linux中窗口设置

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首先，您需要找到您的终端，可能会在桌面上有快捷方式。

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如果您的桌面没有找到终端，您可以点击左上角的“运用程序”。

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在“运用程序”中找到工具，具体如下图所示：

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在“工具”下找到终端，并点击进入。

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进入下图所示的终端窗口。

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在下图所示的界面中找到“编辑”

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进入“编辑”，在其中找到“首选项”。点击进入下图所示窗口。

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在这里，您可以根据您的需要，进行一些设置。如修改编码方式等等。

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在终端的“编辑”下，找到“配置文件首选项”，您可以更改终端窗口设置。

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如您需要修改窗口的背景及其透明度，您需要找到“颜色”，并点击，进入下图所示界面。

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点击“使用透明背景”，您可以设置您背景的透明度。

trimmomatic是一款用来处理illumina测序数据的工具，可以是单条的single reads，也可以是成对的pairend reads。支持压缩格式数据。功能和其他数据处理的程序都差不多，主要包括，1、去除adapter序列以及测序中其他特殊序列；2、采用滑动窗口的方法，切除或者删除低质量碱基 1. 先新建一个文件夹，mkdir trimmomatic 2.  cd Trimmomatic   （后ls） 3. wget http://www.usadellab.org/cms/uploads/supplementary/Trimmomatic/Trimmomatic-0.38.zip 4. unzip Trimmomatic-0.38.zip 5. cd Trimmomatic-0.38  （后ls） 6.  which java  (java 在/opt/tesc/share/jdk1.8.0-20/bin/java中） 7.  /opt/tesc/share/jdk1.8.0-20/bin/java   （后ls） 8. pwd 9. /opt/tsce/share/jdk1.8.0_20/bin/java -jar /home/HYZ930402/Zmq/trimmomatic/Trimmomatic-0.38/trimmomatic-0.38.jar 10.  ls 11. /opt/tsce/share/jdk1.8.0_20/bin/java -jar /home/HYZ930402/Zmq/trimmomatic/Trimmomatic-0.38/trimmomatic-0.38.jar  --help 12. 进入自己fastq数据的文件夹 13./opt/tsce/share/jdk1.8.0_20/bin/java -jar /home/HYZ930402/Zmq/trimmomatic/Trimmomatic-0.38/trimmomatic-0.38.jar PE -phred33 017_R1.fastq 017_R2.fastq output_forward_paired.fq.gz output_forward_unpaired.fq.gz output_reverse_paired.fq.gz output_reverse_unpaired.fq.gz ILLUMINACLIP:TruSeq3-PE.fa:2:30:10 LEADING:3 TRAILING:3 SLIDINGWINDOW:4:15 MINLEN:36 （/opt/tsce/share/jdk1.8.0_20/bin/java为Java的路径，-jar /home/HYZ930402/Zmq/trimmomatic/Trimmomatic-0.38/trimmomatic-0.38.jar为该软件所在的位置，需要明确指明质量值体系是Phred33还是Phred64，默认是Phred64，这需要特别注意，因为我们现在的测序数据基本都是Phred33的了，所以一定要指定这个参数。017_R1.fastq 017_R2.fastq要进行过滤的文件，output_forward_paired.fq.gz output_forward_unpaired.fq.gz output_reverse_paired.fq.gz output_reverse_unpaired.fq.gz为输出文件 ILLUMINACLIP，接头序列切除参数。LLUMINACLIP:TruSeq3-PE.fa:2:30:10（省掉了路径）意思分别是：TruSeq3-PE.fa是接头序列，2是比对时接头序列时所允许的最大错配数；30指的是要求PE的两条read同时和PE的adapter序列比对，匹配度加起来超30%，那么就认为这对PE的read含有adapter，并在对应的位置需要进行切除【注】。10和前面的30不同，它指的是，我就什么也不管，反正只要这条read的某部分和adpater序列有超过10%的匹配率，那么就代表含有adapter了，需要进行去除； LEADING，规定read开头的碱基是否要被切除的质量阈值； TRAILING，规定read末尾的碱基是否要被切除的质量阈值； SLIDINGWINDOW，滑动窗口长度的参数，SLIDINGWINDOW:5:20代表窗口长度为5，窗口中的平均质量值至少为20，否则会开始切除； MINLEN，规定read被切除后至少需要保留的长度，如果低于该长度，会被丢掉。14. 若要将002_R1.fastq改为002_R1.fastq.gz，直接gzip 002_R2.fastq即可，若要解压，直接gunzip 002_R2.fastq.gz trimmomatic可以对测序数据进行过滤 java -jar trimmomatic-0.35.jar PE -phred33 input_forward.fq.gz input_reverse.fq.gz output_forward_paired.fq.gz output_forward_unpaired.fq.gz output_reverse_paired.fq.gz output_reverse_unpaired.fq.gz ILLUMINACLIP:$file_path/TruSeq3-PE.fa:2:30:10 LEADING:3 TRAILING:3 SLIDINGWINDOW:4:15 MINLEN:36 运行上面的命令可以完成以下任务 Remove adapters (ILLUMINACLIP:TruSeq3-PE.fa:2:30:10) #去掉接头 Remove leading low quality or N bases (below quality 3) (LEADING:3) #去掉开头质量低于3或N碱基 Remove trailing low quality or N bases (below quality 3) (TRAILING:3) #去掉末尾质量低于3或N碱基 Scan the read with a 4-base wide sliding window, cutting when the average quality per base drops below 15 (SLIDINGWINDOW:4:15) #以4个碱基为滑动窗口对reads进行扫描，当平均质量值低于15时进行剪切 Drop reads below the 36 bases long (MINLEN:36) #去掉长度小于36的reads

现如今大部分笔记本触摸板都支持多指 *** 作，手势 *** 作。目前Windows和macOS都对触摸板手势有很好的支持，尤其是macOS的手势 *** 作简直好用的不得了。但对于Linux，默认情况下可能只支持简单的几种 *** 作（点击，双指滚动）。有没有可以让Linux也支持触摸板手势呢？最近在折腾Linux的过程中发现还是有办法实现一些手势功能的，虽然达不到macOS那么丰富，但是到Windows那种级别还是可以的。

从 archlinuxcn 或者 aur 安装 libinput-gestures

Libinput-gestures是一个实用程序，可从触摸板读取libinput手势并将其映射到在配置文件中配置的手势。可以将每个手势配置为激活一个Shell命令，该命令通常是 xdotool 命令，用于 *** 作桌面/窗口/应用程序键盘组合和命令。默认已经支持了一些常用的手势比如左右滑动在浏览器前进/后退，上下滑动切换工作区，但由于Linux桌面的多样性，默认手势并不好用，我们可以自定义手势来实现一些常用 *** 作。

首先拷贝默认配置 /etc/libinput-gestures.conf 到 ~/.config/libinput-gestures.conf 。

自定义手势支持 滑 、 涅 ，以及手指数量。比如 swipe up 就是上滑， swipe up 3 就是三指上滑，后面再跟上我们要执行的命令即可。

下面是我在KDE Plasma桌面环境下，定义的一些常用手势，可供参考。

Arch Wiki

libinput-gestures GitHub详细介绍

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