三个简单Linux的shell脚本程序编写

shell脚本和windows平台上的bat批处理是一样的，简化用户处理重复动作的 *** 作，shell脚本由shell命令组成。

工具/原料

vim

ubuntu

方法/步骤

新建一个文件shell脚本一般用×sh作为后缀当然勇气他的也可以。打开终端输入touch

firstsh

新建一个名为first的shell脚本。

编写一个简单的linuxshell脚本

使用vim

编辑firstsh也可以用其他的文本编辑器，推荐使用vim

使用命令

vim

firstsh打开，输入i进入编辑模式。

编写一个简单的linuxshell脚本

我们写入一个简单的shell脚本，注意第一行的代码解释器的指定，这里使用的是/bin/bash/

解释器

也可用其他的根据个人情况自己选择。

脚本解释：

echo

//显示一串字符并自动换行

read

NAME

//从屏幕获取一段字符，并赋予NAME

$NAME

//取NAME变量的值

#

//只用一个#表示注释文本

编写一个简单的linuxshell脚本

文件写完后按下esc键

退出插入模式，接着输入：wq

保存文本并退出文本编辑。

编写一个简单的linuxshell脚本

输入sh

+

脚本名称

运行脚本，或给文件可运行权限

chmod

+x

然后输入/firstsh运行脚本。

沿着前面的轨迹，接下来是Linux中shell脚本的学习。这对于生信工程师后续处理大量 (海量更合适些) 数据是非常非常重要的，但是同样的，作为一个有点古板的人，对于"脚本"是什么意思我都死磕了好久。主要觉得有些抽象，尤其是跟生信的同事讨论项目分析部分的问题时，他们经常会说道这个词，在他们意识里这是个不言自明的术语，殊不知对外行人而言 (比如我)，那简直就是无情的"知识的诅咒"。经常是我假装听懂了，然后继续讨论下面的问题，形成一个模糊的印象。

百度上的解释是：脚本（Script）是一种批处理文件的延伸，是一种纯文本保存的程序，一般来说的计算机脚本程序是确定的一系列控制计算机进行运算 *** 作动作的组合，在其中可以实现一定的逻辑分支等。不知道你能不能看懂，反正我开始的时候真是一知半解。

鸟哥私房菜的解释是：shell script是利用 shell 的功能所写的一个"程序"，这个程序是使用纯文本文件，将一些shell的语法与命令(含外部命令)写在里面，搭配正则表达式、管道命令与数据流重定向等功能，以达到我们所想要的处理的目的。不明觉厉，好像更看不懂了···

Jude 的简单粗暴大白话解释是：脚本就是Linux中很多命令按照一定规则的组合，以实现某个特定的功能。Linux中有很多简单的命令，往往只是进行了简单的对话，比如 cd 就是进入到某个目录，简单直接。但是如果我想进入某个目录A，然后在目录A中创建目录B，再在目录B中创建文本C呢？当然可以一步一步 *** 作，如果想要一步到位呢，那就可以用脚本，把三个命令写在一起，一起执行。好像有点啰嗦···

或者从英语的角度去理解，脚本的对应英文是Script，而这个单词的中文释义中还有剧本的意思。剧本就好理解了啊，剧本就是导演(生信工程师)基于某个主旨(要实现的目标)按照一定的手法(规则)所写的一个故事。不管是哪个演员，都得按照剧本演。所以，学好英语对于生信也是有帮助的~

按照脚本的复杂程度可以分为：

这个无需多说，其实就是若干个简单命令的顺序排列，执行脚本后会按照命令的前后关系从前往后一一执行。

相对于简单的基本脚本，结构化的命令脚本可以施加逻辑流程控制，从而改变程序(命令)执行的顺序。基本脚本中的命令就是从上往下执行，但是结构化的命令脚本可以根据逻辑判断重复或者跳过某些命令。

常用的结构化命令(语句)有：

后面还有什么嵌套循环啊啥的，不过我觉得上面的7中命令学到家了，应该可以应付大部分在生信分析里面的应用了。

记得高中的时候，物理老师(也是班主任)在给我们讲解习题时有个有意思的套路：不管什么难题现在下面写个"答："，以示自己解决问题的决心，也是一种正向的心理暗示。脚本编写也是有套路的，不过总的来说还是比较简单。

对于简单的脚本(超级简单的那种)，直接几个命令连在一起即可，中间用"；"隔开。

对于更长更复杂的脚本，一般需要创建一个文本，并在里面编辑。这就涉及到了文本编辑器，比较常用和简单的一般有nano和vim，实在很简单，规则也容易理解，教程随手可得，不多说。

比如用vim创建了一个脚本之后，具体的语法(套路)：

ok，脚本写完了，怎么让脚本开始工作呢？这有涉及到之前讲过的环境变量和相对路径、绝对路径了。方法有三：

就这么多吧，应该有点感觉到了，剩下的就是狂练狂练了~

1只能够输入Python命令。

在Python交互模式下输入Python代码，而不要输入系统的命令。

2在交互模式下打印语句不是必须的。

在交互模式下不需要输入完整的打印语句，解释器自动打印表达式的结果，但是在文件中则需要写print语句来打印结果。

3提示符的变换和复合语句。

当在交互模式下输入两行或多行的复合语句时，提示符会由>>>变成；如果要结束复合语句的输入并执行它，那么必须按下Enter键两次，复合语句才会被执行。

4交互提示模式一次运行一条语句。

当你想测试某一条命令的时候，交互模式是一个很好的测试方法，输入然后回车即可看到执行结果，非常方便，当然对于复合语句来说，只要最后按两次Enter键即可运行代码，看到执行结果。

具体如下：

1、简介

Linux *** 作系统是基于UNIX *** 作系统发展而来的一种克隆系统，它诞生于1991年的[Linux桌面]10月5日（这是第一次正式向外公布的时间）。以后借助于Internet网络，并通过全世界各地计算机爱好者的共同努力，已成为今天世界上使用最多的一种UNIX类 *** 作系统，并且使用人数还在迅猛增长。

2、基本信息

Linux[2] *** 作系统是UNIX *** 作系统的一种克隆系统，它诞生linux系统于1991年的10月5日（这是第一次正式向外公布的时间）。以后借助于Internet网络，并通过全世界各地计算机爱好者的共同努力，已成为今天世界上使用最多的一种UNIX类 *** 作系统，并且使用人数还在迅猛增长。

3、分区规定

设备管理在Linux中，每一个硬件设备都映射到一个系统的文件，对于硬盘、光驱等，IDE或SCSI设备也不例外。Linux把各种IDE设备分配了一个由hd前缀组成的文件；而对于各种SCSI设备，则分配了一个由sd前缀组成的文件。

Linux系统中默认使用的shell程序是Bash（Bourne-Again SHell）,它是一种基于文本用户界面的命令行shell，同时也支持脚本编程。Bash是Linux系统中最常用的shell程序之一，也是许多Linux发行版默认的shell。Bash提供了一系列功能，包括命令历史记录、命令自动补全、环境变量管理、管道 *** 作等，可以方便用户在命令行下进行各种 *** 作和管理。此外，Bash也支持一些高级脚本编程功能，例如条件控制、循环结构、函数等，可以进行一系列自动化和批量处理任务。

当然是不能直接调用了，间接的方法也很容易实现，比如apache接收js发送来的请求然后执行system('hahash');。

通过前端来控制服务器进行一些复杂的脚本 *** 作，能够方便服务器管理，免得经常登录ssh，当然，安全性也是需要权衡的。

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