哪里下载molfile

在一些专业的分子模拟软件网站下载。Molfile可以在一些专业的分子模拟软件网站上免费下载，例如Gaussian、Amber、GAMESS-US等软件的官方网站都可以下载Molfile，还可以在一些化学数据库的网站上下载Molfile，例如PubChem和ChEMBL。Molfile是一种文件格式，用于保存有关分子的原子、键、连接性和坐标的信息。

对于蛋白质，在对接之前我们需要预处理，比如，去水，加全氢，导出为PDBQT文件设为受体，下面我们来介绍一下怎么做。

我们这里处理蛋白文件需要借助pyMOL这个软件，我在前面提到过，我也上传到了网盘，有2个版本，一个22，一个24，前面说安装时需要安装20序列的Python，这是针对22版本的pyMOL，如果你安装24版本，需要安装Python37。我用的是24的版本，有点喜新厌旧啦。

首先我们打开pyMOL这个软件



我们这里可以直接打开我们下载的pdb格式的分子结构文件，如果是PDB数据库的蛋白，我们可以通过命令下载。1e8y是我们蛋白的 PDB ID。回车后就会在可视化窗口看见我们的蛋白结构。



或者通过File里面选择get PDB，d出窗口输入信息后点击下载。



如果窗口中不显示该结构的信息，我们在软件的右下角点一下S，就出来了。或者从菜单栏Display里勾选Sequence



然后我们可以通过序列，左右滑动，删除我们不需要的部分，比如水分子，把0全部选中，右键点击remove，就删除了。如果有其他金属离子，那就需要根据需要了，如果该离子是该蛋白的组成部分，那就不能去除。



我们可以继续用pymol进行加氢处理，也可以后续用AutoDockTools处理。我们统一用AutoDockTools吧，因为pymol功能很多，一时间介绍不完，B站有很多教程，你可以去搜索学习，当然，你可以完成对接后，再去学习。我们这里保存为PDB格式蛋白文件文件名称：1E8Y_PYMOLpdb。



如果我们去掉的组分比较多，比如有多条链，去掉了其中的一些链，把不需要的水分子，离子，溶剂分子去掉，只保留对对接需要的部分，对剩下的结构我们需要进行一个修复。这里需要一个网页工具，地址：>

树，那么知识就是滋养之水。如果说潜能是创造力的基础，那么知识就是潜能的主要内容。下面我给大家分享一些高中化学必修一摩尔知识点大全，希望能够帮助大家，欢迎阅读!

目录

化学必修一摩尔知识

高中化学学习方法

如何提升高中化学成绩

        化学必修一摩尔知识

1物质的量

(1)概念：表示物质所含微粒数目多少的物理量

(2)符号：n

(3)单位：mol

2摩尔

(1)概念：摩尔是物质的量的单位，每1mol物质含有阿伏加德罗常数个结构微粒。

(2)符号：mol

(3)说明：①当描述物质的物质的量(使用摩尔)时，必须指明物质微粒的名称，不能是宏观物质名称;②常见的微观粒子有：分子、原子、离子、电子、质子、中子或它们特定的组合;③当有些物质的微观粒子只有一种时，可以省略其名称。

3阿伏加德罗常数

(1)含义：实验测定12g12C中碳原子的个数

(2)符号：NA

(3)单位：个/mol

(4)说明：①NA的基准是12g碳-12中的原子个数;②12C不仅是摩尔的基准对象，而且还是相对原子质量的基准;③NA是一个实验值，现阶段常取602×1023作计算;④要注意NA与602×1023的区别。

4摩尔质量

(1)概念：单位物质的量的物质的质量

(2)符号：M

(3)单位：g·mol-1

(4)说明：①注意与化学式的式量相比较，区分其中的差异。②化学计算题中常会用平均摩尔质量，注意跟平均相对分子质量的差异。③与1mol物质的质量的比较。

5气体摩尔体积

(1)概念：单位物质的量的气体的体积

(2)符号：Vm

(3)单位：L·mol-1

(4)标准状况下的气体摩尔体积：①标准状况：0℃、1atm即101×105Pa;②理想气体。③标准状况下的气体摩尔体积约为224L·mol-1。

(5)影响物质体积大小的因素：

①构成物质的微粒的大小(物质的本性)

②结构微粒之间距离的大小(温度与压强来共同决定)

③结构微粒的多少(物质的量的大小)

6物质的量浓度

(1)概念：用单位体积的溶液中溶解溶质的物质的量的多少来表示溶液的浓度

(2)符号：c

(3)单位：mol·L-1

(4)说明：①物质的量浓度是溶液的体积浓度。②溶液中的溶质既可以为纯净物又可以为混合物，还可以是指某种离子或分子。

常用计算公式和注意问题

1m、n、N之间的计算关系

(1)计算关系：n = m/M = N/NA

(2)使用范围：只要物质的组成不变，无论是何状态都可以使用

2V、n、N之间的计算关系

(1)计算关系：n = V/Vm = N/NA = V/224

(2)使用范围：①适用于所有的气体，无论是纯净气体还是混合气体

②当气体摩尔体积用224L·mol-1时必须是标准状况

3c、m、V、N之间的计算关系

(1)计算关系

(2)使用范围：

①以上计算关系必须是在溶液中使用

②微粒数目是指某种溶质

③若溶液是由气体溶解于水形成的，要特别注意以下几点：

a必须根据定义表达式进行计算

b氨水中的溶质主要是NH3·H2O，但要以NH3为准计算

c不要错误的用水的体积或气体与水的体积之和当作溶液体积，必须是通过计算最后溶液的体积。

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        高中 化学 学习 方法

1、对于化学学科来说需要你背下来的化学方程式非常多，你需要每天对这些方程式进行复习背诵，巩固自己的 记忆力 ，毕竟这些对于解答化学题来说都是基础必背的知识，我们保证在记忆化学方程式的过程中不能出现任何差错，如果死记硬背对于你来说行不通的话，你可以选择在进行化学题的练习中把化学方程式融入到其中， 增强记忆力 。

2、对于一些做错的化学题型一定要及时整理，要 总结 自己为什么会做错，做错的原因出现在哪里，是化学知识点记得不准确还是就是不会，对错题进行整理也有利于你最后化学学科上的复习，提高化学成绩。

3、在每次学完一节新的化学知识的时候，要及时在课后对老师课上强调的重点部分进行总结归纳，看看自己是否真的听懂了老师所讲的新知识，不懂的地方一定及时向老师进行询问这样才能帮助自己提升化学成绩。

4、高中化学除了背相关的方程式，最重要的还是要多多进行习题的练习，习题能够帮助你找出自身在知识点上还有哪些不足之处以及更好地帮助你查漏补缺，提升学习效率。

5、在课堂时一定要跟住老师所讲的化学知识思路走，活跃自己的思维，充分利用课堂时间来提高化学学习的效率。，这样也能够为自己的在课后节省一些学习化学的时间，而且课堂时间对于学习化学上来说也更能够帮助你练成一个更好地解题思路，开拓你的解题思维。

6、我们要注重自身对于化学反应原理上的理解，从这个角度出发进而更好地理解化学知识点，提高化学答题的正确率，帮助成绩提升。

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        如何提升高中化学成绩

1、预习很重要。要提前了解老师即将进行教学的内容真的很有帮助的。上了高中有些老师为了赶进度都会讲得特别快，跟不上加上没预习这节课可能大部分都是懵的，课下为了补上没听懂的部分会花去你更多的时间。

2、回归课本。其实每次考完试，试卷中所涉及的考点在书本上都是可以找到的。如果你的化学成绩很一般，建议大家可以少刷一些题，把精力重点放到基础分上，提升会更快。

在历年的高考化学复习中，有不少同学在高三复习时，一点不重视课本，不在课本基础知识点和重点上下功夫，而是选择盲目大量刷题，我们知道：课本知识是复习的依据，也是老师们出题的依据。一定要重视。

3、该背的一定要背下来。例如判断氧化还原反应，需要背的是背氧化性顺序表。在一个可以进行的氧化还原反应中，氧化剂的氧化性强于氧化产物，还原剂的还原性强于还原产物，当氧化剂不足量时优先氧化还原性强的物质，反之亦然。写方程式的时候用升降价配平法，对于复杂、难判断化合价的物质使用零价法。

4、经常进行针对性训练。对于我们如今面对的应试 教育 ，做题是不能避免的，但是需要注意的是做对题，做好题，有针对性地练习。

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化学是一个很杂很乱的学科，但想要提高成绩也是不难的,只要掌握了办法，就能事半功倍下面是我整理的高中化学各大模块重要知识点及答题策略，希望大家喜欢。

选择题中的“关键词”

1、过量还是少量

2、化合物还是单质或混合物

3、请注意选择题“正确的是”，“错误的是或不正确的”两种不同要求。请注意，做的正确，填卡时却完全填反了，要十分警惕这种情况发生。

4、排列顺序时，分清是“由大到小”还是“由小到大”，类似的，“由强到弱”，“由高到低”，等等。

5、阿佛加德罗常数题中：

①水：常温下是液态;

②稀有气体：单原子分子;

③SO3：常温下是液态或固态;

④NO2：存在与N2O4的平衡;

⑤和气体的体积有关的比较(如密度)：注意标准状况下才能用224L，同温同压下才能比较。

⑥不是气体的有机物不需要标准状况的条件，如戊烷，辛烷等。

⑦把原子序数当成相对原子质量，把相对原子质量当相对分子质量，把原子量当质子数。

⑧Na2O2、H2O2、Cl2等若既作氧化剂又作还原剂时，反应转移电子数易多算。

⑨注意选项中给的量有无单位，有单位不写或写错的一定是错的。

⑩273℃与273K不注意区分，是“标况”还是“非标况”，是“气态”还是“液态”“固态”不分清楚。224Lmol-1的适用条件。注意三氧化硫、乙烷、己烷、水等物质的状态。区分液态氯化氢和盐酸，液氨和氨水，液氯和氯水。

6、离子大量共存：

①注意酸碱性环境

②注意氧化还原反应如Fe2+与H+、NO3-不共存，Al与HNO3无氢气等③注意审题，是大量共存还是不能大量共存

7、离子方程式正误：

①看电荷是否守恒

②看物质拆分中否正确，只有强酸、强碱、可溶性盐可拆， 其它 一律不拆③看产物是否正确，如CO2的反应是生成正盐还是酸式盐、Fe3+与S2-反应是氧化还原反应等

④看原子是否守恒

⑤水解与电离方程式要看准，不要被反应物有水所迷惑。

8、注意常见符号的应用如分清是“====”还是“”，"△H>0"、"△H<0"、沉淀、气体符号，电荷与价标、写电子式时""的应用等等。

解答题中的“关键词”及应注意之处：

1、书写“名称”还是“化学式”、“分子式”、“电子式”、“结构式”还是“结构简式”。

2、书写“化学方程式”还是“离子方程式”或“电极方程式”、“水解方程式”、“电离方程式”。

3、书写方程式中的物质聚集状态、特殊的反应条件、产物(如酯化反应的水)写全。

4、填写结果时应对准物质。如写“A”的不应写成“B”的。

5、实验填空题或简答题，注意文字用语要准确：

①不用错别字：如脂与酯、铵与氨、坩与甘、蘸与粘、蓝与兰、褪与退、溶与熔、戊与戌、催与崔、苯与笨、饱和与饱合及有机官能团名称等。

②不用俗语：如a、打开分液漏斗的开关(活塞)，b、将气体通进(入)盛溴水的洗气瓶，c、酸遇石蕊变红色(酸使石蕊呈红色)等。

③用语严谨：如pH试纸不能说湿润，其它试纸均要写湿润。三对共用电子对要竖写。离子浓度要用C()表示。

6、原电池正负极不清，电解池、电镀池阴阳极不清，电极反应式写反了。

7、求气体的“体积分数”与“质量分数”不看清楚，失分。求“转化率”、“百分含量”混淆不清。

8、两种不同体积不同浓度同种溶液混和，总体积是否可以加和，要看题目情景和要求。

9、有单位的要写单位，没有单位的就不要写了。如“溶解度”单位是克，却不写出，“相对分子质量”、“相对原子质量”无单位，却加上“g”或“gmol-1”。摩尔质量有单位(gmol-1)却不写单位，失分。

10、描述实验现象要全面、有序，与实验目的相联系，陆海空全方位观察。

11、气体溶解度与固体溶解度表示 方法 、计算方法混为一谈。

12、mA(s)+nB(g)pC(l)+qD(g)这种可逆反应，加压或减压，平衡移动只考虑其中的气态物质(g)的化学计量数。

13、配平任何方程式，最后都要进行“系数化简”。书写化学反应方程式，反应条件必须写，而且写正确。氧化—还原反应配平后，得失电子要相等，离子反应电荷要守恒，不搞假配平。有机化学方程式未用“→”热化学反应方程式不写反应条件，不漏写物质的聚集状态，不漏写反应热的“+”或“-”，反应热的单位是kJ·mol-1。

14、回答简答题，一定要避免“简单化”，要涉及原理，应该有因有果，答到“根本”。

15、有机结构简式中原子间的连结方式表达正确，不要写错位。结构简式有多种，但是碳碳键、官能团不要简化，酯基、羧基的各原子顺序不要乱写，硝基、氨基写时注意碳要连接在N原子上。如，COOHCH2CH2OH(羧基连接错)，CH2CHCOOH(少双键)等(强调：在复杂化合物中酯基、羧基最好不要简化)。中文名称不能写错别字。酯的n元环是碳原子数加O(或N)原子数。

16、解推断题，实验题。思维一定要开阔、活跃，联想性强。切不可看了后面的文字，把前面的话给忘了，不能老是只从一个方面，一个角度去考虑，应该是多方位、全方位进行考虑。积极地从考题中字字、句句中寻找出“突破口”。

17、看准相对原子质量，Cu是635还是64，应按卷首提供的用。

18、计算题中往往出现“将样品分为两等份”(或“从1000mL溶液中取出50mL”)，最后求的是“原样品中的有关的量”，你却只求了每份中的有关量。

19、化学计算常犯错误如下：

①分子式写错

②化学方程式写错或不配平或配平有错

③用关系式计算时，物质的量关系式不对，以上情况发生，全扣分

④分子量算错

⑤讨论题，缺讨论过程，扣相当多的分

⑥给出两种反应的量，不考虑一反应物过量(要有判断过程)⑦要求写出计算规范过程：解、设未知量、方程式或关系式，计算比例关系、比例式主要计算过程、答、单位、有的题目还要写出推理过程，不要省略步骤，计算过程要带单位。注意题中对有效数字的隐性要求。

20、遇到做过的类似题，一定不要得意忘形，结果反而出错，一样要镇静、认真解答，不要思维定势；碰到难题决不能一下子“蒙”了，要知道，机会是均等的，要难大家都难，应注意的是，难度大的试题中也有易得分的小题你应该得到这分。

21、解题时，切莫在某一个“较难”或“难”的考题上花去大量的宝贵时间，一个10分左右的难题，用了30多分钟甚至更多时间去考虑，非常不合算，不合理。如果你觉得考虑了几分钟后还是无多少头绪，请不要紧张、心慌，暂把它放在一边，控制好心态，去解答其他能够得分的考题，先把能解决的考题先解决。再回过头来解决它，找到了感觉，思维活跃了，很可能一下子就想通了，解决了。

化学计算的七大秘诀及例题解析

1关系式法

所谓关系式法，就是根据化学概念、物质组成、化学反应方程式中有关物质的有关数量之间的关系，建立起已知和未知之间的关系式，然后根据关系式进行计算。利用关系式的解题，可使运算过程大为简化。

其中包括守恒法。所谓“守恒”就是以化学反应过程中存在的某些守恒关系如质量守恒、元素守恒、得失电子守恒，电荷守恒等。运用守恒法解题可避免在纷纭复杂的解题背景中寻找关系式，提高解题的准确度。

例题解析将纯铁丝521g溶于过量稀盐酸中，在加热条件下，用253gKNO3去氧化溶液中Fe2＋，待反应后剩余的Fe2＋离子尚需12mL03mol/LKMnO4溶液才能完全氧化，则KNO3被还原后的产物为（）A、N2B、NO

C、NO2D、NH4NO3

解析：根据氧化还原反应中得失电子的总数相等，Fe2＋变为Fe3＋失去电子的总数等于NO3－和MnO4－

得电子的总数

设n为KNO3的还原产物中N的化合价，则

(521g÷56g/moL)×(3－2)=0012L×03mol/L×(7－2)＋(253g÷101g/mol)×(5－n)解得n=3故KNO3的还原产物为NO。

答案：B

2方程或方程组法

根据质量守恒和比例关系，依据题设条件设立未知数，列方程或方程组求解，是化学计算中最常用的方法，其解题技能也是最重要的计算技能。

3守恒法

人们是为着美而生活在真理和自由之中，谁能更虚怀若谷地拥抱世界，谁更深切地热爱世界，谁说是最优秀的；谁是最自由的，谁也就是最优秀的，在他们身上，才会有最大的美。

例题解析将521g纯铁粉溶于适量稀H2SO4中，加热条件下，用253gKNO3氧化Fe2+，充分反应后还需0009molCl2才能完全氧化Fe2+，则KNO3的还原产物氮元素的化合价为：

解析：0093＝0025x＋0018，x＝3，5－3＝2。应填：+2。（得失电子守恒）

4差量法

找出化学反应前后某种差量和造成这种差量的实质及其关系，列出比例式求解的方法，即为差量法。其差量可以是质量差、气体体积差、压强差等。

差量法的实质是根据化学方程式计算的巧用。它最大的优点是：只要找出差量，就可求出各反应物消耗的量或各生成物生成的量。

5平均值法

平均值法是巧解混合问题的一种常见的有效方法。

平均值法规律：混合物的平均相对分子质量、元素的质量分数、平均相对原子质量、生成的某指定物质的量总是介于组份的相应量的最大值和最小值之间。

解题方法：解题时首先计算平均分子式或平均相对原子质量，再用十字交叉法计算出各成分的物质的量之比。

例题解析由锌、铁、铝、镁四种金属中的两种组成的混合物10g与足量的盐酸反应产生的氢气在标准状况下为112L，则混合物中一定含有的金属是（）

A．锌B．铁

C．铝D．镁

解析：各金属跟盐酸反应的关系式分别为：

Zn—H2↑Fe—H2↑

2Al—3H2↑Mg—H2↑

若单独跟足量盐酸反应，生成112LH2（标准状况）需各金属质量分别为：Zn∶325g；Fe∶28g；Al∶9g；Mg∶12g。其中只有铝的质量小于10g，其余均大于10g，说明必含有的金属是铝。

答案：C

6极值法

巧用数学极限知识进行化学计算的方法，即为极值法。

例题解析4个同学同时分析一个由KCl和KBr组成的混合物，他们各取200克样品配成水溶液，加入足够HNO3后再加入适量AgNO3溶液，待沉淀完全后过滤得到干燥的卤化银沉淀的质量如下列四个选项所示，其中数据合理的是（）A306gB336g

C366gD396

解析：本题如按通常解法，混合物中含KCl和KBr，可以有无限多种组成方式，则求出的数据也有多种可能性，要验证数据是否合理，必须将四个选项代入，看是否有解，也就相当于要做四题的计算题，所花时间非常多。使用极限法，设200克全部为KCl，根据KCl-AgCl，每745克KCl可生成1435克AgCl，则可得沉淀为(200/745) 1435=3852克，为最大值，同样可求得当混合物全部为KBr时，每119克的KBr可得沉淀188克，所以应得沉淀为(200/119) 188=3160克，为最小值,则介于两者之间的数值就符合要求，故只能选B和C。

答案：BC

7讨论法

讨论法是一种发现思维的方法。解计算题时，若题设条件充分，则可直接计算求解；若题设条件不充分，则需采用讨论的方法，计算加推理，将题解出。

例题解析在30mL量筒中充满NO2和O2的混合气体，倒立于水中使气体充分反应，最后剩余5mL气体，求原混合气中氧气的体积是多少毫升？

解析：最后5mL气体可能是O2，也可能是NO，此题需用讨论法解析。

解法1：最后剩余5mL气体可能是O2；也可能是NO，若是NO，则说明NO2过量15mL。

设30mL原混合气中含NO2、O2的体积分别为x、y

4NO2+O2+2H2O=4HNO3

原混合气体中氧气的体积可能是10mL或3mL。

解法2：设原混合气中氧气的体积为y（mL）

①设O2过量：根据4NO2+O2+2H2O=4HNO3，则O2得电子数等于NO2失电子数。（y-5）×4=（30-y）×1解得y=10（mL）②若NO2过量：4NO2+O2+2H2O=4HNO34yy

3NO2+H2O=2HNO3+NO

因为在全部（30-y）mLNO2中，有5mLNO2得电子转变为NO，其余（30-y-5）mLNO2都失电子转变为HNO3。

O2得电子数+（NO2→NO）时得电子数等于（NO2→HNO3）时失电子数。

总结

以上逐一介绍了一些主要的化学技巧。解题没有一成不变的方法模式。但从解决化学问题的基本步骤看，大家应建立一定的基本思维模式。它还反映了解题的基本能力要求，所以有人称之为解题的“能力公式”。希望同学们建立解题的基本思维模式，深化基础，活化思维，优化素质，跳起来摘取智慧的果实。

聆听并总结以下进行化学计算的基本步骤：

（1）认真审题，挖掘题示信息。

（2）灵活组合，运用基础知识。

（3）充分思维，形成解题思路。

（4）选择方法，正确将题解出。

考试前最后几天应做的事

1、回顾错题，想想如何在考试中避免类似错误。

2、回看课本，多看看平时复习未作重点的复习的部分知识，如蛋白质、胶体、新材料等。

3、手写一遍重点化学方程式，还有离子方程式、重点物质的电离方程式、水解方程式、热化学方程式、电解方程式、结构式、电子式，这些都是Ⅱ卷书写的重点，要保证不出错。

4、把考试不该犯的错误写下来，如“名称”写成化学式，结构式写成电子式，离子方程式写成水解方程式等，在高考前多看几遍，提醒自己考场上不应犯同样的错误。

5、休息好，调整好考试心态，要充满自信、细心审题、大胆推理、认真书写，保证该拿的分都拿到手，考出自己理想的成绩来。

高中化学个人 教学总结

转眼间，一学期就要过去了，在担任化学学科教学工作的半年来，坚持 爱岗敬业 ，以培养学生创新精神和实践能力为重点，深化课堂教学改革，认真落实课程计划，落实教学常规，落实教学改革 措施 ，大力推进素养 教育 ，使所任班级教学质量有所提高，现将半年来工作情况总结如下：

一、提高思想认识，树立新的理念。

围绕学习新课程，构建新课程，尝试新教法的目标，不断更新教学观念。注重把学习新课程标准与构建新理念有机结合。

二、教学工作是学校各项工作的中心，也是检验一个教师工作成败的关键。

半年来，在坚持抓好新课程理念学习和应用的同时，我积极探究教育教学规律，充分运用学校现有的教育教学资源，大胆改革课堂教学，加大新型 教学方法 使用力度，具体表现为：

(一) 发挥学生为主体、教师为主导的作用

1、备课深入细致。

根据要求，提前两周备好课，写好学校规定的标准的教案。平时做到周前备课。备课时认真钻研教材，教参、学习好大纲，虚心向其他老师学习请教。力求吃透教材，找准重点难点。为了上好一节课，我经常的上网查阅资料，集中别人的优点确定自己的教学思路，时常和有 经验 的教师研究教学环节。为了学生能更直观地感受所学的知识内容，我积极的制作多媒体课件，重点内容用电脑打在屏幕上，使学生有个清晰的知识脉络。

2、注重课堂教学效果。针对学生特点，以愉快式教学为主，不搞满堂灌，坚持学生为主体，教师为主导、教学为主线，注重讲练结合。在教学中注意抓住重点，突破难点，可以做到因材施教，教学方法受到学生的喜爱。学生积极的回答问题，能够和学生积极的融合在一起，教学的任务顺利完成，学生的学习效果比较的理想。

3、在作业批改上，认真及时，力求做到全批全改，对存在的问题进行集中的讲解。依据学生的自身情况，有区别的书写评语，使学生在评语中可以知道自己的不足，以便在辅导中做到有的放矢。

(二) 做好后进生转化工作

作为教师，应该明白任何学生都会存在优点和缺点两方面，对优生的优点是显而易见的，对后进生则易于发现其缺点，尤其是在学习上后进的学生，往往得不到老师的肯定，而后进生转化成功与否，直接影响着学生的整体成绩。

1、用发展的观点看学生。应当纵向地看到：后进生的今天比他的昨天好，即使不然，也应相信他的明天会比今天好。因势利导，化消极因素为积极因素。首先帮助后进生找到优、缺点，以发扬优点，克服缺点。其次以平常的心态对待：后进生也是学生，厌恶、责骂只能适得其反，他们应该享有同其它学生同样的平等和民主，也应该在稍有一点进步时得到老师的肯定。

2、真正做到晓之以理，动之以情。首先做到" 真诚" 二字，即教师不应有丝毫虚伪与欺哄，一旦学生发现" 有假" ，那么教师所做的一切都会被看作是在" 演戏" 。其次做到" 接受" ，即能感受后进生在学习过程中的各种心理表现和看法，如对学习的畏惧、犹豫、满足、冷漠，错误的想法和指责等，信任他们，鼓励他们自由讨论。最后做到" 理解" 二字，即通过学生的眼睛看事物。

三、努力方向

1、加强自身基本功的训练，课堂上做到精讲精练，注重对学生能力的培养，多加一些开放的试题的练习。多向老教师 学习经验 。

2、对差生多些关心，多点爱心，再多一些耐心，使他们在各方面都有更大进步。对学生加强教育，教会学生如何的做人，如何的尊敬同学，老师和家长。

3、采用多种教学手段吸引学生的注意，提高学生的学习的兴趣，增强主人翁意识和责任感。在教学上下功夫，努力使班级学生的成绩在原有的基础上有更大的进步。

教育工作，是一项常做常新，永无止境的工作。一份耕耘，一份收获，在教书育人的道路上付出的是辛勤的汗水和真挚的泪水, 然而收获的却是一份份沉甸甸的情感。用心去教诲学生, 用情去培育学生，无愧于心，无悔于我的教育事业。新的一年，我会继续努力，春华秋实，和学生一起收获更多的美好!

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分子对接的基本原理就是把配体分子放在受体活性位点的位置，然后按照几何互补和能量互补的原则来实时评价配体与受体相互作用的优劣，最终找到这两个分子之间最佳的结合模式。

分子对接分为刚性、半柔性和柔性对接。不同的对接软件又可以分为：商业软件和学术软件，而分子对接的计算结果，则体现为打分函数的不同。目前用的比较多的分子对接软件有：AutoDock、AutoDock Vina、LeDock、rDock，这些都是学术软件；商业软件有：Glide、GOLD、MOE Dock、Surflex-Dock、LigandFit、FlexX等等。

做分子对接，一般对接的分子量都很大，到底有多大？就是很大！

我来举个例子，通常分子对接的采样，都是百万到千万级别的分子

而事实上可用于药物发现的有机分子有多少？

超过10的60次方！

我们取的只是沧海一粟罢了。

这么大的对接量，对算力的需求肯定少不了呀！

那怎么办呢？

具体，我以AutoDock-Vina分子对接为例。

AutoDock-Vina 是用于分子对接和虚拟筛选的开源程序，由Scripps研究所分子图形实验室的Oleg Trott博士设计和实现，是目前使用最为广泛的分子对接软件之一。此外，Vina可以利用系统上的多个CPU或CPU内核来显著缩短运行时间；北鲲云超算平台提供了丰富的cpu,gpu资源，此次教程以STAT3靶点的晶体结构与其原配体为例进行分子对接的详细步骤说明，就在北鲲云上演示。

准备工作

蛋白晶体结构由PDB数据库（>

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