如何用origin做pca分析作图

如何用origin做pca分析作图,第1张

在origin2018中,可参考以下步骤做pca分析作图

1、数据导入。

2、点击右下角pca插件,启动对话框。

3、设置分析数据并点击“OK",进行分析。

4、按照图示点击分析后的图,放大该图。

5、美化图片。图片美化包括颜色、图例、字体大小等等。美化后的图片如图。

#导入你的矩阵,我的矩阵是包含列名称和行名称的

exp = read.table('exp.txt', header = TRUE ,sep = '\t' )

require(graphics)#调用PCA画图的包

#做PCA时,不要行名称所以从第二列开始

PCA1 = princomp(exp[,2:(dim(exp)[2]-1)] )

summary(PCA1)

pc = loadings(PCA1)

Comp.1 = PCA1$loadings[,1]

Comp.2 = PCA1$loadings[,2]

plot(Comp.1,Comp.2 ,col = c('red','red','red','green','green','green','blue','blue','blue'))

#此数据分为三组,所以我画了不同的颜色。

#这是做PCA以及画图的简单流程,供参考!


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原文地址: http://outofmemory.cn/yw/12048295.html

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