如何用Brenda查酶的标准编号

如何用Brenda查酶的标准编号,第1张

在搜索框里输入酶的名称,下面的类型可以选“enzyme, ligand ”或“enzyme names(synonyms)”均可。点击start search 或回车,在候选结果里即可看到编号。

长链脂肪酸本身对柠檬酸合酶应该没有抑制作用,应该是脂肪酸氧化代谢产生的NADH、α-酮戊二酸、ATP抑制了柠檬酸合酶。但是从这点来说,不管是长链脂肪酸、糖类都可以产生该作用。

个人意见仅供参考

生糖氨基酸是非必需氨基酸吗?通过乙酰辅酶A进入三羧酸循环的氨基酸有10个,具体又分为两组。丙氨酸、丝氨酸、苏氨酸、甘氨酸半胱氨酸通过丙酮酸生成乙酰辅酶A,苯丙氨酸、酪氨酸、亮氨酸、赖氨酸和色氨酸通过乙酰乙酰辅酶A生成乙酰辅酶A。

属于丙酮酸途径的是5个结构简单的氨基酸,所以反应也相对简单。丙氨酸通过转氨即可生成丙酮酸。苏氨酸的主要降解途径是琥珀酰辅酶A途径,次要途径是被苏氨酸醛缩酶(threonine aldolase)裂解成甘氨酸和乙醛,乙醛可氧化成乙酸再生成乙酰辅酶A。

苏氨酸醛缩酶反应。引自BRENDA

丝氨酸可以脱水脱氨生成丙酮酸,由脱水酶催化。不过人类的丝氨酸/苏氨酸脱水酶缺乏此活性,所以主要靠丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)催化,转变为甘氨酸和亚甲基四氢叶酸。此反应也是甘氨酸的主要合成途径,并且是可逆的。

丝氨酸与甘氨酸的相互转化。引自themedicalbiochemistrypage

所以甘氨酸虽小,却成为一个代谢节点。它的代谢有多种方向,除转变为丝氨酸外,其降解途径也不唯一。主要途径是作为一碳单位供体,由甘氨酸裂解酶复合物(glycine cleavage complex,GCC)催化脱羧,生成亚甲基四氢叶酸和二氧化碳及氨。所以GCC也称为甘氨酸脱羧酶。

甘氨酸的裂解。引自themedicalbiochemistrypage

甘氨酸降解的次要途径是氧化脱氨生成乙醛酸,再氧化成甲酸或草酸。甘氨酸是个多能分子,可参与谷胱甘肽、肌酸、胆碱、嘌呤、卟啉的合成,还可作为抑制性神经递质。其受体GlyR是一种配体门控氯离子通道。

半胱氨酸代谢需要脱硫,具体有两种机制。一种是由半胱氨酸脱硫酶(cysteine desulfurase)催化脱硫反应,直接生成丙氨酸。此酶由NFS1基因编码,硫的受体是一些具有铁硫簇的酶。

半胱氨酸脱硫反应。引自BRENDA

另一种机制是由半胱氨酸双加氧酶(CDO)催化,氧化成半胱氨酸亚磺酸。后者是牛磺酸(Taurine,Tau)前体,牛磺酸不仅参与消化,还是重要的抗氧化剂,参与多种生理功能,从发育到细胞保护和多种疾病。

牛磺酸在骨骼肌中的作用。引自J Transl Med. 2015 Jul 2513:243.

现在有很多能量饮料和保健品添加牛磺酸,但牛磺酸摄入并非多多益善。有研究指出,现有证据不能支持有关提高心理或身体机能的营销宣传,长期摄入高剂量可能会给青少年带来不适,比如认知能力下降,酒精损害增加等(Birth Defects Res. 2017 Dec 1109(20): 1640–1648.)


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