如何使用linux read命令

Linux中的read命令从标准输入中读取一行，并把输入行的每个字段的值指定给shell变量。

语法：

read [-ers] [-a aname] [-d delim] [-i text] [-n nchars] [-N nchars] [-p

prompt] [-t timeout] [-u fd] [name ...]

参数：

-a 后跟一个变量，该变量会被认为是个数组，然后给其赋值，默认是以空格为分隔符。

-d 后面跟一个标志符，其实只有其后的第一个字符有用，作为结束的标志。

-p 后面跟提示信息，即在输入前打印提示信息。

-e 在输入的时候可以使用命令补全功能。

-n 后跟一个数字，定义输入文本的长度，很实用。

-r 屏蔽\，如果没有该选项，则\作为一个转义字符，有的话\就是个正常的字符了。

-s 安静模式，在输入字符时不再屏幕上显示，例如login时输入密码。

-t 后面跟秒数，定义输入字符的等待时间。

-u 后面跟fd，从文件描述符中读入，该文件描述符可以是exec新开启的。

说明

read内部命令被用来从标准输入读取单行数据。这个命令可以用来读取键盘输入，当使用重定向的时候，可以读取文件中的一行数据。

（自己）常用的文本文件的行处理命令

示例文件：test.vcf

1、head -n 10 test.vcf

head : 默认是提取文件的前10行，-n 参数可以设定选择文件的前n行

2、tial -n 10 test.vcf

tail : 默认是提取文件的末尾10行， -n 参数可以设定选择文件末尾的n行

3、sed -n '10,20p' test.vcf

sed -n ： 随意选择需要查看的行

sed命令是一个面向行处理的编辑器，可以和正则表达式配合使用，附上较全面的sed命令使用教程。

https://man.linuxde.net/sed

4、awk 截取行的指定长度字符串

less test.gz |awk '{if(NR%2==1){print}else{print substr($1,1,75)}}' | gzip -c >test.part.gz

说明：对test.gz文件指定行截取75bp，原来是150bp

5、对n行的第三列求和，求平均值

grep -v ‘#’ test.vcf |sed -n '20,35p' |awk -F '\t' '{sum+=$3n++}END{print sum,sum/n}'

(linux 一行命令计算速度比Python快，简单计算喜欢用linux命令)

记得随时整理使用过的命令，没学过linux，靠着各种帖子，随时需要随时补给，有点懒。

Linux中的read命令从标准输入中读取一行，并把输入行的每个字段的值指定给shell变量。

语法：

read [-ers] [-a aname] [-d delim] [-i text] [-n nchars] [-N nchars] [-p

prompt] [-t timeout] [-u fd] [name ...]

参数：

-a 后跟一个变量，该变量会被认为是个数组，然后给其赋值，默认是以空格为分隔符。

-d 后面跟一个标志符，其实只有其后的第一个字符有用，作为结束的标志。

-p 后面跟提示信息，即在输入前打印提示信息。

-e 在输入的时候可以使用命令补全功能。

-n 后跟一个数字，定义输入文本的长度，很实用。

-r 屏蔽\，如果没有该选项，则\作为一个转义字符，有的话\就是个正常的字符了。

-s 安静模式，在输入字符时不再屏幕上显示，例如login时输入密码。

-t 后面跟秒数，定义输入字符的等待时间。

-u 后面跟fd，从文件描述符中读入，该文件描述符可以是exec新开启的。

说明

read内部命令被用来从标准输入读取单行数据。这个命令可以用来读取键盘输入，当使用重定向的时候，可以读取文件中的一行数据。

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