定位到以下的键值:HKEY_LOCAL_MACHINESOFTWAREMicrosoftWindowsCurrentVersionAppx3.在右侧窗口找到“PackageRoot”,注意看它的数据值就是Windows8应用的默认安装路径4.先要获取APPX权限,才能够更改Windows8应用的默认安装路径选择确定,回到APPX高级安全设置再选择确定,回到APPX权限窗口将Administrators的权限勾选“完全控制”,最后确定回到注册表5.更改Windows8应用的默认安装路径6.完成

5. r软件安装程序包

第一种方法:

1、首先,使用网页搜索“华硕服务支持”关键字,在搜索结果页面中,打开华硕服务支持中心页面。

2、在接下来打开的页面中,点击选择“驱动程序和手册”菜单,在页面底部点击“前往下载中心”菜单。

3、在下载中心页面中,输入要下载驱动的产品型号,并按下回车键进行搜索。

4、在搜索结果页面中,点击“服务和支持”菜单,进入下载页面。

5、接下来,在下载页面中,选择好电脑 *** 作系统版本,然后在下面的页面中,选择要下载的驱动程序包文件,点击“下载”按钮即可下载到对应的驱动程序安装包。

第二种方法:

1、还是在华硕服务支持官网页面,点击页面中的产品型号选择页面,在列表中选择好对应的产品。

2、产品型号选择完毕之后,在页面右侧点击“驱动程序和工具软件”按钮。

3、还是按照先前的办法,点击选择 *** 作系统版本,即可看到相对应的驱动程序软件安装包。

4、最后,在展现的页面中,选择要下载的驱动程序安装包,点击“下载”按钮即可完成对应的 *** 作。

6. R软件安装包

方法一:(命令行)

1) install.packages("D:/soft/toolbox_new/NbClust_3.0.zip", repos = NULL, type = "win.binary")

2) Library(NbClust)

方法二:(界面 *** 作)

1)打开Rstudio ---->点击 “Tools” ---->点击“Install Packages”

2)点击“Browse”

3) 点击需要加载包的.zip文件--->点击“open”

4)点击“install”即可,

7. 怎么安装r软件程序包

在oppoR11上下载豌豆荚app就可以安装免费应用,游戏,壁纸铃声,清理垃圾等,很方便,而且它还有一个清洗安装应用的功能,能将不是正版的软件筛出来,比较安全 利用豌豆荚电脑端还可以管理手机文件,制作铃声,转换格式等

8. r程序安装包

apk文件是Android系统app的安装包文件,它实质上是一个压缩文件,在PC电脑上可使用解压缩软件打开查看里面内容。上面的问题可类比在PC电脑上安装软件exe文件:

1.下载

PC上任何一个有下载功能的程序(浏览器,迅雷等)都能下载EXE文件

android手机上任何一个有下载功能的程序(系统,浏览器,应用市场,应用宝等,app升级)都能下载apk

2.安装

apk或者说exe文件安装完以后都会有对应软件产生,剩下的apk文件或者exe文件 对软件的使用没有任何作用,留着也只是用于删除卸载软件后再安装,所以删不删除看你心情。

一般app在安装时部分系统会在安装界面默认勾选安装完成后删除安装文件,细心的朋友应该会看到,主要是手机内存小建议删除。

9. r软件的安装

1、键盘坏了或者接触不良,这种可能性比较小,因为其他的软件可以输入,就是steam就不是键盘的问题了。

2、密码是数字而又是从小键盘输入,然而小键盘又没打开,解决办法:小键盘左上角那个键按一下就可以打开;

3、很多密码输入区域是打不上中文的,想打的是什么,注意一下输入法状态

4、在任务管理器里的进程里找到steam的进程(ctri+alt+del)组合键,结束了后。再点击启动steam后是否恢复能输入帐号和密码了

10. r软件如何安装程序包

方法/步骤

1/6首先我们打开steam。

2/6然后进入了游戏之后,我们要做的是找到“商城”选项。

3/6接下来我们要做的是,在右上角的搜索框中输入“Half-Life: Alyx”,并点击搜索。

4/6我们点击第一个选项。

5/6点击购买,并添加到购物车。

6/6为自己购买选择支付方式,付款后点击下载即可。

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生物信息分析常遇到 R 和R包使用和安装问题,最新版的R包特别难安装,而conda可以很好的解决这个问题。conda的安装相宽扮对简单此处不再赘述。

1. R安装

使用conda安装R时,最好先使用conda create创建独立的运行的环境,这样不会悔巧和由于不同程序的依赖关系而导致冲突;此外对于一些依赖关系复杂R包,其安装可能会破坏原有的R包环境,这时也可以新建一个conda环境。

2. R包的安装

安装好R包以后,下面可以进行R包安装。R包安装通常会遇到当前channel找不到R包的情况,这时可以使用anoconda进行搜索对应R包的channel;如果还是没有合适的碧盯,可以尝试运行R程序,使用install.package()或者BiocInstaller::biocLite("")直接安装该R包。


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