R语言安装DESeq2包

R语言安装DESeq2包,第1张

DESeq2用来处理转录组数据。那么先来完成第一步橘败:安装。

1、传统方式安装

麻蛋,报错了!!!!为什么受伤的总是我。

2、开启查阅资料模式,然后得到的结论是这个包的安装需要利衫册用BiocConductor或者BiocManager。

但是根据网上大神们的分享,尝试了各种方法。报错越来越多,并且越来越看不懂。

最后决定直接进入DESeq2的package官网上看吧。 https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DESeq2.html

3、最后按照Bioconductor指示安装,成功。或伍宏

本文介绍在centos7下通过epel-release源安装R语言,此方法简单粗暴,类似于ubuntu下的sudo apt-get install r-base,值得拥有,具体步骤如下:

1、安装epel-release,执行命令

注意:centos6.4安装完epel-release后,需把/etc/yum.repos.d/epel.repo文件中的所有#baseurl改成baseurl、所有mirrorlist改成#mirrorlist,否则yum不能正常使用。

2、搜索下R-core,执洞蚂孝行

结果如下:

3、安装R语言,执行

经过漫长的等物租待后,如果出现Complete!,表示纳稿安装成功,此时在Terminal中敲大写R,回车,出现了熟悉的界面:

好了,可以快乐的玩耍了!


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原文地址: http://outofmemory.cn/tougao/12526543.html

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