RNAseq常规做法是先筛选出差异表达基因,然后针对筛选出来的差异基因做GO富集分析。
在进行GO富集分析前首先要确定在你所使用的GO富集分析软件(包)中你所研究的物种有没有相应Gene与GO对应关系。如果没有,则需要自己根据该物种功能注释文件去提取Gene与GO对应关系。当然如果你对一些新组装出来的基因感兴趣,也可以通过跑blast2go等电子注释方法获取Gene对应GO信息。
Note:参考TBtools完成。
目的基因的获取方法:
1、从基因文库中获取目的基因。
2、cDNA文库。
3、反转录法。
4、人工合成法。
目的基因,也称靶标基因,是指在实验中研究或 *** 纵的特定基因。在基因克隆过程中目的基因就是要分离、纯化、克隆并转化到生物体的那个可以带来预期表型性状如抗虫或耐除草剂的基因。
目的基因获得方法是取得含有所需生物学功能或编码所需产物结构基因的DNA片段的方法。1969年贝克威思等从大肠杆菌中分离出了乳糖 *** 纵子DNA,以后有不少科学家用生物学方法、物理化学方法分离出许多纯化的基因。但总的来看为数不多。
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