分子生物学数据库大全哪里有哪位知道神经生物学方面的论坛有哪些

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打开google首页，搜索VecScreen，进入VecScreen首页，复制序列，运行，Viewreport。

二、结果：

输出序列长度918bp，载体序列的区域456bp——854bp

克隆载体：M13mp18phage，pGEM-13Zf()，pBR322，pRKW2。

2、使用相应工具，分析下列未知序列的重复序列情况，输出重复序列的区域、包含的所有重复序列的类型、重复序列的总长度及MaskedSequence。

一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的。

进入google首页，搜索，进入主页，进入，复制序列，DNAsource选择human，运行！点击超链接，在结果中选择

AnnotationFile：_1287631711outhtml

3、使用CpGPlot/CpGReport/Isochore工具，分析下列未知序列，输出CpG岛的长度、区域、GC数量、所占的百分比及Obs/Exp值。一、步骤：

进入google首页，搜索CpGPlot，进入CpGPlot主页，program中选择cpgreport复制序列，运行！

二、结果：

CpG岛的长度：385bp

区域：48——432；

GC数量：SumCG=297，百分数=7714

Obs/Exp：101、4、预测下面序列的启动子，输出可能的启动子序列及相应的位置。一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的

进入google首页，搜索NeuralNetworkPromoterPrediction，进入主页，复制序列，选择eukaryote，运行！

二、结果：

位置：711—761，1388—1438，1755—1805；

5、运用SpliceSitePrediction工具分析下面序列，分别输出内含子－外显子剪接位点给体和受体的区域及剪接处位置的碱基。一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的

进入google首页，搜索SpliceSitePrediction，进入主页，复制序列。Organism选择Humanorother。其他默认，运行！

二、结果：

供体：

受体：

6、对下面序列进行六框翻译，利用GENESCAN综合分析(首先确定给定序列的物种来源)哪个ORF是正确的，输出六框翻译（抓图）和GENESCAN结果(包括predictedgenes/exons和predictedpeptidesequence(s)两个部分)。一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是Zea的

进入google首页；搜索NCBI，进入主页，选择allresources（A~Z），选择O，选择ORFfinder。复制序列，默认，运行！

二、结果：ORF图

三、步骤：进入google首页，搜索GENESCAN，进入主页，Organism:Maize，，其他默认，运行！

四、结果：

G7、进入REBASE限制性内切酶数据库，输出AluI、MboI、EcoI三种内酶的RecognitionSequence和Type。

一、步骤：进入google首页，googleinEnglish，搜索REBASE，进入主页，分别输入AluI、MboI、EcoI，运行！

在MboI中选择第一个，EcoI选择第二个。

二、结果：

ENSCAN图

8、使用引物设计工具，针对下列未知序列设计一对引物，要求引物长度为20-25bp，扩增产物长度300-500bp，退火温度为50-60℃。请写出选择的一对引物（ForwardPrimerandReversePrimer）、及相应的GC含量、引物的位点、Tm值和产物长度。一、步骤：进入google首页，搜索genefisher，进入主页，复制fasta格式，chechkinput，sunmit，；；设置一下引物长度为20-25bp，扩增产物长度300-500bp，退火温度为50-60℃；。

二、结果：

GC含量：

引物的位点：

Tm值：

产物长度：。

9、将下面的序列用NEBcutter20工具分析，用产生平末端及有四个酶切位点的酶进行酶切，并用抓图提交胶图（viewgel），要求14%agarose和Marker为100bpDNALadder。

一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST，得知是linear。

进入google首页，搜索NEBcutter20，进入主页，选择linear，运行！选择customdigest，，把“1”改为“4”，选择平末端，后digest。Viewgel。选择14%agarose和Marker为100bp。

二、结果：

然后就是蛋白质的了一般都在expasy里swiss-prot适用于检索的computepi/mw求理论分子量分子量protparam物理化学性质protscale亲水性疏水性peptidemass分析蛋白酶和化学试剂处理后的内切产物

NCBI(>

数据库相似性搜索——核酸序列与核酸数据库比较（BLASTN）

蛋白质序列与数据库中蛋白质序列比较（BLASTP）

两序列比对（Aligntwosequences）

DNA序列分析——ORFFinder(>

分析实验序列外显子部分——GENSCAN（genesmite/GENSCANhtml）

分析实验序列的可能酶切位点——NEBcutter20(toolsneb/NEBcutter2/indexphp)

注：Customdigest--viewgel

限制性内切酶数据库——REBASE(rebaseneb/rebase/rebasehtml)

设计引物扩增实验序列——Genefisher

Primer3

蛋白质序列分析及结构预测：

1预测蛋白质的分子量及等电点:ExPASy（ComputepI/Mw）

2分析蛋白质的基本物理化学性质：ExPASy（ProtParam）

3分析蛋白质的亲水性和疏水性：ExPASy（ProtScale）

4分析蛋白质在各种蛋白酶和各种化学试剂处理后的内切产物：ExPASy（PeptideMass）[：kinaseK]

5分析蛋白质的信号肽：ExPASy（SignalP）

6预测蛋白质的二级结构：ExPASy（Jpred3）

多物种分子系统发育分析：EMBL（>

人脂联素蛋白质序列：NP_004788

人类胰岛素生长因子IB前体：P05019

生物医学工程方面的专业数据库现在在国内一般都是用中国生物医学文献数据库，>

中国生物医学文献数据库最多一次可以下载500条记录。

中国生物医学文献数据库CBM中输出检索结果时，一次最多可以导出500条文献记录。中国生物医学文献数据库（ChinaBiologyMedicinedisc,CBMdisc)是由中国医学科学院医学信息研究所于1994年研制开发的综合性中文医学文献数据库。

中国生物医学文献数据库学科涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学以及中药学等生物医学领域的各个方面，是目前国内医学文献的重要检索工具。它收录1978年以来1600余种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献记录，总计超过400万条记录，年增长量超过35万条。

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