总结蛋白质序列数据库演变的过程

蛋白质序列数据库指应用计算机功能分析生物学信息的数据库。应用计算机的运算法则，比较DNA和蛋白质序列而检测结构、功能和序列之间的进化关系。

各种基因组的序列产生大量的DNA序列数据和生物信息，已经被应用于研究基因的功能，预测以前未知的基因功能。现在人们的注意力主要集中在从仅有的氨基酸序列预测蛋白质结构和功能。

历史追溯：

由于蛋白质序列测定技术先于DNA序列测定技术问世，蛋白质序列的搜集也早于DNA序列。蛋白质序列数据库的雏形可以追溯到60年代。60年代中期到80年代初，美国国家生物医学研究基金会(National Biomedical Research Foundation，简称NBRF)。

Dayhoff领导的研究组将搜集到的蛋白质序列和结构信息以“蛋白质序列和结构地图集”(Atlas of Protein Sequence and Structure)的形式发表，主要用来研究蛋白质的进化关系。1984年，“蛋白质信息资源”(Protein Information Resource，简称PIR)计划正式启动。

蛋白质序列数据库PIR也因此而诞生。与核酸序列数据库的国际合作相呼应，1988年，美国的NBRF、日本的国际蛋白质信息数据库(Japanese International Protein Information Database，简称JIPID)。

德国的慕尼黑蛋白质序列信息中心(Munich Information Center for Protein Sequences，简称MIPS)合作成立了国际蛋白质信息中心(PIR-International)，共同收集和维护蛋白质序列数据库PIR，[Barker等, 2000]。

据《科学》杂志发布的一项研究，研究人员将身体血液中的数千种蛋白质与基因紧密结合，绘制了蛋白质，基因组与人们疾病的关系图，表明了影响这种蛋白质的基因遗传差别如何把各种疾病联络在一起。根据建立基因蛋白质，科学家们发现了不一样人类疾病间的数百种新联络。蛋白质常见故障会造成部分器官疾病，蛋白质也是当下最普遍的中药靶标。

在此项研究中，由剑桥大学研究委员会临床流行病学单位和德国查理大学柏林卫生科学家领导干部的世界精英团队，运用1万余人的血液样板，证实了人们基因组2500个地区的自然基因变异与体液中循环系统的5000种蛋白质的进化速度或作用差别息息相关。尽管人们基因组研究早已在身体DNA序列中明确了数千个与疾病有关的基因变异，但因为将这种基因变异投射到基因的可变性，其潜在体质通常仍不为人知。

根据将这些与疾病有关的DNA基因变异与编号蛋白质的进化速率或作用联络起来，研究精英团队为什么基因参加在其中给予了证据，并明确了蛋白质将基因遗传风险转换为疾病发病的聘用制。多种基因组关系研究（GWAS）已将人们基因组中称之为KAT8的地区与阿尔茨海默病联系起来，但无法明确该地域中的哪一个基因参加在其中。根据融合蛋白质和基因的数据，精英团队在KAT8地区中鉴别出一个名叫PRSS8的基因，这也是阿尔茨海默病的新备选基因。

他们还明确了一种新的卵巢癌风险基因。研究精英团队运用这种新看法，检测了什么蛋白质编号基因会影响疾病。他们发现了1800个例子，给予了强大的证据说明相对应的蛋白质恰好发源，并强调了新的潜在的治疗对策。研究人员表明，对大部分与疾病风险有关的基因组地区，潜在的因果关系和体制尚不清楚。此项工作单位证明了蛋白质在变大疾病发病基因层面的与众不同价值，并协助人们掌握遗传变异造成疾病的体制。根据编号蛋白质将基因与疾病更可以联络起来，并将推动药品靶标的迅速鉴别。

若蛋白质的折叠发生错误，即蛋白质的构象发生改变，常形成抗蛋白水解酶的淀粉样纤维沉淀，产生毒性而致病，表现为蛋白质淀粉样纤维沉淀的病理改变，这类疾病称为蛋白质构象病，包括：人文状体脊髓变性病、老年痴呆症、亨廷顿舞蹈病、疯牛病等。

有关系的！

蛋白检测又叫蛋白质芯片检测，主要是通过蛋白质的微阵列分析进行健康检测，人体离不开蛋白质，新陈代谢都会在蛋白质上得到体现，特别是一些重大疾病的体现。

蛋白芯片检测可以提早检测蛋白质的变化，对重大疾病做出预警，提早干预，可以预防重大疾病的发生，对于已发生的疾病，蛋白芯片检测可以反馈治疗前后的效果，对于疾病治疗过程中的用药及预后都有重大的指导作用。

蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的。为适应结构基因组和生物信息学研究的需要，1998年10月由美国国家科学基金委员会、能源部和卫生研究院资助，成立了结构生物学合作研究协会(Research Collaboratory for Structural Bioinformat-ics,简称RCSB)。PDB数据库改由RCSB管理，目前主要成员为拉特格斯大学(Rutgers University)、圣地亚哥超级计算中心(San Diego Supercomputer Cen-ter,简称SDSC)和国家标准化研究所(National Insti-tutes of Standards andTechnology,简称NIST)。和核酸序列数据库一样，可以通过网络直接向PDB数据库提交数据。

由于蛋白质序列测定技术先于DNA序列测定技术问世，蛋白质序列的搜集也早于DNA序列。蛋白质序列数据库的雏形可以追溯到60年代。60年代中期到80年代初，美国国家生物医学研究基金会(National Biomedical Research Foundation，简称NBRF)Dayhoff领导的研究组将搜集到的蛋白质序列和结构信息以“蛋白质序列和结构地图集”(Atlas of Protein Sequence and Structure)的形式发表，主要用来研究蛋白质的进化关系。1984年，“蛋白质信息资源”(Protein Information Resource，简称PIR)计划正式启动，蛋白质序列数据库PIR也因此而诞生。与核酸序列数据库的国际合作相呼应，1988年，美国的NBRF、日本的国际蛋白质信息数据库(Japanese International Protein Information Database，简称JIPID)和德国的慕尼黑蛋白质序列信息中心(Munich Information Center for Protein Sequences，简称MIPS)合作成立了国际蛋白质信息中心(PIR-International)，共同收集和维护蛋白质序列数据库PIR，[Barker等, 2000]。

随着对circRNA研究的越来越多，已知的circRNA数据信息在快速增长，在这里我们肽度时界（timedoo）整理了当前circRNA相关的数据库列表，希望能帮到您：

1circBase[1]，是一个通过收集和整合已经发布的circRNA数据构建的数据库。目前该数据库收集包括以下6个物种的circRNA信息：人 (hg19)、小鼠(mm9) 、秀丽线虫(ce6)、黑腹果蝇 (dm3)、矛尾鱼 (latCha1)、腔棘鱼 (latCha1)。该数据库最新版本发布时间为2014年1月。网址：>

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