细菌鉴定中测序测的是16S rDNA基因,因为RNA是不稳定的。
16S rDNA因其序列在物种间的高度多样性,成为细菌分类学研究的“分子钟”,素有“细菌化石”之称。
16S rDNA基因全长1542 bp,由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关。
16srDNA测序包括细菌基因组DNA提取、16SrDNA特异引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。是一种快速获得细菌种属信息的方法。英文名称是16S ribosomal DNA identification,应用有细菌种属鉴定。
扩展资料:
在实验室中,主要是根据所用的鉴定仪器特点、感染性疾病的类型、标本种类、采集部位等因素建立具体的微生物学检验程序,大致步骤如下。
1、获得被鉴定菌种的纯培养菌落。
2、确定染色(革兰染色、抗酸染色)、形态和排列,按科、属、种依次鉴定下去。
3、运用知识、经验、最小数量的试验方法做出鉴定。
参考资料来源:百度百科-DNA测序
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