Linux 编辑文本命令

一、vi编辑器有3种基本工作模式 分别是：命令模式、文本输入模式、和末行模式。 第一：命令行模式： 该模式是进入vi编辑器后的默认模式。任何时候，不管用户处于何种模式，按下ESC键即可进入命令模式。在该模式下，用户可以输入vi命令，用户管理自己的文档。此时从键盘上输入的任何字符都被当作编辑命令来解释。若输入的字符是合法的vi命令，则vi在接受用户命令之后完成相应的动作。但需要注意的是，所输入的命令并不回显在屏幕上。若输入的字符不是vi命令，vi会响铃报警。 第二：文本输入模式： 在命令模式下输入命令i、附加命令a、打开命令o、修改命令c、取代命令r或替换命令s都可以进入文本输入模式。在该模式下，用户输入的任何字符都被vi当作文件内容保护起来，并将其显示在屏幕上。在文本输入过程中，若想回到命令模式下，按ESC键即可。 第三：末行模式： 末行模式也称ex转义模式。在命令模式下，用户按“：”键即可进入末行模式下，此时vi会在显示窗口的最后一行（通常也是屏幕的最后一行）显示一个“：”作为末行模式的说明符，等待用户输入命令。多数文件管理命令都是在此模式下执行的（如把编辑缓冲区的内容写到文件中等）。末行命令在执行完后，vi自动回到命令模式。如果要从命令模式转换到编辑模式，可以键入a或者i。如果需要从文本模式返回，则按ESC即可。在命令模式下输入“:”即可切换到末行模式，然后输入命令。 实例演示 首先我们使用命令 vi filename 打开一个文件，这个时候进入到的是命令模式 接下来我们按i，然后键盘随便输入写内容。 然后按ESC重新进入到命令模式。 在命令模式的情况下，我们按：，进入到了末行模式。 我们输入wq!，然后回车，强行保存退出。 下次我们再打开对应文件（可用less filename命令打开），即可看到内容已经更改。 补充： （1）末行模式下：q! 【强制退出不保存】 q【退出不保存】 wq【退出并保存后面也可以加个！】 （2）如果你不想保存直接退出有可以在命令模式下使用“ctrl+z”快捷键或者按住“shift”键，输入两个z即可退出。 更多命令 进入vi的命令： vi filename :打开或新建文件，并将光标置于第一行首 vi +n filename ：打开文件，并将光标置于第n行首 vi + filename ：打开文件，并将光标置于最后一行首 vi +/pattern filename：打开文件，并将光标置于第一个与pattern匹配的串处 vi -r filename ：在上次正用vi编辑时发生系统崩溃，恢复filename vi filename….filename ：打开多个文件，依次进行编辑 屏幕翻滚类命令： Ctrl+u：向文件首翻半屏 Ctrl+d：向文件尾翻半屏 Ctrl+f：向文件尾翻一屏 Ctrl＋b；向文件首翻一屏 nz：将第n行滚至屏幕顶部，不指定n时将当前行滚至屏幕顶部。 插入文本类命令： i ：在光标前 I ：在当前行首 a：光标后 A：在当前行尾 o：在当前行之下新开一行 O：在当前行之上新开一行 r：替换当前字符 R：替换当前字符及其后的字符，直至按ESC键 s：从当前光标位置处开始，以输入的文本替代指定数目的字符 S：删除指定数目的行，并以所输入文本代替之 ncw或nCW：修改指定数目的字 nCC：修改指定数目的行 删除命令： ndw或ndW：删除光标处开始及其后的n-1个字 do：删至行首 d$：删至行尾 ndd：删除当前行及其后n-1行 x或X：删除一个字符，x删除光标后的，而X删除光标前的 Ctrl+u：删除输入方式下所输入的文本 搜索及替换命令： /pattern：从光标开始处向文件尾搜索pattern ?pattern：从光标开始处向文件首搜索pattern n：在同一方向重复上一次搜索命令 N：在反方向上重复上一次搜索命令 ：s/p1/p2/g：将当前行中所有p1均用p2替代 ：n1,n2s/p1/p2/g：将第n1至n2行中所有p1均用p2替代 ：g/p1/s//p2/g：将文件中所有p1均用p2替换 撤销回退命令： u 撤销上一步的 *** 作 Ctrl+r 恢复上一步被撤销的 *** 作 选项设置： all：列出所有选项设置情况 term：设置终端类型 ignorance：在搜索中忽略大小写 list：显示制表位(Ctrl+I)和行尾标志（$) number：显示行号 report：显示由面向行的命令修改过的数目 terse：显示简短的警告信息 warn：在转到别的文件时若没保存当前文件则显示NO write信息 nomagic：允许在搜索模式中，使用前面不带“\”的特殊字符 nowrapscan：禁止vi在搜索到达文件两端时，又从另一端开始 mesg：允许vi显示其他用户用write写到自己终端上的信息 末行模式命令： ：n1,n2 co n3：将n1行到n2行之间的内容拷贝到第n3行下 ：n1,n2 m n3：将n1行到n2行之间的内容移至到第n3行下 ：n1,n2 d ：将n1行到n2行之间的内容删除 ：w ：保存当前文件 ：e filename：打开文件filename进行编辑 ：x：保存当前文件并退出 ：q：退出vi ：q!：不保存文件并退出vi ：wq：保存并退出 ：!command：执行shell命令command ：n1,n2 w!command：将文件中n1行至n2行的内容作为command的输入并执行之，若不指定n1，n2，则表示将整个文件内容作为command的输入 ：r!command：将命令command的输出结果放到当前行 寄存器 *** 作： “?nyy：将当前行及其下n行的内容保存到寄存器？中，其中?为一个字母，n为一个数字 “?nyw：将当前行及其下n个字保存到寄存器？中，其中?为一个字母，n为一个数字 “?nyl：将当前行及其下n个字符保存到寄存器？中，其中?为一个字母，n为一个数字 “?p：取出寄存器？中的内容并将其放到光标位置处。这里？可以是一个字母，也可以是一个数字 ndd：将当前行及其下共n行文本删除，并将所删内容放到1号删除寄存器中。

在Linux系统里常用于文本查看、 *** 作、统计的命令：

通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）

接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：

参数的用法介绍：

注意事项：

用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 > 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出

zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看

结合 管道符| 使用

head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。

less命令用得最多 ，more命令用得比较少

3.1 less命令

less [参数] 文件名

less命令重要的补充用法1 ：

需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键

less命令重要的补充用法2 ：

参数用法：

less命令 不加参数 查看文件：

less命令加 -N参数 查看文件：显示行号

less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整

对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n

3.2 more命令

**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好

查看压缩文件

wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。

常见参数:

切记：用less命令，按q退出

cut命令是按关键词来切的

常见参数:

排列前：

排列后：

解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。

命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。

uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。

uniq命令通常和sort命令搭配使用

换其它文件试试

总之，uniq命令使用时经常和sort一起

常见参数:

常见用法1：

paste file1 file2

-s :按行合并 演示

常见用法2 : paste - -

常见参数:

要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用>(重定向)或是 >>(追加)

1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc

2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容

3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列

4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计

5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符

补充小知识 ：

清屏 ：control L

查看历史（输入过的）命令 ：history

常用指令

ls显示文件或目录

-l 列出文件详细信息l(list)

-a 列出当前目录下所有文件及目录，包括隐藏的a(all)

mkdir 创建目录

-p 创建目录，若无父目录，则创建p(parent)

cd 切换目录

touch 创建空文件

echo创建带有内容的文件。

cat 查看文件内容

cp拷贝

mv 移动或重命名

rm 删除文件

-r递归删除，可删除子目录及文件

-f强制删除

find 在文件系统中搜索某文件

wc统计文本中行数、字数、字符数

grep 在文本文件中查找某个字符串

rmdir 删除空目录

tree 树形结构显示目录，需要安装tree包

pwd 显示当前目录

ln 创建链接文件

more、less 分页显示文本文件内容

head、tail显示文件头、尾内容

ctrl+alt+F1 命令行全屏模式

系统管理命令

stat 显示指定文件的详细信息，比ls更详细

who 显示在线登陆用户

whoami 显示当前 *** 作用户

hostname 显示主机名

uname 显示系统信息

top动态显示当前耗费资源最多进程信息

ps 显示瞬间进程状态 ps -aux

du 查看目录大小 du -h /home带有单位显示目录信息

df 查看磁盘大小 df -h 带有单位显示磁盘信息

ifconfig 查看网络情况

ping测试网络连通

netstat 显示网络状态信息

man命令不会用了，找男人 如：man ls

clear 清屏

alias 对命令重命名 如：alias showmeit="ps -aux" ，另外解除使用unaliax showmeit

kill 杀死进程，可以先用ps 或 top命令查看进程的id，然后再用kill命令杀死进程。

打包压缩相关命令

gzip：

bzip2：

tar:打包压缩

-c 归档文件

-x 压缩文件

-z gzip压缩文件

-j bzip2压缩文件

-v 显示压缩或解压缩过程 v(view)

-f 使用档名

例：

tar -cvf /home/abc.tar /home/abc 只打包，不压缩

tar -zcvf /home/abc.tar.gz /home/abc打包，并用gzip压缩

tar -jcvf /home/abc.tar.bz2 /home/abc 打包，并用bzip2压缩

当然，如果想解压缩，就直接替换上面的命令 tar -cvf / tar -zcvf / tar -jcvf 中的“c” 换成“x” 就可以了。

关机/重启机器

shutdown

-r 关机重启

-h 关机不重启

now 立刻关机

halt 关机

reboot 重启

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