XML在医疗保健行业的应用

XML在医疗保健行业的应用,第1张

XML在医疗保健行业的应用

 大学、政府和行业组织使用 XML 进行文档存储和数据集成已经有十年时间了。包括 IBM 在内的数据库软件厂商很早就认识到了 XML 的潜力,因此他们帮助制订基于 XML 的标准和行业专用的标记语言,同时致力于在他们的数据库平台中集成 XML 和 SQL。IBM 和 Informix 首先发布了 IBM DB2 XML Extender、Informix Web DataBlade 和 Informix XSLT DataBlade,然后把 XML 支持更深入地集成到 RDBMS 服务器中,从而大大推进了 XML 和 SQL 数据库处理的集成。

  XML 对于许多行业都很重要,尤其是那些具有复杂的集成、存档和遵从性需求的行业。医疗保健行业可以使用面向服务体系结构 (SOA) 和支持 SQL/XML 的数据库构建新的应用程序,同时解决遵从性和标准问题,支持电子医疗记录系统。

XML 在医疗保健行业中的兴起

  XML 在医疗保健行业中兴起的一部分原因是,Health Insurance Portability and Accountability Act (HIPAA) 等法律要求保护患者的安全和隐私。美国议会为保护保险覆盖范围颁布了 HIPAA,它包含电子事务标准以及对数据私密性和安全性的要求,应用于索赔、付款、利益调查、索赔状态和其他事务。HIPAA 还要求美国卫生和福利部为医疗保健信息的分发制订规则。

  把这些法律规定转换为可应用的标准常常是标准开发组织的工作;医疗保健行业中最重要的标准开发组织之一是 Health Level Seven (HL7)。HL7 为医疗保健领域中管理数据和临床数据的交换制订标准,包括索赔处理、医疗影像和制药(见本文底部的边栏 “HIPAA 和 HL7”)。医疗保健行业还为 *** 作性数据模型和研究数据表格化模型开发了规范(Clinical Data Interchange Standards ConsorTIum)。这些标准应用于内部系统和外部实体(比如美国食品与药品安全管理局)之间的通信。
包括医疗保健在内的各种行业中的新标准推进了支持 XML 的应用程序的开发。这种新的技术潮流意味着,我们可以构建应用程序(常常是使用 SOA 的复合应用程序),通过可互 *** 作服务的组合和丰富的数据库支持访问医疗数据。

  但是,高效地管理大量 XML 数据是一种挑战。IBM 在 DB2 9 中引入了 pureXML 技术,允许以原生 XML 格式存储、索引和查询文档。一些医疗机构已经使用 IBM DB2 的原生 XML 功能构建了系统,这些系统不仅符合医疗保健行业标准,而且改进了数据访问和性能。

电子医疗记录的难点

  由于医疗数据常常进行频繁的修改,大型医疗保健组织非常依赖于 XML。UCLA Health System 就是这样的组织:它是一个包含多家医院的医疗保健供应商,提供各种临床和医疗保健服务。它包含 Ronald Reagan UCLA Medical Center、Santa Monica UCLA Medical Center and Orthopaedic Hospital、Mattel Children's Hospital UCLA、Resnick Neuropsychiatric Hospital at UCLA 以及 UCLA Medical Group(包括初级护理和特别护理部门)。2,000 多位医生每年处理超过 1 百万次门诊和 80,000 个住院病例。

  这种规模的医疗保健系统每天必须处理大量数据,包括医疗记录更新、化验结果、MRI/CT/电子束 CT 血管造影图像、入院/出院/转院数据和药房订单。所有数据必须安全可靠地存储(以及最终适当地存档),同时必须能够根据需要访问它们。另外,多个地点的各类职员必须可以轻松地搜索、传输和组织这些数据。还需要轻松快速地输入和更新信息,因此所需的 IT 基础结构非常复杂。

  UCLA Health System 用面向患者的文档系统 (PODS) 满足这些需求,这是一个电子医疗记录 (EMR) 存储库,能够存储和检索超过 2000 万份文档。PODS 是 UCLA 文档管理系统 extended SOA (xSOA) 的患者信息源。通过与 PODS 协作,xSOA 为 GE BDM 药品信息系统、CliniComp Essentris 急诊系统、Orion Soprano 门诊数据系统和表单门户提供查看界面。xSOA Central Document Bus 连接到 GE 图像存档和通信系统 (PACS)、门诊应用程序和图像以及 PODS 存储库。Image Bus 支持访问患者诊断图像,Forms Bus 处理 UCLA Health Services 使用的各种电子表单。HL7 Message Bus 提供符合 HL7 要求的通信。
通过结合使用 SOA 和 DB2 数据库,PODS 支持 2,000 名医生和 3,000 名护士访问患者记录。这个系统支持超过 400 种电子表单;这些表单替代以前使用的 1,000 页纸制表格,有助于消除手写导致的误解和遗漏。数据库存储大约 200 万位患者的信息,每天增加 12,000 份文档,包括新的化验结果、医生处方和与患者相关的其他数据。PODS 包含一个文档存储库和元数据存储库,可以把医疗记录文件与 DB2 数据库关联起来。PODS 在文件服务器上存储医疗记录图像文件;它使用 IBM DB2 数据库存储相应的元数据,用网络附属存储阵列存储图像文件,包括 PDF 和文本。

  当一个文档进入系统时,它存储在文件服务器上并在 DB2 数据库中编制索引。文档并不会被删除,因为 PODS 存储库还作为患者数据的存档。为了确保可服务性和 24x7 高可用性,PODS 体系结构包含冗余服务器和数据库,通过数据复制在数据库服务器之间进行同步。

  DB2 数据库元数据存储当前包含 3000 万行信息。元数据使用 DB2 9 原生 XML 引擎存储为 XML 格式。UCLA Medical Center CompuTIng Services 体系结构经理 Charles Wang 博士指出,PODS 使用超过 400 个模式,这些模式都符合 W3C XML Schema 语言。PODS 软件把这些模式映射为一个虚拟模式,供整个系统使用。系统使用四个键的组合为文档及相关元数据创建惟一标识符。

  为了保护患者隐私,PODS 的设计采用一个多级安全模型。除了 DB2 内置的安全功能之外,软件体系结构还包含文档和元数据处理器,它与安全服务集成。还提供基于角色的安全性和单点登录功能。在使用文件系统管理 XML 文档和模式时,必须专门处理安全性、并发控制、并行处理和版本化等问题,而使用 DB2 存储 XML 模式和文档可以方便地解决这些问题。

UCLA Health System 基于 SOA

  PODS 实现展示了 SOA 如何帮助应用程序使用基础服务;在这里,是用于访问患者信息的服务。文档通过文档服务接口进入系统并放在队列中。PODS 体系结构使用 IBM WebSphere MQ 实现异步消息传递和队列。对于 HL7 消息传递,UCLA Health System 使用 Sun SeeBeyond eGate Integrator,据 Wang 博士说,这是 “所有应用程序接口使用的企业范围标准”。

  PODS 队列管理器控制输入队列、异常队列和复制队列。管理元数据和图像文件的标准服务提供用于上传、下载、查询和更新文档的应用程序编程接口 (API)。系统支持审计,可以为除上传之外的所有数据库活动生成报告。

PODS 的演进

  UCLA Health System PODS 实现使用 DB2 pureXML 功能支持对患者文档的访问,包括装载、查询和更新数据。它提供一组 Web 服务接口,支持门诊系统上传和查询数据。

  这个系统的最新版本是 PODS3 和 PODS4。这两个版本都基于 SOA,但是使用不同的 DB2 功能进行 XML 处理。对于以基于 SOAP 的 Web 服务形式处理 XML 消息,PODS3 和 PODS4 都使用 SysTInet 和 IBM WebSphere 软件的组合。但是,PODS4 实现标志着从 DB2 XML Extender 过渡到 DB2 9 的 pureXML 功能。例如,DB2 9 引入了对 SQL:2003 标准定义的一个特性的支持,允许 XML 列类型作为一等数据类型。可以在 Data DefiniTIon Language (DDL) 语句、函数和存储过程中使用 XML 类型。

  迁移到 DB2 9 的另一个好处是,混合型存储引擎和查询优化器 “理解” XML,可以把涉及 XML 的查询映射为关系语法。迁移到 PODS4 并没有改变 PODS 的功能性需求,但是 pureXML 技术简化了元数据处理,有助于满足系统的响应时间和可伸缩性目标。

      上传过程展示 PODS3 和 PODS4 之间的差异。例如,在上传 PDF 文档时,PODS3 上传过程把文档和 XML 元数据文件存储在 EMC 文件服务器上。它把 DB2 SQL 存储引擎使用的元数据分解为 XCollection,XCollection 是 DB2 XML Extender 实现的一个类型。上传过程还使用 IBM WebSphere Application Server 解析器检验模式,在 DB2 数据库中为 PDF 和 XML 文件的路径编制索引。与上传相关联的 DB2 事务包括生成惟一的文档 ID、在活动历史表中记录这次上传以及对 18 个表执行 SQL INSERT。PODS4 上传过程以另一种方式处理 XML 文档元数据。PODS4 上传过程并不在 18 个表中存储元数据,而是使用 XML 类型的 DB2 列保存元数据,只需对四个表执行 INSERT。

简化的处理和标准遵从性

  从 PODS3 迁移到 PODS4 和 DB2 9 大大简化了 UCLA Health System 的数据库管理和复制任务。PODS3 体系结构使用 DB2 8 和 XML Extender,数据库包含 28 个表。PODS4 数据库设计使用 XML 列,只需要 10 个表并取消了 PODS3 使用的 20 个存储过程。

  因为 UCLA Health System 使用 XML 存储患者元数据,所以在 PODS 集合中支持新的电子表单需要为表单内容创建数据定义或模式。经常处理新表单的 DBA 希望能够高效地定义新的数据类型,比如化验结果。迁移到 DB2 9 可以减少在系统中添加新表单和模式所需的时间:在 PODS4 中支持一个新表单通常只需要两小时,而在 PODS3 中需要两周。

  在任何行业中,标准对于互 *** 作性和高效数据交换都非常重要。 XML 是一种有效的标记工具,可以定义数据交换和存档所需的词汇表,因此 XML 已经成为医疗保健供应商的重要工具。但是,健壮的应用程序需要可靠的数据管理基础结构。PODS 展示了医疗保健供应商如何解决创建、存储和交换电子医疗记录的难题。通过 PODS,UCLA Health System 和其他医疗保健机构已经开始利用 XML 技术处理复杂的电子医疗记录,满足 HIPAA 和 HL7 标准的要求并提高生产力。

HIPAA 和 HL7

  1996 年,HL7 成立了 Claims Attachment 工作组,它的任务是对处理保险索赔所需的信息进行标准化,此后开发了用来满足 HIPAA 要求的一系列标准。在同一年,HL7 开始通过它的 SGML/XML 特别兴趣小组积极研究 XML。最初的成果是用于索赔处理的六个推荐附件。

  在此之后,HL7 开发了消息传递规范 Clinical Document Architecture (CDA) 和 Reference Information Model (RIM)。HL7 还为向州和地方公共医疗部门提交 CDA Public Health Case Reporting (PHCR) 制订了电子提交标准。随着标准的成熟,XML 已经成为越来越重要的技术。例如,CDA 的第一版定义了一个 XML 体系结构,它用于交换基于规范中包含的 XML Document Type Definition (DTD) 的门诊文档,使用 HL7 RIM 和 HL7 注册的编码词汇表定义其语义。即将发布的 CDA 第三版只使用 XML 编码。

  IBM 负责软件标准的副总裁 Karla Norsworthy 说,“IBM DB2 对 XML 的原生支持允许以医疗保健行业标准 HL7 CDA 格式存储内容。IBM 承诺通过开放标准促进医疗保健行业的互 *** 作性和创新。我们已经看到了广泛采用开放标准(比如 Java 和 XML)和 HL7 等组织开发的医疗保健标准对灵活性、投入市场的时间和创新的积极影响。”

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