SAMBAM文件HEADERFLAGCIGAR

SAM文件HEADER: SAM Format Header

SAM文件每一列的信息：

理解FLAG值含义的关键在于将FLAG转换为二进制，再对照下方的表，哪一位上是1，就代表这个比对符合后面的描述。

计算机处理时，可通过对FLAG值和每种FLAG进行与运算，若为True，则包含此FLAG，反之不包含。

SAM文件中CIGAR字符串详细记录了read比对到参考序列上的细节：

BAM文件中除了必须的前11列信息之外，不同的BAM文件中后面记录metadata的列是不固定的，在不同的处理软件中输出时也会有所不同，meatdata含义： SAM (Sequence Alignment/Map) Format Alignment Tags (samformat.info)

参考：

从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第5节 理解并 *** 作BAM文件

SAM Format Flag

https://samtools.github.io/hts-specs/SAMv1.pdf

这是因为你的PHP文件不是以utf-8格式保存的，不要使用记事本来编辑你的PHP文件，可以使用notepad++来更改你的PHP文件的格式，步骤如下：

一、下载并安装notepad++，可以通过百度搜索找到notepad++的官网下载安装包并安装。

二、使用notepadd++打开你的PHP文件。即通过鼠标右键你的PHP文件并选择edit with notepad++。

三、打开你的PHP文件后，在菜单栏中选择编码，并选择使用utf-8编码，最后保存文件即可。

扩展资料

记事本中的utf-8格式

记事本在使用utf-8格式保存文件时，会使用utf-8有BOM编码。而我们通常所指的utf-8是指无BOM编码。这就是我们要用notepad++来将文件更改为utf-8格式的原因。

对于UTF-8来说，BOM标记的有无并不是必须的，是可选的,因为UTF8字节没有顺序,不需要标记.

也就是说一个UTF-8文件可能有BOM，也可能没有BOM。

微软在自己的UTF-8格式的文本文件之前加上了EF BB BF三个字节, windows上面的notepad等程序就是根据这三个字节来确定一个文本文件是ASCII的还是UTF-8的, 然而这个只是微软暗自作的标记, 其它平台上不一定会对UTF-8文本文件做个这样的标记。

微软的一些软件会做这种检测，但有些软件不做这种检测， 而把它当作正常字符处理。这就造成了乱码问题。

参考资料来源：百度百科-字符编码

它的意思是设置页面内容是html，编码格式是utf-8。

header()函数的作用是：发送一个原始 HTTP 标头[Http Header]到客户端。

标头 (header) 是服务器以 HTTP 协义传 HTML 资料到浏览器前所送出的字串，在标头与 HTML 文件之间尚需空一行分隔。在 PHP 中送回 HTML 资料前，需先传完所有的标头。

常用header汇总：

header('Content-Type: text/htmlcharset=utf-8') //网页编码

header('Content-Type: text/plain') //纯文本格式

header('Content-Type: image/jpeg') //JPG、JPEG

header('Content-Type: application/zip') // ZIP文件

header('Content-Type: application/pdf') // PDF文件

header('Content-Type: audio/mpeg') // 音频文件

header('Content-type: text/css') //css文件

header('Content-type: text/javascript') //js文件

header('Content-type: application/json') //json

header('Content-type: application/pdf') //pdf

header('Content-type: text/xml') //xml

header('Content-Type: application/x-shockw**e-flash') //Flash动画

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