ubuntu16.4怎么安装openmpi

ubuntu16.4怎么安装openmpi,第1张

1、安装依赖项:

sudo apt-get install libibnetdisc-dev

2、下载openmpi的安装包:

我用的是openmpi-2.1.0

3、解压并配置,参考readme或者是install:

shell$ tar xf openmpi-X.Y.Z.tar.gz

shell$ cd openmpi-X.Y.Z

shell$ mkdir build

shell$ cd build

shell$ ./configure --prefix="/home/$USER/openmpi"

上面的那条命令我改为:

shell$ ./configure --prefix=/path/to/openmpi --with-cuda --enable-mpi-thread-multiple

因为我是用来配合集群gpu版caffe的

4、安装:

make all

sudo make install

5、设置环境变量:

vim ~/.bashrc

加入:

export PATH="$PATH:/path/to/openmpi/bin"

export LD_LIBRARY_PATH="$LD_LIBRARY_PATH:/path/to/openmpi/lib/"

6、测试:

进入examples文件夹编译hello_c.c示例程序

运行:mpicc -o hello_c hello_c.c

再执行:mpirun -n 4 ./hello_c

没报错的话,就是成功了。

要使用 OMPT,需要在系统上安装和运行 Oracle Solaris 11。除了安装过程中使用的 root 权限之外,运行任何 OMPT 实用程序通常无需任何其他特殊权限。

如果您想编译 MPI 程序,则需要安装 Oracle Solaris Studio 12.1 或更高版本。在运行 MPI 程序的节点集群上,可以在其中一个节点上安装 Oracle Solaris Studio 并仅在该节点上编译 openmpi-15 程序包,但在所有节点上都安装该程序包。

要获取 OMPT,请安装 openmpi-15 程序包,该程序包由一个映像包管理系统 (IPS) 信息库托管,您的系统上应配置有该信息库。要验证是否配置了 IPS 信息库,请运行 pkg publisher 命令。

如果尚未 配置 IPS 信息库,请在尝试添加 openmpi-15 程序包之前配置它。否则,程序包添加将失败。

系统应配置了网络访问(如果是通过网络访问 IPS 信息库)或本地配置的从同一系统提供服务的 IPS 信息库。

本文示例使用了本地配置的 IPS 信息库,如 pkg publisher 命令的以下输出所示,该输出指示 IPS 信息库通过 HTTP 托管在 localhost 上。

root@solarix:/usr/share/distro_const# pkg publisher

PUBLISHER TYPE STATUS URI

solaris origin online http://localhost/

验证配置了信息库之后,以 root 身份运行 pkg install openmpi-15 命令添加该分发构造器程序包。然后从 IPS 信息库下载 openmpi-15 程序包并立即安装。

pkg install openmpi-15 命令显示进程的状态,如清单 1 所示,这样便于观察进度。

清单 1:pkg install openmpi-15 命令的输出

root@solarix:~# pkg install openmpi-15

Creating Plan

Packages to install: 2

Create boot environment: No

DOWNLOAD PKGS FILESXFER (MB)

service/picl 0/2 0/1430 0.0/11.9[K

developer/openmpi-15 1/2 1430/143011.9/11.9[K

Completed 2/2 1430/143011.9/11.9[K

PHASEACTIONS

Install Phase 1639/1639

PHASE ITEMS

Package State Update Phase 1/2

Package State Update Phase 2/2

Image State Update Phase 1/2

Image State Update Phase 2/2

PHASE ITEMS

Reading Existing Index 1/8

Reading Existing Index 5/8

Reading Existing Index 8/8

Indexing Packages2/2

安装完 openmpi-15 程序包之后,只需在 PATH 变量中包括 /usr/openmpi/ompi-15/bin,然后就一切准备妥当。

使用 OMPT 编译 MPI 程序

使用 OMPT 编译 MPI 程序有两种方式。您可以使用程序包中包含的编译器包装器(mpicc、mpiCC、mpif77 和 mpif90)或者直接调用编译器。

因为需要包含的 include、library 和 run 路径,建议采用第一种方法。包装器将其不了解的所有选项都传给 Oracle Solaris Studio 编译器,因此您应能够使用包装器实用程序替换 makefile 中编译器的所有实例。

以清单 2 作为示例 MPI 程序,可以使用一行命令编译程序:

mpicc hello.c -o hello.x

清单 2:示例 hello.c 程序

#include <stdio.h>

#include <mpi.h>

int main(int argc, char **argv) {

int np, me

MPI_Init(&argc,&argv)

MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&np)

MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&me)

printf("hello from %d of %d\n", me, np)

MPI_Finalize()

return 0

}

还可以执行两阶段的编译和链接:

mpicc -c hello.c

mpicc hello.o -o hello.x

如果要直接执行编译器而不使用包装器,可以通过向包装器提供 -showme 选项来确定包装器使用的选项:

mpicc -showme hello.c -o hello.x

使用 OMPT 运行 MPI 程序

编译完可执行文件并与 OMPT 库链接之后,可以单独运行该程序或使用并行作业启动器实用程序 mpirun 来运行。

要单独运行程序,只需运行该可执行文件,就跟普通非并行可执行文件一样。但是,随后将由该程序来负责调用相应的 MPI API(如 MPI_Comm_spawn 或 MPI_Comm_spawn_multiple)来生成 MPI 作业的其他进程。

要一开始就创建运行多个进程的 MPI 作业,请使用 mpirun 实用程序。例如,如果您要使用总共 8 个进程在 2 个节点上运行我们的示例 MPI 程序,可以使用以下命令:

mpirun -np 8 -host hostname1,hostname2 hello.x

有几个选项可以与 mpirun 一起用来控制绑定、布局、输出重定向等等。通过执行 mpirun -h 或 man mpirun 可以获取有关这些选项的更多信息。


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原文地址: http://outofmemory.cn/yw/11535894.html

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