什么叫累积生长?如何画累积生长曲线

什么叫累积生长?如何画累积生长曲线,第1张

一步生长曲线:定量描述烈性噬菌体增殖规律的实验曲线称作一步生长曲线或一级生长曲线。潜伏期 从噬菌体吸附细菌细胞至细菌细胞释放出新的噬菌体的最短时间。又可分为隐晦期和胞内累积期。裂解期 从被感染的第一个细胞裂解至最后一个细胞裂解完毕所经历的时间。平稳期 指被感染的宿主已全部裂解,溶液中噬菌体数达到最高点后的时期。 裂解量 每个被感染的细菌释放新的噬菌体的平均数

使用excel解法,比较复杂,需要用到辅助列、公式、图表: 1)从源数据中提取出唯一值,使用公式=IF(SUM(IF(A2=A3:A14,A2,0))>0,"",A2),数 组函数,三键结束。 2)对单一数据进行从小到大排序。 3)使用frequency函数求出各排序区间的数据个 数

我很久没搞概率论的东西了,如果说的不准确请轻拍。
对数正态分布是一个连续分布,所以没有概率质量函数(probability
mass
function)吧,只有离散随即变量才有。连续分布有概率密度函数(probability
density
function),和累积分布函数(cumulative
distribution
function)。
如果你说的是累计分布函数,假设X服从对数正态分布,则ln(X)服从正态分布。假设ln(X)的均值和方差分别是mu和sigma^2,那么对数正态分布的累计分布函数就是N[(ln(x)
-
mu)
/
sigma],N是正态分布的累积分布函数。

物种累积曲线( species accumulation curves)用于衡量和预测群落中物种丰富度随样本量扩大而增加的幅度,在生物多样性和群落调查中,被广泛用于判断样本量是否充分的并估计群落丰富度。

一般而言,在样本量较少的情况下,随着样本数量的增加,将有较大可能性发现大量新的物种,此时曲线呈急剧上升状态;当样本数量已经较大时,此时群落中的ASV/OTU总数将不再随着样本数量增加而显著增加,曲线将趋于平缓。

因此,通过物种累积曲线可以判断样本量是否充分:若曲线始终保持上升趋势,则表明样本量不足,反之,则表明样本量已足以反应群落的物种组成。在样本量充分的前提下,运用物种累积曲线还可以对物种丰富度进行预测。

下面我使用R脚本,vegan包对ASV/OTU丰度矩阵中每个样本所对应的SAV/OTU总数绘制specaccum物种累计曲线。

1调用vegan包,读取物种数据;

2使用 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线;

3作图展示。

如图,随着取样样本数量逐渐增加,所观测到的物种种类也不断增加。当曲线趋近平缓时,代表群落中的物种接近全部被观测到;反之不饱和,还需继续观测更多的样本数量。


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