台达变频器显示GFF是什么意思?

属于接地故障，检查去电机的线路有无破损接地

原因分析：

接地保护线路动作，当交流电机驱动器检测到输出端子接地且接地电流大于交流电机驱动器额定电流的50%时，需要注意的是，这种保护是针对交流电机驱动器而不是人体的。

故障排除：

1、检查与电机的连接是否短路或接地。

2、确定IGBT电源模块是否损坏。

3、检查输出侧接线是否绝缘不良。

扩展资料：

台达变频器的常见故障代码如下：

（1）OC报警，键盘面板LCD显示：加、减、恒速时过电流。

（2）OLU报警，键盘面板LCD显示：变频器过负载。

（3）OU1报警，键盘面板LCD显示：加速时过电压。

（4）LU报警，键盘面板LCD显示：欠电压。

（5）EF报警，键盘面板LCD显示：对地短路故障。G/P9系列变频器出现此报警时可能是主板或霍尔元件出现了故障。

（6）Er1报警，键盘面板LCD显示：存贮器异常。

（7）Er7报警，键盘面板LCD显示：自整定不良。

（一）gtf 文件。GTF 为General Transfer Format缩写，跟 GFF2格式类似。相信大家做转录组分析时候经常会看到Cufflinks或者Stringtie软件对转录组进行定量与组装会时产生一个gtf文件，里面包含的信息如下：

每列信息的含义如下：

seqname  - 序列的ID，可以是染色体的ID也可以是Scaffold或者Contig的ID。

source  - 产生此文件的软件，如Stringtie产生的则为Stringtie，CUfflinks产生的则为Cufflinks，不知道的使用点 “.” 表示。

feature  - 后面start和end之间区域代表的特征，如果此区域是基因，则此处为gene，如果是外显子，则为exon，如果是转录本，则为transcript，如果是非编码RNA则为lncRNA，如果是重复序列，则为TE，等等，主要表明这一块区域的特征。

start  -上述feature的在序列上的起始位置。

end  - 上述feature的在序列上的终止位置。

score  - 一个浮点数值，也可以为点 “.” 。有值的时候代表上述feature的可靠

性。因为无论是gene还是mRNA，都是基于预测差生的，因而必然会有一个值来衡量预测准确性。

strand  - + (forward)或者 - (reverse)，代表上述feature是位于正链还是负链上。

frame  - 内含子相位，只能为'0', '1' or '2'，或者为点 “.”。 '0' 代表feature起始碱基为三联体密码子的第一个碱基, '1' 代表三联体密码子的第2个碱基, 2代表第3个碱基。

attribute  -备注列。主要备注该feature的一些信息，常见的是gene或者transcript等的ID信息以及FPKM值等，多个备注信息之间通常用分号分隔。

（二）gff 格式。为general feature format缩写，目前采用的是version 3，即我们常说的gff3文件。该文件常用来对基因组进行注释，表示基因，外显子，CDS，UTR等在基因组上的位置。众多基因预测软件如Glean，EVM，AUGUSTUS等会产生此格式文件。

与gtf文件不同之处只是在第9列。此列格式为“标签＝值”（tag=value），标签与值之间用“=”，不同的标签之间用“；”隔开，一个标签可以有多个值，不同值用“,”分割。

二、gtf与gff转换以及对GFF文件进行过滤。

常采用的软件是gffread，为Cufflinks自带的一个程序，他不仅可以实现GTF与GFF的互相转换，而且还可以对GFF文件进行过滤处理。以下是gffread的帮助信息：

Usage:

gffread <input_gff>[-g <genomic_seqs_fasta>| <dir>][-s <seq_info.fsize>] 

 [-o <outfile.gff>] [-t <tname>] [-r [[<strand>]<chr>:]<start>..<end>[-R]]

 [-CTVNJMKQAFGUBHZWTOLE] [-w <exons.fa>] [-x <cds.fa>] [-y <tr_cds.fa>]

 [-i <maxintron>] 

<input_gffmatch>为一个GFF/GTF文件，必填的一个文件

常用参数介绍：

 -g  序列文件，即GFF/GTF文件第一列ID对应的序列文件。

 -i  丢弃掉内含子大于的转录本（mRNA/transcript）

 -r  起始和终止位置，填写示例100.10000即为输出与100到10000有重叠的所有转录组，也可以限制序列ID及链，填写示例：+Chr1:100..10000。

 -R  丢弃掉此范围的转录本，与-r相反。

 -U  丢弃掉 single-exon的转录本

 -C  丢低调无CDS的转录本。

 -V  丢弃掉含有移码突变的转录本。

 -H  如果使用了-V，则重新检查并调整内含子相位，避免由于翻译起始位点选择的位置不对导致移码突变的产生。

 -B 如果使用了-V， 对于单外显子基因，则重新检查相反的链，是否存在移码突变。

 -N  丢弃掉多外显子基因剪接位点不是常见的 GT-AG, GC-AG or AT-AC序列。

 -J  丢弃掉没有起始密码子或者终止密码子的转录本，仅保留有完整编码框的转录本。

 --no-pseudo:过滤掉含有 'pseudo' 的注释信息

 -M/--merge : 合并完全相同的或者存在包含关系的转录本。

-d:使用 -M ，将合并信息输出到文件中

 --cluster-only: 类似于 --merge 但是不合并转录本

-K  对于-M 选项：also collapse shorter, fully contained transcripts

      with fewer introns than the container

-Q 对于-M 选项：移除包含关系的转录本的限制条件：多外显子转录本将会合并，如果他们内含子位置完全一样，单外显子转录本只需要有80%一样即可合并。

 --force-exons:  使GFF features的最小层级为exon

 -E 对于重复的 ID或者 GFF/GTF 其他潜在的格式问题给出警告信息。

-Z  将内含子小于4 bp的邻近的两个外显子合并为一个。

 -w  输出每个转录本的外显子序列

 -x  输出CDS序列

 -W  对于 -w 和 -x 选项，输出外显子位置坐标到FASTA序列的ID中

 -y  输出蛋白质序列

 -L  将Ensembl GTF 转换为 GFF3 conversion (implies -Fshould be used with -m)

 -o   输出"filtered" 后的GFF文件 。

-T  -o 参数将输出 GTF格式。

示例命令：

1.GFF转换GTF

gffread input.gff3 -T -o out.gtf‘

2.GTF转换GFF3

gffread input.gtf -o out.gff3

3.根据GFF或者GTF提取蛋白质，CDS和外显子序列

gffread gene.gff3 -g genome.fa -x cds.fa -y pep.fa -w cdna.fa

三、GFF文件比较

主要采用gffcompare（https://github.com/gpertea/gffcompare），其主要具有三个功能：1）评估Cufflinks/Stringtie等转录本组装软件的准确性；2）合并多个GFF/GTF中重叠的部分（多个样本组装结果的合并）3）可以对一个或多个GTF/GFF文件的注释相对于参考的GTF/GFF文件进行分类（with "class codes" assigned to transcripts as per their relationship with the matching/overlapping reference transcript），如Pacbio预测的GTF与参考GFF比较，修正和评估参考的注释结果。

Usage:

gffcompare [-r <reference_mrna.gtf>[-R]] [-G] [-T] [-V] [-s <seq_path>]

    [-o <outprefix>] [-p <cprefix>] 

    {-i <input_gtf_list>| <input1.gtf>[<input2.gtf>.. <inputN.gtf>]}

常用参数介绍：

-i  多个GTF 文件时，使用此选项较方便，将多个GTF文件写在一个文件中，通过此选项传入即可。

-r 参考的 GTF/GFF文件

-R  针对的是-r参数，仅考虑参考与任何输入的注释文件有重叠的 。

-Q 针对的是-r参数，仅考虑输入的注释文件与任何参考有重叠的 。    (警告，这将丢弃所有的新的注释位点）

-M 丢弃（忽略）掉输入的注释文件和参考注释文件中单外显子转录本

-N 丢弃（忽略）掉参考注释文件中单外显子转录本

-s 基因组序列文件

-e 当评估外显子准确性时，离参考末端外显子最远的距离（默认100）

-d 转录本聚类时起始位点相差的最大距离 (默认100)

-C  在.combined.gtf文件中包含 "contained" 类型的转录本

-F 如果仅是3’端不同，则不丢弃输入的GTF文件中被参考包含的冗余的转录本注释信息。

-G 不丢弃输入的GTF文件中被参考包含的冗余的转录本注释信息，主要是鉴于可变剪接。

-T 对于每一个输入文件不产生 .tmap 和 .refmap文件

-V 给出 GFF 解析时的警告信息

参考命令：

gffcompare  -r refChr.gff3  -R -G -o combine input.gtf

输出结果中有以下几个文件：

combine.combined.gtf

combine.loci

combine.stats

combine.tracking

其中在combine.combined.gtf中有一个class_code 代表输入的注释文件与参考注释文件相似性信息，具体如下：

#Transfrag class codes

PriorityCodeDescription

1=Complete match of intron chain

2cContained

3jPotentially novel isoform (fragment): at least one splice junction is shared with a reference transcript

4eSingle exon transfrag overlapping a reference exon and at least 10 bp of a reference intron, indicating a possible pre-mRNA fragment.

5iA transfrag falling entirely within a reference intron

6oGeneric exonic overlap with a reference transcript

7pPossible polymerase run-on fragment (within 2Kbases of a reference transcript)

8rRepeat. Currently determined by looking at the soft-masked reference sequence and applied to transcripts where at least 50% of the bases are lower case

9uUnknown, intergenic transcript

10xExonic overlap with reference on the opposite strand

11sAn intron of the transfrag overlaps a reference intron on the opposite strand (likely due to read mapping errors)

12.(.tracking file only, indicates multiple classifications)

由于输出文件几乎跟cuffcompare格式几乎是一样的，

更详细输出介绍参见http://cole-trapnell-lab.github.io/cufflinks/cuffcompare/。

转自：http://www.huoyunjn.com/wuliuxinwen/2/33709819.htm