centos7安装R语言(epel-release源)

centos7安装R语言(epel-release源),第1张

本文介绍在centos7下通过epel-release源安装R语言,此方法简单粗暴,类似于ubuntu下的sudo apt-get install r-base,值得拥有,具体步骤如下:

1、安装epel-release,执行命令

注意:centos6.4安装完epel-release后,需把/etc/yum.repos.d/epel.repo文件中的所有#baseurl改成baseurl、所有mirrorlist改成#mirrorlist,否则yum不能正常使用。

2、搜索下R-core,执洞蚂孝行

结果如下:

3、安装R语言,执行

经过漫长的等物租待后,如果出现Complete!,表示纳稿安装成功,此时在Terminal中敲大写R,回车,出现了熟悉的界面:

好了,可以快乐的玩耍了!

Seurat需要很多新的依赖包,否则会安装失败。服务器为CentOS版本

目罩袜前报错的,未完成安装的依赖包有:httr,leiden,plotly,reticulate,SeuratObject.

目前已更新的依赖包包括:

openssl:sudo yum install openssl openssl-devel。更新后可以完成安装httr包。

gcc+版本(本步骤目的为安装RcppTOML):

首先安装:sudo yum install centos-release-scl scl-utils-build -y

之后运行:sudo yum list all --enablerepo='centos-sclo-rh' | grep "devtoolset-",查看可芹派用的版本。查看到最新版本为9

之后运行:sudo yum install devtoolset-9-toolchain -y,完成安装

启动:sudo scl enable devtoolset-9 bash(永久启动:echo "source /opt/rh/devtoolset-8/enable"物首激 >>/etc/profile,但是没有权限)

这样之后,在启动了devtoolset9的情况下,RcppTOML终于装上了!

geos(for rgeos)安装:sudo yum install geos geos-devel

这些都搞完后,最后成功安装了Seurat。


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原文地址: http://outofmemory.cn/tougao/12513377.html

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