怎么能查出某个动物的基因组被测序过

怎么能查出某个动物的基因组被测序过,第1张

查询基因组数据库。

目前全球有多个基因数据库,比如NCBI、Ensembl、UCSC、DDBJ等。在这些数据库中,可以查询到已经发布的各种物种的基因组信息,如果某种动物的基因组已经被测序过并且被发布到数据库中,就可以在这些数据库中找到相关信息。

一些著名的科研机构(比如美国人类基因组计划、欧洲生物信息研究所等)在官网上经常发布各种动植物的基因组测序信息。

玉米10条染色体长度教程:

1、打开玉米数据库(>

答:可以通过基因组浏览器,比如UCSC Genome Browser、Ensembl、NCBI Genome等,查找基因的基本信息,如基因名称、基因结构、基因功能等,以此作为比较的依据,找出不同数据库中同一基因的不同名称。此外,还可以利用基因数据库之间的比对工具,比如BLAST,对基因序列进行比对,从而找出不同数据库中同一基因的不同名称。另外,也可以利用基因注释工具,比如InterProScan,对基因序列进行注释,以此作为比较的依据,找出不同数据库中同一基因的不同名称。

本人自大三就开始做生物信息,现在即将读博士,希望我的经验可以帮助到你。

既然你是想做生物信息学,那么相关背景什么的会了解一些,我在这就不多说了。

首先,确定你自己的背景专业,现在很多学校本科都没有专门的生物信息学专业,都是挂靠在生命学院或者计算机学院的。所以背景专业一般都是生物学或计算机学,不同的专业将来做生信区别会很大。当然,做什么方向和背景专业并没有绝对关系。

如果是生物学背景,那么将来大部分的工作将会是使用专门的生物信息学分析软件。所以难度会降低。自学的话,主要学几下几点就好:

1、一门脚本语言,个人推荐Python(Perl也可以,各有利弊,Python更新兴一些)。

2、Linux系统。这个也不是百分百要求,但是专业的生信人,都是用Linux的,而且很多软件都是不支持Windows的。

3、常用的生物信息学数据库,这里列出几个,NCBI,Ensembl,EBI,GENEbank等等,这些数据库下面还分子数据库,像GEO,GWAS catalog等。当然,还有方向更细的,像miRBase(miRNA数据库)等。

4、R,这也是一种编程语言,但更加侧重结果的展示,实际上也就是画图。

5、常用生信分析软件,这个没必要专门去学,需要用到他们的时候再学也不晚,都是很简单的东西。

如果是计算机背景,那么以后的工作可能主要是算法分析,创造新的生信分析软件,做数据库等。需要自学的就是以上的那些,再加一门工程语言,C,C++,C#,Java都可以。

esembl的数据每周会和ncbi交换的,过一段时间再看看。不过点开每个剪切子应该可以看到有引用文献出处的就是有证据的转录子,没有的话就是预测的。两个数据库有时会有些出入。要想证明到底是否存在,那么最好的办法是自己做一下rt-pcr

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