使用SnapATAC分析单细胞ATAC-seq数据（一）: SnapATAC简介与安装

SnapATAC (Single Nucleus Analysis Pipeline for ATAC-seq) 是一个能够快速、准确和全面分析单细胞ATAC-seq数据的R包，它可以对单细胞ATAC-seq数据进行常规的数据降维、聚类和批次校正分析，鉴定远端调控元件并预测其调控的靶基因，调用chromVAR软件进行motif分析，同时还可以将scRNA-seq和scATAC-seq数据进行整合分析等。

Rongxin Fang, Sebastian Preissl, Xiaomeng Hou, Jacinta Lucero, Xinxin Wang, Amir Motamedi, Andrew K Shiau, Eran A Mukamel, Yanxiao Zhang, M Margarita Behrens, Joseph Ecker, Bing Ren Fast and Accurate Clustering of Single Cell Epigenomes Reveals Cis-Regulatory Elements in Rare Cell Types bioRxiv 615179; doi: >

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