1、打开官网,点击DOWNLOADNOW,下载第二个WindowsZIPArchive
2、选择保存地址,一路点击next安装。
3、注册激活,需要有一个邮箱,在官网点击BUYLICENSE,点击Student/`Teacher,填入各项信息,填入验证码,等待激活邮件,根据网址下载你的注册文件。
4、打开你的PyMOL,在d出窗口上找到注册licence点击导入上面下载的注册文件即可。
利用ubuntu的软件中心搜索pymol,然后点击安装即可自动安装,就这么简单。其它的fftw,gromacs,qtiplot等软件也都可以手动安装或者使用sudo apt-get install gromacs安装
Pymol 是一个结构显示和分析程序.它是用python编写的所以叫pymol,相应的还有Jmol 等。
Pymol 的好处是做出来的图很炫。很多牛人用它做图发文章,蛋白质结构预测里面现在最牛的Baker,他们2005年Science的文章中那些漂亮的图可都是Pymol做出来的。
再者Pymol是开源的(1.0之前的版本现在还是开源的,1.0版以后可以申请教师用的免费版,现在版本是1.0),Python也是开源的。以后大家可以对Pymol进行扩展,打造自己的三维结构显示软件。
Pymol可以精确定量你的 *** 作,并放在一个文件中(或者是记录这时的状态)。
下次你用Pymol再打开这个文件时,你做的图就会重新出现,你所做的一切都保留下来了,不用重新在做一遍。 不会出现这次做出的图比上次少转了3-5度这样的事。Pymol还可以对pdb文件进行编辑,修改,它选择原子、分子、残基等也非常方便! 还有很多好处比如从虚拟氨基酸突变,到ray方法产生真正的三维立体阴影图。
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