SEED 是 Fellowship for Interpretation of Genomes (FIG) 在2003年发起的一项无资金支持的的开源项目。该项目的核心目的是开发一种更准确、更大规模的基因组注释技术，并利用该技术对前1000个测序基因组提供更好的注释。该项目是建立在这样一个原则之上的：提高高通量注释技术准确性的关键是让专家注释整个基因组集合上的单个Subsystem，而不是让注释专家试图注释单个基因组中的所有基因。Subsystems技术是SEED项目成员为了对上千个基因组提供统一而准确的注释所提出和开发的。
使用Subsystems方法，Subsystem中的所有基因由将由该Subsystem的专家进行分析校正，从而保证注释的准确性。subsystems发展的详细过程见 >立起来,也有越来越多的站长想加入到电子商务中来,但是,电子商务网站如何才能建起来呢
电子商务网站总结起来有五个步骤：找准方向、搭建平台、充实内容、推广网站、实现盈利。
一、找准方向。据2007年6月CNNIC第20次中国互联网调查显示，中国网民总人数达到162亿，网站已经达到131万个，可见互联网发展之迅速，也有越来越多的人开始投身互联网进行创业，而正因为互联网充满很多的机遇，所以找准适合自己的方向才尤为重要，是建立一个垃圾网站迅速做大流量赚取广告费，还是跟着潮流做领先时代的web20，web30的网站呢，是专心做一个网站，还是批量生产，制造出一堆网站呢？个人觉得选择自己熟悉的行业，集中所有精力，做一个垂直型电子商务网站不失为很好的选择。选择一个自己熟悉的行业，更能发挥自己的专业优势，集中所有精力就要求把多余的网站砍掉，网站多余的栏目砍掉，把有限的精力集中到自己擅长的领域，并最终在这个领域处于领先的地位，应该在座有不少了解站长网图王的，之前他拥有上百个网站，但很知名的没有几个，现在砍掉所有其他网站，站长网就很快在业内确定了很好的领先地位，所以不建议你做一个比阿里巴巴、当当网更大更全更体面的网站，因为你有多大的能耐能超越阿里巴巴呢，所以建议你选择某一个细分的领域，建一个垂直型的网站，也许建好后你就是该行业排名数一数二的网站，因为真正细分到很专业的领域，竞争并不是那么大。最后建议你选择盈利模式很明确的领域，例如b2b、b2c、c2c等，远比追求概念的web20来得实在。综上所述，互联网创业，首选建立垂直型电子商务行业网站。
二、搭建平台。当我们确定了一个适合自己的发展方向后，接下来就是把我们的想法变成现实，搭建开展电子商务必须的网站平台。一般会有两种选择，一种是自己熟悉网站开发技术，或者自己聘请网站开发人员，另外一种就是选择开发好的通用网站系统或者委托专业的网络公司开发网站。两种方式各有优势，但毕竟自己精通技术的比较少，请员工到公司来开发，成本又太高，不是很划算，所以我推荐创业期间可以选择第二种方式。假如我们建立成都房产门户，是直接找房产网站系统专业开发商开发的易想房产网还是委托专业网络公司量身开发呢？一般找专业的公司开个一个仿购房者的房产网站，通过核算，从0规划开发这样庞大的系统，至少要开发2个月以上时间并且3人以上的熟手开发团队来进行，开发下来5万的报价说不定都赚不了什么，而购买开发好的易想房产网，只需要几千元外加制作一套属于自己的界面就可以轻松享有开发团队历时半年开发并将不断加强的功能强劲的房产网站系统。通过开发网站几年的经验告诉我，对于开发网站的客户其实是拥有很大的风险的，网站一次性开发很难达到很完美的层次，只有通过像软件一样不断的升级完善，才能最终出来一个相对完美的系统。所有我觉得搭建网站平台，假如这种模式的网站已经有很成熟的系统，直接选择系统未尝不是很好的途径。选择一个很好的功能强劲的网站系统能够让你的创业事半功倍，少走弯路。例如假如你要做社区可选北京的dz，做资讯可选择成都的风讯，做商城选择shopex，而想做像阿里巴巴、淘宝网、大型商城、购房者房产网等电子商务网站选择成都的易想软件
三、充实内容。首先，不可否认的是：一个成功的网站不能不注重外观布局。外观就象一个人的衣服，是给别人的第一印象。给人留下一个好的印象，那么他看下去或者说再次光顾的可能性才更大。可是我觉得更主要的还的网站的内容（除非你的网站是纯艺术的，即是拿来观赏的）。一般的的网站都讲究实用，有用才是最重要的。不信大家研究一下世界排名靠前的网站，那个网站的内容不是很充实的，并且在同行网站当中内容是更丰富的。形式美只会给人留下一个好的印象，好的印象固然可以让别人进一步浏览你的网站。可如果从你网站上看到的都是些垃圾，谁还会看下去？？谁会对一些自己不感兴趣的东西流连忘返？？在使用易想软件的客户当中，有很多网站立足于很小的行业，如微波商务网、酒商务网、广告商务网，厦门购物网、联合一百、区域的房产网等，因为站长对行业的了解，所有通过维护，让网站上的内容在同行业网站当中算是最丰富的，这样就让访客转化成长期客户，很多网站虽然只运营了几个月时间，已经有了每天几百上千个IP流量了，而且是同行网站当中人气最旺的网站，轻松实现了盈利。
四、推广网站。当网站平台搭建好了，内容充实起来了，我们就要考虑把网站推广出去，大型电子商务网站推广可以从两个大方面做手，一是从网站自身出发，做整站seo页面优化，二是通过形式多样的外部推广。做整站优化要注意到：一、首先让网站尽量多的页面静态化，尽量采用DIV+CSS格式。静态有两种，一种是真静态，一种是伪静态，这两种形式都是搜索引擎所喜欢的，静态网页一方面搜索引擎的机器人很容易抓取到，另外一方面访问的时候也不用打开数据库，加快了网站的访问速度和减轻了服务器的承载量。二、优化网站的连接结构及页面内容。对于搜索引擎而言，链接就是一切，所以你网站的链接结构一定要设计的合理，页面的层次最好不要超过三级，网页内容不要过长，搜索引擎常规收录对网页页面的大小以及字数都有最佳要求的。最好一个网页包含的文字信息在于2万个汉字之内，也就是说是4万字节左右。网页大小也包括在38K左右的大小是被认为是最友好的一种适合大小的规格！。三、设置合理的网页标签和网页的头部文件，能够让一些热门的关键词搜索你排名在前面。通过这样优化下来，假如你网站有一万条信息，每条信息每天可以从搜索引擎带来一个流量，那每天就能轻松带来一万的流量。其他外部的推广，样式就很多了，原则是让能出现我们网站的地方都出现，有交换友情链接，论坛群发，邮件群发，qq群发，策划活动，软文报道，或者更有站长把网址挂在身上，骑着自行车到街上人多的地方宣传效果也不错，只要能想到的我们都可以用上。
五、实现盈利。作为一个公司的天职是盈利，同样作为一个站长，肩上有着让网站自负盈亏的责任。要想让网站盈利，我觉得首先要尽快研究出网站的盈利模式，例如b2b、b2c、c2c网站或者区域性的房产门户盈利模式就很明确，现在热门的博客网站，视频网站，交流社区人气很容易做，但流量很难转化成现金，最终也只能自己掏腰包养活网站；要想让网站盈利，还要主动出击，线上和线下相结合，靠网上流量带来的点击广告费用，是养活不了网站的，例如我们建立一个四川商务网，想让客户主动通过网站给我们交会员费，那是很难的，即使是阿里巴巴这样强势的品牌也需要几千上万个极具战斗力的营销团队才能推动网站会员的快速发展。
二十二：服务器配置
1、CPU
CPU是计算机的大脑，计算机的计算主要就是靠CPU来完成，所以，CPU非常重要，CPU的计算速度决定了计算机的计算能力。也就是水桶效应中最上面的那块木板。比如序列拼接这个工作，需要将测序的reads切成更小 的片段，然后将这些小片段根据序列间的关系，连成更长的片段，那么这些片段有数百万至数千万，需要非常大的计算量。如果数据复杂，计算量就更大了。
另外，CPU还需要支持多核心，CPU是大脑，一个核心是一个心眼儿，所以，我们知道心眼越多的人越聪明。多核心就可以进行并行计算，在生物信息分析中，有些工作，可以进行并行计算。相当于原来一个人的工作，现在由100个同样的人来做，理论上速度快了100倍。因此，在硬件配置中，选择CPU是非常重要的。
2、内存
内存是CPU和硬盘之间数据交流的媒介，计算机需要将存储在硬盘上的数据读取到内存中，CPU才能用来计算，而CPU不能直接读取硬盘上的数据，必须通过内存这个缓冲区，举个例子，CPU是大脑，内存是脖子，脖子以下是硬盘。内存往往就是“瓶颈”。
假设一个人的全基因组测序数据，采用二代测序的方法，人的基因组3G，10被数据30G，那么这30G的碱基，在切成更小的kmer，假设数据增加到了100G，还不算存储序列的一些其他信息，序列拼接的时候必须一次将所有数据同时存入内存，如果内存达不到100G，拼接根本无法完成。
3、硬盘
硬盘其实是计算机硬件配置中非常重要的一环，但是硬盘往往容易被大家忽略掉，认为硬盘用来存储数据，只要需要足够大就行了，这是不对的。
首先大存储量是必须的，因为生物数据往往都称为生物大数据，非常消耗存储空间，包括原始的数据存储，中间分析结果，最终结果，数据备份等，尤其是在样品量大的时候，就会非常占据存储空间，一般都是以T为单位的。
其次，硬盘的读写速度，这个也是非常重要的因素，因为目前CPU计算速度和内存已经足够大了，这样的条件下，硬盘成为限制计算机整体性能的因素。因此使用SSD硬盘会明显改善计算机性能。由于目前SSD过于昂贵，可以选择SSD+机械硬盘的方案，硬盘要做成RAID提高读写速度和数据安全性。
4、显卡
可以选配显卡，这个并不是必须的，因为很多分析工作都是文本 *** 作，显卡适合于图形计算，例如计算蛋白质空间结构，构建系统网络等，可以选择配置显卡。
5、不间断电源UPS
UPS相当于一个大的移动电源，为了防止突然断电，导致数据丢失。UPS还是非常重要的。有些生物计算需要持续很长时间，例如拼接一个大的基因组，构建一个大的系统发育树等可能数十天时间，一旦断电，损失非常大，不要心存侥幸心理，灾难往往就发生在那些心存侥幸心理的人身上。
6、其他
冷却系统，如果是大型计算系统，设备会产生大量热量，需要建设冷却系统。
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欢迎订阅我们的微信公众号，更多精彩内容等你发掘！①一代测序
优势：
1 第一代测序技术的准确性远高于二、三代测序，因此被称为测序行业的“金标准”；
2 第一代测序每个反应可以得到700-1000bp的序列，序列长度高于二代测序；
3 第一代测序价格低廉，设备运行时间短，适用于低通量的快速研究项目。
劣势：
1 第一代测序技术一个反应只能得到一条序列，因此测序通量很低；
2 第一代测序技术虽然单个反应价格低廉，但是获得大量序列的成本很高。
②二代测序
优点：
1 一次能够同时得到大量的序列数据，相比于一代测序技术，通量提高了成千上万倍；
2 单条序列成本非常低廉。
缺点：
1 序列读长较短，Illumina平台最长为250-300bp，454平台也只有500bp左右；
2由于建库中利用了PCR富集序列，因此有一些含量较少的序列可能无法被大量扩增，造成一些信息的丢失，且PCR过程中有一定概率会引入错配碱基
③三代测序
优点：
1 无需PCR扩增，不会人为的引入突变；
2 超长读长，平均读长可达到10Kb，最长读长可以达到40Kb；
3 覆盖均匀，无GC偏好性；
4 通过reads的自我矫正，10X以上准确率能够达到999%；
5 可以直接检测到甲基化信息，同步进行表观遗传学识别。
缺点：
1 单条序列错误率较高，平均核苷酸准确性不到85%；
2 测序成本较贵。想了解更多前沿咨询、行业进展以及病毒组相关知识，可以微信或百度搜索“基因帮”。二代测序和宏基因组的区别在于：
1、二代测序是宏基因组学研究的主要测序方法。以典型的二代测序平台Illumina为例，其测序原理是基于桥式聚合酶链式反应（PCR）的边合成边测序，特点是读长短、准确性高。和一代测序相比，具有测序速度快、准确性高以及成本低的优良特性。
2、宏基因组测序的定义：宏基因组测序(MetagenomicsSequencing)是对环境样品中全部微生物的总DNA(也称宏基因组：Metagenomic)进行高通量测序，主要研究微生物种群结构、基因功能活性、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制，扩展了微生物资源的利用空间，为环境微生物群落的研究提供了有效工具。
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