请教启动子序列预测方法

对于要分析的基因，我们需要搞清楚它的一些基本信息，第一步借助NCBI 上的Genbank查找目的基因5 端上游序列，在此以SEPT4/ARTS基因为例。

首先我们进入Genbank界面 search SEPT4 /ARTS

搜索结果中第一个就是我们要的Homo sapiens目的基因，可以自己根据研究内容进行选择

点击进入就可以看到该基因非常详细的信息：可以找到该基因在染色体上的定位 Location : 17q22

近几年相关的研究文章 Related articles in PubMed 及它编码的四个mRNA和蛋白质

我们要找的是相应的DNA 序列，点击Genbank

找到相应的mRNA join(8737..8858,13841..14137,14506..14599,15038..15124 .....)及CDS join(8856..8858,13841..14137,14506..14599,15038..15124,...) 在下面对应的DNA序列中就可找到起始密码子ATG

为了不遗漏启动子序列选择 ATG 上游3000bp和下游1000bp的序列进行分析，也可以根据自己的情况决定。

后面将用UCSC 和DBTSS 查找相应目的基因片段

1、在本机安装SSH工具，（SSH工具有很多比如xShell、FianlShell）

2、在Linux中配置ssh服务，

3、本机打开SSH工具配置Linux的ip地址及端口号即可同时连接多台Linux主机进行 *** 作。

望采纳。

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