linux下安装文件总是提示.configure --prefix: 没有那个文件或目录

linux下源码的安装由3个步骤组成：配置(configure)、编译(make)、安装(make install)。

其中配置语句“./configure --prefix=/usr/local/test”提示“没有那个文件或目录”，是因为配置指定路径“/usr/local/test”时，没有这样的文件或目录存在。

只需在“./configure --prefix=”语句中放入一个存在的目录路径，重新编译安装即可解决。

以安装hdf5软件为例，具体 *** 作步骤如下：

1、首先从官网下载hdf5，根据自己的要求下载对应的版本：hdf5-1.8.3.tar.gz。

2、然后上传到服务器某个目录下，比如/opt目录。

3、接着解压安装包，输入命令：tar -xvf hdf5-1.8.3.tar.gz。

4、解压后会生成一个目录：hdf5-1.8.3。

5、再输入：cd  hdf5-1.8.3/，切换目录到hdf5-1.8.3。

6、最后依次输入以下命令：./configure --prefix=/usr/local/hdf5；make；make check   ；make install，等待安装信息输出结束后，即可在Linux中安装成功。

HDF5安装

下载hdf5-1.8.9.tar.gz

tar -xzf hdf5-1.8.9.tar.gz

cd hdf5-1.8.9

根据cmake_patch.txt中的说明，将hdf5-1.8.9中CMakeLists.txt的第887行的Using改为USING

mkdir build

cd build

cmake ..

make

sudo make install （这一步可以让系统安装hdf5的库）

存在“hdf5r”报错，用如下语句不会报错

install.packages("devtools")

library(devtools)

install_github("HenrikBengtsson/seurat", ref="feature/hdf5r-optional")

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