div 放置在网页的最底层

导航菜单是flash的吗？
将flash的背景设为透明的就可以了，也就是在插入flash的代码中加入<PARAM NAME="wmode" VALUE="transparent">
把flash放远点,或者
你布局用表格把flash和下拉菜单分开,表格里面再套层
或者下列菜单也用flash作

z-index
定义和用法
z-index 属性设置元素的堆叠顺序。拥有更高堆叠顺序的元素总是会处于堆叠顺序较低的元素的前面。
注释：元素可拥有负的 z-index 属性值。
注释：Z-index 仅能在定位元素上奏效（例如 position:absolute;）！
说明
该属性设置一个定位元素沿 z 轴的位置，z 轴定义为垂直延伸到显示区的轴。如果为正数，则离用户更近，为负数则表示离用户更远。

你的下拉菜单包含在导航层里面吧。
导航层{
position:relative;
z-index:3;
}
Flash层：{
position:relative;
z-index:1;
}

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