生物信息学MPSS数据库是什么，有什么作用

生物信息学中kog数据库是什么意思

根据需要从一级数据库中搜集对象的相关数据集合而成的就是二级数据库

像genebank,EMBL这种都是不加选择的一级数据库,只要是实验获得的,不管什么东西的序列,哪怕是不完整的序列都能上传,而且它们的数据也有可能有重复如果有某个人专门研究细菌的鉴定,需要用到正式被认可的16srDNA序列,为了研究方便,把这些一级数据库的各个种类细菌的公认标准16srDNA序列的数据进行整理,重新构建了一个数据库,这就是所谓的二级数据库如果不构建,直接用一级数据库做blast,就会得出很多未被承认甚至不完整的序列,还要人工一个个看过去,找出公认的标准序列,这样就很麻烦我举得例子在现实中就是韩国的EzTaxon

（1）常规鉴定 常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征；理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应和血清学反应等。（2）BIOLOG碳源自动分析鉴定 BIOLOG鉴定系统以微生物对不同碳源的利用情况为基础，检测微生物的特征指纹图谱，建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比，得出鉴定结果。（3）分子生物学鉴定 提取细菌基因组DNA，然后PCR扩增16srDNA片段并测序，将结果与GeneBank或者Eztaxon对比分析，一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌，该方法也是目前微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。——源自百度百科

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（1）常规鉴定 常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征；理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应和血清学反应等。（2）BIOLOG碳源自动分析鉴定 BIOLOG鉴定系统以微生物对不同碳源的利用情况为基础，检测微生物的特征指纹图谱，建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比，得出鉴定结果。（3）分子生物学鉴定 提取细菌基因组DNA，然后PCR扩增16srDNA片段并测序，将结果与GeneBank或者Eztaxon对比分析，一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌，该方法也是目前微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。——源自百度百科

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