什么是后基因组时代

人类基因组：指人体dna分子所携带的全部遗传信息。由24条双链的dna分子组成（包括1~22号染色体dna与x、y染色体dna），上边有30亿个碱基对，30多亿个碱基对构成的人类基因组精确测序，发现所有人类基因并搞清其在染色体上的位置，破译人类全部遗传信息。30亿个碱基对，太庞大了，无法精确的告知你序列是什么样的。但可以告诉你：人类基因组计划：

1、概念：是指分析测定人类基因组的核苷酸序列。

2、主要内容：绘制人类基因组的四张图，即遗传图、物理图、序列图和转录图。绘制这四张图好比是建立一个“人体地图”，沿着地图中一个个路标，如“遗传标记”、“物理标记”等，可以一步步地找到每一个基因，搞清楚每一个基因的核苷酸序列。

3、进展：2000年6月26日，6国科学家向世界宣布：“人类基因组草图”的绘制工作已经全部完成。预计到2003年，“人类基因组精图”的绘制工作也将全部完成。

4、意义：（1）对于各种疾病，尤其是各种遗传病的诊断、治疗具有划时代的意义；（有利于疾病的诊断和治疗。）（2）对于进一步了解基因表达的调控机制、细胞的生长、分化和个体发育的机制，以及生物的进化等也具有重要的意义；（有利于研究基因的表达和调控机制）；

（有利于研究生物的进化。）（3）将推动生物高新技术的发展，并产生巨大的经济效益。（有利于培育优良的动植物品种）。另外，美国奎格•文特研究所和多伦多儿童医院以及加州大学的研究者日前公布了奎格•文特本人的基因组序列，这是世界上第一次公布单个个体二倍体的基因组序列，初步分析报告发表在最新一期的《plos生物学》上。

医学文献常用数据库：Pubmed

我常用很多跟遗传病有关的数据库，有：OMIM（人类孟德尔遗传数据库）、HGMD（人类基因突变数据库）、Clinvar（NCBI临床突变数据库）、gnomAD（人群频率数据库）、dbSNP（人群频率数据库）、InterVar（位点致病性评判）、GeneReviews（疾病数据库）、PharmGKB（药物基因组数据库）、常用预测软件数据库。

跟CNV分析有关的数据：DGV（基因组变异数据库）、Decipher（拷贝数变异数据库）、ClinGen数据库（剂量敏感判断数据库）、UCSC Genome Browser（基因组浏览器）。

表型库：HPO（人类本体表型库）、CHPO

上面是我常用的数据库，不知是不是您问的内容，当然查文献最多还是在pubmed。

Brachypodium distachyon

Genome:

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Plastid: NC_011032

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水稻（Oryza sativa）是禾本科中目前唯一已完成基因组测序的模式植物，但由于它很早从冷季型禾本科中进化分离出来，故其作为禾本科其他亚科的模式植物有一定局限性; 二穗短柄草（Brachypodium distachyon）是一种温带禾草，归属禾本科早熟禾亚科短柄草族短柄草属，具有基因组小、株型小、自花授粉、一年生、生命周期短、有二倍体和一系列多倍体、易培植、易转化等诸多优点，尤其是与很多重要的谷类作物如小麦、大麦、燕麦、玉米、水稻、高梁等以及许多牧草与草坪草有较近的亲缘关系，因而是温带禾本科植物功能基因纽学以及生物能源作物（如柳枝稷）研究的理想模式植物(>

可以选择红色方框里的数据库，主要用前面两个：genomic sequence 和 CDS sequence。

1、分别是基因组序列和CDS（mRNA）序列。这里选择基因组序列数据库

2、在红色方框里粘贴FASTA格式的序列

3、点击“submit”提交

4、点击blast result 中的 accession下的 LOC号，即红色方框的内

5、在以下页面中，即可下载序列（分别有CDS序列和genomic序列），还可以在 genome browser中查看该基因在基因组中染色体的位置等信息，还有基因结构的信息。该图中浅色部分是UTR，深色部分是CDS

6、用genome browser中查看该基因信息，点选track下的general中的DNA/GC content ，--->update image ，再放大图像即可看到以下结果。

HuRef Genome其实就是人类注解基因组（The Human Reference Genome）。是指经过注解的人类基因组。楼上所说的HuRef Genome Browser是浏览HuRef Genome的浏览器，是一个网站。

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