Linux系统R语言安装（Ubuntu 18.04，apt安装）

首先创建CPAN的环境

然后进行R语言主程序的安装：

将CRAN上R包的index读取到本地：

R包安装（示例）：

以上

存在“hdf5r”报错，用如下语句不会报错

install.packages("devtools")

library(devtools)

install_github("HenrikBengtsson/seurat", ref="feature/hdf5r-optional")

在linux环境下安装R包的步骤：

第一步：用Xshell登陆服务器，cd命令进入你要存放R.tar.gz压缩包的路径，如第一张图，我是cd ~/software,进入~/software路径才开始下载R压缩包。然后wget +url（R文件网址）获取R-3.0.0.tar.gz。第二张图是下载完成后截取的。

第二步，先解压R-3.0.0.tar.gz，然后cd R-3.0.0打开R-3.0.0文件夹。接下来两条命令按第一张图所示输入。./configure命令后截取了一张图。

第三步，先make，然后 make install。make命令后出现Error 1和Error 2，我没有弄明白错误原因。往下装

第四步，vim ~/.bash_profile，vim打开此文件后在PATH中修改环境变量PATH=/home/luokai/software/R/bin:$PATH(也就是你mkdir后面的路径）。vim打开文件后有三种模式：一般模式（打开后就是此模式），编辑模式以及命令行模式。在编辑模式下修改PATH后输入:wq（保持后退出）退出vim。关于这三种模式的切换及具体 *** 作可以百度具体了解。

第五步，source ~/.bash_profile,然后R，打开R可以看见一些描述信息。R装好了。

END

1

R运行环境装好后，下载需要的R包，可以用较方便的install.packages命令。这里的dependencies设置为TRUE，可以自动下载你所装包“mpMap”所需要的其他依赖包。

2

加载R包，用包前需要先加载。有两种加载方法，实现加载的两个函数是：library和require。两者之间存在细微差别，后者会返回一个布尔值（TRUE或FALSE）来表示是否加载成功。

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