pcr仪touchdown程序如何设置

pcr仪touchdown程序如何设置,第1张

首先是开机打开主页面-----按C键(programme)进入到---列表页面-----通过方向键选择一个subdirect-----按enter进入-----输入你的programme no 和name----再enter----设置lid temp:99度和preheating: on----继续按enter进入---输入

1:94度 5min

2:94度 1min

3:65度 1min(然后连按向右的方向键3下,进入到另一个界面,在

标闪烁处(也就是3的后面)输入-0.5(其上方为dt),

其他的不管,然后,再连续按enter键回到编程的主页

面,此时(65 度 1min 后面会显示一个加号)

4:72度 1min 2 19(Biometra PCR 本身加一个反应即20个循环)

5:94度 1min

6: 55度 1min

7: 72度 1min 5 4(Biometra PCR 本身加一个反应即5个循环)

8:72度 10min

9 :4度 10h

好了,一个touchdown程序就设好了,本来想照了图片对应说,但是借别人的相机,界面照得不清楚,只好这样写出来了,也不知道说清楚了没有。

博凌科为-为你解答:降落PCR(即touchdown PCR)是一种增加PCR反应特异性的优化方法。一般情况下,解决PCR非特异性扩增的方法是通过调整Mg++浓度或改变退火温度等来实现的,但这些方法既烦琐又耗时,Touchdown PCR利用一种简单的手段克服了这些复杂的问题。其基本原理是:设计多循环反应程序以使相连循环的退火温度越来越底。由于开始时的退火温度选择为高于估计的Tm值,随着循环的进行,退火温度逐渐降到Tm值,并最终低于这个水平。这个策略有利于确保第一个引物摸板杂交事件发生在最互补的反应物之间,即那些生产目的扩增产物的反应物之间。尽管退火温度最终会降到非特异性杂交的Tm值,但此时目的扩增物已开始几何扩增,在剩下的循环中处于超过任何滞后(非特异)PCR产物的地位。由于目标是在较早的循环中避免低Tm值配对,在Touchdown PCR中,必须应用热启动技术(hotstart)。编设Touchdown PCR程序的目的是要涉及一系列退火温度越来越低的循环,退火温度的范围应该跨越15℃左右,从高于估计Tm值至少几度到低于它10℃左右。例如:如果一对引物的计算Tm值为63℃,可设定PCR仪的退火温度从66℃降到50℃(每两个循环降低退火温度1℃),再在50℃退火温度下做15个循环。如果在Touchdown PCR中,持续出现假象带表明起始退火温度太低,或者目的扩增产物和非目的产物的Tm值相差无几,和(或)非目的扩增物以更高的效率扩增。把退火温度每降低1℃时所需要的循环数增加到3或4,有可能在非目的产物开始扩增以前给目的产物增加竞争优势。这时,应从程序的末尾去掉相应的循环数,以避免过度循环扩增产物的降解和产生高分子量成片产物。


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原文地址: http://outofmemory.cn/yw/11254989.html

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