wordpress数据库中taxonomy字段的取值都代表什么含义

wordpress数据库中taxonomy字段的取值都代表什么含义,第1张

wp_commentmeta:存储评论的元数据

wp_comments:存储评论

wp_links:存储友情链接(Blogroll)

wp_options:存储WordPress系统选项和插件、主题配置

wp_postmeta:存储文章(包括页面、上传文件、修订)的元数据

wp_posts:存储文章(包括页面、上传文件、修订)

wp_terms:存储每个目录、标签

wp_term_relationships:存储每个文章、链接和对应分类的关系

wp_term_taxonomy:存储每个目录、标签所对应的分类

wp_usermeta:存储用户的元数据

wp_users:存储用户

在WordPress的数据库结构中,存储系统选项和插件配置的wp_options表是比较独立的结构,在后文中会提到,它采用了key-value模式存储,这样做的好处是易于拓展,各个插件都可以轻松地在这里存储自己的配置。

post,comment,user 则是三个基本表加上拓展表的组合。以wp_users为例,wp_users已经存储了每个用户会用到的基本信息,比如 login_name、display_name、 password、email等常用信息,但如果我们还要存储一些不常用的数据,最好的做法不是去在表后加上一列,去破坏默认的表结构,而是将数据存在wp_usermeta中。

wp_usermeta这个拓展表和wp_options表有类似的结构,我们可以在这里存储每个用户的QQ号码、手机号码、登录WordPress后台的主题选项等等。

NCBI 分类学数据库(taxonomy database)不是分类学或系统发育信息的信息源(primary source),而且也没有自己的一套完整的分类学系统,相反它只是努力整合各种各样来源的系统发育和分类学的知识,包括发表的文献、基于网络的数据库、序列提交者的建议以及来自NCBI 外部的分类学专家。因此NCBI 的分类学数据库不是一个系统发育或分类学的“专家数据库”(Wheeler et al., 2000)。

获取序列所对应的分类学信息有两种方法。

一种方法,从NCBI 网站下载gi与taxid 对应表,在Taxonomy 数据库的FTP 地址下载。这个目录下有多个压缩文件,其中针对Windows *** 作系统的两个针对蛋白质序列和核苷酸序列的压缩文件分别是gi_taxid_prot.dmp.gz 和gi_taxid_nucl.dmp.gz 文件。这两个文件都只有两列,左边为gi 号,右边为Taxid。由于这些文件非常大,因此用浏览器来打开这些文件几乎是不可能的。随着时间的推移,这两个文件会越来越大,不过速度不会是指数增长的,并且在美国东部时间的每个星期一2:00 am NCBI 会对其进行更新。

对于Windows 用户还有一个文件称为taxdump.zip 文件。文件解压缩后包括1 个*.prt 文件和6 个*.dmp 文件。Gencode.dmp 文件保存有不同的密码子表,与同目录的gc.prt 联合使用;merged.dmp 是保存有合并的taxid 号的对应表;nodes.dmp 是结点信息;division.dmp 是较大的几个分类;names.dmp 结点名称信息,每个id 对应多行。这些数据被Phylogenie 软件包中的blammer 程序用于构建进化树。

利用ftp 地址的连接利用Http 或ftp 方式将文件下载到本地,通过本地程序或脚本搜索文本,来建立gi 号与Taxid 之间的联系(图)。这种方法比较适合于在线服务的Web 形式的程序,通过在本地不断地及时更新程序就可以完成这项工作。

第二种方法是对Taxonomy 数据库进行API 分析。NCBI 用来保存Taxonomy信息的数据库名称为TAXON。


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原文地址: https://outofmemory.cn/sjk/10069061.html

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