EST是Expressed Sequence Tag的缩写,意思是表达序列标签,指从一个随机选择的cDNA 克隆,进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列。
EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp。
EST 来源于一定环境下一个组织总mRNA 所构建的cDNA 文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。
扩展资料
EST的作用表现在:
1、 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱;
2、作为探针用于放射性杂交
3、 用于定位克隆;
4、借以寻找新的基因
5、作为分子标记;
6、 用于研究生物群体多态性。
参考资料来源:百度百科-EST
选择开始菜单中→程序→【Management SQL Server 2008】→【SQL Server Management Studio】命令,打开【SQL Server Management Studio】窗口,并使用Windows或 SQL Server身份验证建立连接。在【对象资源管理器】窗口中展开服务器,然后选择【数据库】节点
右键单击【数据库】节点,从d出来的快捷菜单中选择【新建数据库】命令。
执行上述 *** 作后,会d出【新建数据库】对话框。在对话框、左侧有3个选项,分别是【常规】、【选项】和【文件组】。完成这三个选项中的设置会后,就完成了数据库的创建工作,
在【数据库名称】文本框中输入要新建数据库的名称。例如,这里以“新建的数据库”。
在【所有者】文本框中输入新建数据库的所有者,如sa。根据数据库的使用情况,选择启用或者禁用【使用全文索引】复选框。
在【数据库文件】列表中包括两行,一行是数据库文件,而另一行是日记文件。通过单击下面的【添加】、【删除】按钮添加或删除数据库文件。
切换到【选项页】、在这里可以设置数据库的排序规则、恢复模式、兼容级别和其他属性。
切换到【文件组】页,在这里可以添加或删除文件组。
完成以上 *** 作后,单击【确定】按钮关闭【新建数据库】对话框。至此“新建的数据”数据库创建成功。新建的数据库可以再【对象资源管理器】窗口看到。
UniGene试图通过计算机程序对GeneBank中的序列数据进行适当处理,剔除冗余部分,将同一基因的序列,包括EST序列片段搜集到一起,以便研究基因的转录图谱。UniGene除了包括人的基因外,也包括小鼠、大鼠等其它模式生物的基因,HGI数据库只包括人的基因。该数据库的标题行(TITLE)给出基因的名称和简单说明,表达部位行(EXPRESS)指出该基因在什么组织中表达以及在基因图谱中的位置等。此外,列出该基因在核酸序列数据库GenBank或EMBL和蛋白质序列数据库SWISS-PROT中的编号的超文本链接。UniGene中部分条目包括已知基因序列,而有些条目则仅有新测得的EST序列片段。这就意味着,这些EST序列所对应的基因尚未搞清,可以用来发现新基因。在描绘基因图谱及大规模基因表达分析等研究中,UniGene也可以帮助实验设计者选择试剂。总言之,UniGene参考了转录组、基因组的信息,通过多次循环聚类,整合尽可能多的数据,NCBI对UniGene按物种进行定期的更新,发布新的版本,另外也可以通过SRS系统访问。[1]欢迎分享,转载请注明来源:内存溢出
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