怎么用linux系统分析gwas数据

怎么用linux系统分析gwas数据,第1张

写个脚本不得了 在crontab定时一下

tar zcvf/文件存放路径/webpage.tar.gz / 页面路径/

mysqldump -uroot -p(p后紧跟密码) 库名字 >/备份存放路径/data.sql

chmod 777 你的脚本

然后crontab -e 每天 凌晨一点备份 里面就写

* 1 * * * /你的脚本路径/backup.sh

够详细了 也够入门了 命令够少的了效果实现了 很简单吧 给分吧

1, *** 作系统

不需要你了解非常深入,但是Linux/Unix必须熟悉,尤其命令行 *** 作。大量的天文软件(其实很多科学计算软件都有类似的问题)都是在*nix下工作的。

另外,如果做计算机出身的在课题组负责服务器维护、技术支持等方面,那么基本上需要掌握网管方面的各种技能,起码要掌握搜索与制定、实施解决方案的能力。

2,语言

天文学方面使用的语言简单来说可以分为常规高级语言和脚本(数据处理)语言两大类,前者例如C/Fortran等,后者比如IDL/Python/matlab/maple等等。然后还有一类特殊的语言,就是在各种天文软件中进行简单批处理的语言,比如iraf。

对于C/Fortran等,可以多看看关于在其中进行科学计算的部分。

IDL和python是天文学界比较常用的数据处理语言,可以比较方便快捷地处理数据,并且具有较为充实的天文库。至于matlab/maple等等,在一般的计算机系、数学系学数值计算一般是用这个,可以通过它熟悉数值分析,不过天文学圈内用这个的实在太少,库也很少。

至于Java、DotNet等等,其实也用,用来做界面。比如我们有些用户 *** 作层面的东西,就是用DotNet WinForm开发的。当然了,对于大部分天文学家来说,他们只是计算机用户,不需要DotNet这样的编程技术。

然后还有php/aspx/mysql这些,天文学家大部分是不写网站的,那各类数据分享、课题组网站谁来做?很显然,谁熟悉这些谁做……呵呵呵

另外,编程基本功好的人,可以很快熟悉新语言和新工具,能够更快更好地进行数据处理。

3,算法

很多人觉得算法无所谓,其实并不完全是这样,只是因为各类语言以及库已经在底层把算法的工作完成了而已。比如算法课主要讨论的列表、链表、排序、树、图等等,大部分都是开发者帮你做了。可是如果涉及到特殊的数据表达,还是需要自己去写这些结构的。


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