Swissprot数据库如何找出蛋白质的相似序列

总的而言有下列12种

0 = pairwise,显示具体匹配信息（缺省）

1 = query-anchored showing identities,查询-比上区域，显示一致性

2 = query-anchored no identities,查询-比上区域，不显示一致性

3 = flat query-anchored, show identities,查询-比上区域的屏文形式，显示一致性

4 = flat query-anchored, no identities,查询-比上区域的屏文形式，不显示一致性

5 = query-anchored no identities and blunt ends,查询-比上区域，不显示一致性，无突然的结束

6 = flat query-anchored, no identities and blunt ends,查询-比上区域的屏文形式，不显示一致性

7 = XML Blast output,XML格式的输出

8 = tabular,TAB格式的输出

9 =tabular with comment lines,带注释行的TAB格式的输出

10 =ASN, text,文本方式的ASN格式输出

11 =ASN, binary [Integer] default = 0,二进制方式的ASN格式输出

但是如果你在网站上进行，一般就为2-5种，如0 = pairwise, 8 = tabular,7 = XML Blast output，看你在哪个站点进行了

到NCBI官网，数据库选择protein，输入蛋白质名称，然后再结果里找物种为human的结果，拿到这个序列到NCBI的Blast里比对，程序选择Blastp，比对结果中肯定至少有一个是小鼠同源蛋白。或者直接用clustalX把human，mice的蛋白序列直接比较。

有序列，是为了方便查询使用的。

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3、生产系统“零”干扰

源端增量数据采集使用日志硬解析的方式，对源端数据库零干扰

4、高可靠

以事务为单位，保证交易完整性和一致性

多机制断点续传保障

软件、节点故障自动恢复

5、图形化数据校验

提供同步结果自动比对能力，自动生成同步报告

保证数据的一致性并有据可依

6、提供可视化监控看板

轻松查看拓步、同步状态、速率进度信息等

ncbi主页 进入 blast 进入 nucleotide blast 将序列粘入窗口中 选择nucleotide cllection（nr/nt）选项 进行比对就可以了 出来的序列相似性最高的就是你的目的序列

可以。选择专业数据库检索数据库检索匹配专业数据可扩大检索的范围进行检索，得到答案依旧正确。数据库检索：指通过相关的检索系统，对序列、结构以及各种二次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找。

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