在添加数据之前，您需要新建一个名字空间，具体过程如下：
① 使用IE浏览器进入http://localhost:8080/geoserver/页面。
② 点击“配置”，并输入之前您设置的用户名和密码登陆。
③ 再点击“数据”、“名字空间”、“新建”。
④ 输入“前缀”，即名字空间的名字。
⑤ 输入url，例如可以输入贵公司的网址。（前缀和url在今后的客户端xml配置中需要用到）。
⑥ 按下窗口左侧的“应用”、“保存”两个按钮。
如何添加shapefile类型数据到geoserver？
① 首先将××.shp ××.shx ××.dbf文件放入geoserver\data\data文件夹中。
② 使用IE浏览器进入http://localhost:8080/geoserver/页面。
③ 点击“配置”，并输入之前您设置的用户名和密码登陆。
④ 再点击“数据”、“数据库”、“新建”，Feature数据描述选择Shapefile，Feature数据集 ID输入这个shapefile数据源的名称。
⑤ 之后出现“Feature数据集编辑器”界面，名字空间选择您之前设置的名字空间，url中输入file:data/×××.shp，charset输入GB2312。按下“提交”按钮。
⑥ 按下窗口左侧的“应用”、“保存”两个按钮。
⑦ 点击“配置”、“数据”、“FeatureTypes”、“新建”。FeatureType名选择×××:::×××，×××为您上面输入的Feature数据集 ID，按下“新建”按钮。
⑧ 之后出现“FeatureType 编辑器”界面，样式选择一个您设定的样式（样式如何制作在后面将详细介绍）。SRS（空间引用系统）输入数据的坐标系，如果为WGS84那么就输入4326。按下边界盒状模型旁边的“生成”按钮，即可自动生成改shapefile的范围，您可以手动修改这些值。按下页面最下方的“提交”按钮。
⑨ 按下窗口左侧的“应用”、“保存”两个按钮。
在添加postgis数据到geoserver之前，您需要将数据导入到postgis数据库中，如何将shapefile数据导入postgis数据库？ *** 作如下：
① 生成sql脚本。使用shp2pgsql程序生成shp文件对应的sql脚本。假定PostgreSQL安装路径为默认，那么单击windows开始菜单、运行、输入cmd、回车。输入命令行"C:\Program Files\PostgreSQL\8.3\bin\shp2pgsql" -W "GBK" D:\×××.shp ××× >D:\×××.sql 其中×××为shp文件名，盘符根据你shp文件所在位置设置。
② 运行步骤1生成的sql脚本，导入数据到数据库。使用psql程序运行脚本。假定PostgreSQL安装路径为默认，那么单击windows开始菜单、运行、输入cmd、回车。输入命令行"C:\Program Files\PostgreSQL\8.3\bin\psql" -d postgis -f D:\×××.sql postgres 其中×××为sql脚本文件名，postgis为数据库名。之后提示您输入数据库密码，输入密码之后，按下回车，自动将数据导入数据库。
如何添加postgis数据到geoserver？
① 使用IE浏览器进入http://localhost:8080/geoserver/页面。
② 点击“配置”，并输入之前您设置的用户名和密码登陆。
③ 再点击“数据”、“数据库”、“新建”，Feature数据描述选择Postgis，Feature数据集 ID输入这个postgis数据源的名称。
④ 之后出现“Feature数据集编辑器”界面，名字空间选择您之前设置的名字空间，host输入Postgis数据库所在服务器的ip地址，如果是本机，那就输入localhost，port输入postgis数据库的端口，默认为5432，database输入postgis数据库的名称，一般为postgis，这取决与您安装postgis时设定的名字。user输入默认的postgres。passwd输入密码。按下“提交”按钮。
⑤ 按下窗口左侧的“应用”、“保存”两个按钮。
⑥ 点击“配置”、“数据”、“FeatureTypes”、“新建”。FeatureType名选择AAA:::BBB，其中AAA为您上面输入的Feature数据集 ID，BBB为postgis数据库中的一个表的名字，这个表应该是您之前导入的。
⑦ 之后出现“FeatureType 编辑器”界面，样式选择一个您设定的样式（样式如何制作在后面将详细介绍）。SRS（空间引用系统）输入数据的坐标系，如果为WGS84那么就输入4326。按下边界盒状模型旁边的“生成”按钮，即可自动生成改shapefile的范围，您可以手动修改这些值。按下页面最下方的“提交”按钮。
⑧ 按下窗口左侧的“应用”、“保存”两个按钮。
生物通报道：长非编码RNA（lncRNA）长达两百个核苷酸以上的转录本，但并不编码任何蛋白质。尽管如此，长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性，说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA（也称lincRNA）位于细胞核，它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠，有的位于基因间或者内含子中。为何细胞不惜耗费能量对这些非编码RNA的表达和定位进行严格调控呢？这些RNA分子究竟有何功能？RNA测序技术的发展使人们得以初窥这一神秘的分子，现在lncRNA的许多相关信息都可以在新数据库中查到，例如Broad研究所、哈佛大学和麻省理工共同开发的Human Body Map lincRNAs catalog。不过现在人们了解到的lncRNA只是冰山一角，还有大量lncRNA的功能有待科学家们去探寻。
lncRNA研究工具
现在lncRNA研究面临的一个主要挑战是，研究工具还在不断开发和改进中，其中包括设计带有不同lncRNA检测探针的芯片。安捷伦公司的SurePrint G3 Gene Expression v2 microarray就是其中之一，该芯片的探针设计不仅参照主要公共数据库中的mRNA，还参照了Broad研究所开发的lincRNA和TUCP（transcripts of uncertain coding potential）数据库，可以同时检测编码RNA和非编码RNA。据安捷伦公司基因表达产品经理Corinna Nunn介绍，lncRNA的表达水平比编码RNA低，“因此芯片的动态范围宽很重要，这样才能够保证检测到表达水平较低的基因。”
Affymetrix也推出了新版人类全转录本表达谱芯片GeneChip® Gene 2.0 ST Arrays，能够在一张芯片上同时检测mRNA和lincRNA。该芯片的设计结合了多个数据库资源，包括RefSeq、Ensemble、Broad研究所的Human Body Map lincRNAs和TUCP catalog。 “我们的超高密度芯片具有独特的探针，能够检测每个转录本各外显子上的多个位点，确保最大程度的捕捉相关生物学信息，” Affymetrix公司的Tsetska Takova说。生物通 www.ebiotrade.com
Arraystar公司自2009年就开始设计lncRNA芯片，近日该公司刚刚发布了可同时检测mRNA和lncRNA的的第三代lncRNA芯片Human LncRNA Microarray V3.0。Arraystar的技术支持专员Ed Davis介绍说，表达谱往往是研究lncRNA的第一步，不过开发lncRNA表达芯片仍然比较复杂，其中多个lncRNA数据库并存就是一个复杂因素。“为此，我们将公共数据库与重要lncRNA论文中的信息结合起来，建立了一个可靠的综合性lncRNA数据库，” Davis说。此外设计lncRNA探针也并不容易，因为lncRNA常常与附近的蛋白质编码基因重叠。Davis介绍道，“传统芯片探针是‘基因特异性的’，换句话说就是探针靶标转录本的3’端，因此无法区分转录起始位点或剪切方式可变所形成的多种转录本。但Arraystar的探针是‘转录本特异性的’，能够靶标外显子和剪接点，检测到单个基因的不同转录本。”
lncRNA的功能
阐明lncRNA的功能并不容易，Davis介绍道“与microRNA不同， lncRNA能通过多种机制起作用，而且很难依据其序列来推断其功能。” 据Affymetrix公司Takova称，实际上目前已知功能的lncRNA还不足1%。然而，越来越多的研究显示lncRNA在细胞正常分化和肿瘤发生中都具有重要作用。随着人们渐渐了解到正常和疾病状态下非编码RNA的差异，科学家们认为可以将非编码RNA作为生物指标进行疾病诊断和预测。
如何开展lncRNA功能研究呢？专家们介绍，除了表达谱研究以外，与特定lncRNA相关的蛋白编码基因也能够提供lncRNA功能的宝贵信息。Illumina公司RNA和表观遗传学市场经理Chris Streck也认为比起只研究编码RNA，分析整个转录组无疑更有价值。他指出，在ENCODE（DNA元件百科全书）计划的推动下，研究人员现在更注重综合性研究，包括RNA、DNA及调控功能等多个方面，其中非编码RNA的作用日益凸显。（ENCODE项目的目标是在人类基因组中确定所有转录区域、转录因子关联、染色质结构和组蛋白修饰。）生物通 www.ebiotrade.com
BC Cancer Agency的博后Ewan Gibb（Wan Lam实验室）正在研究lncRNA在疾病中的作用。“尽管不少lncRNA都已经有基因组注释了，但大多数lncRNA的功能仍然缺乏证据，” Gibb说。“我很肯定有成千上万的lncRNA都是功能性的，但我们仍需注意，普遍性转录并不意味着具有普遍性的功能。从转录谱着手深入阐明lncRNA的功能是至关重要的。”例如，罗马Sapienza大学的研究团队就阐述了一个lncRNA的功能，它作为内源性的竞争RNA控制着肌肉分化。Gibb指出，lncRNA研究的另一项挑战是找到lncRNA结构与其功能之间的关联。“有研究指出，lncRNA的结构以域为基础，这有点类似于蛋白质编码基因，”他说，“但这种组织形式如何形成，lncRNA的结构与其功能又有何关联，还有待进一步研究。”
在癌症等疾病中的作用
有一点很明确，lncRNA在疾病中有重要作用。lncRNA如何对疾病进程产生强烈影响呢？安捷伦公司资深科学家Anne Bergstrom Lucas介绍了Broad研究所的一项新研究，p53通常抑制着数百个基因，若下调p53相关lncRNA的水平，就会影响这些基因的表达。“指出lncRNA具有肿瘤抑制或致癌的直接作用，将为开发癌症新疗法打下基础，”她说。此外，ENCODE项目的最新进展也显示，约有80%的非编码基因组在基因调控中起作用。
Gibb正针对在人类癌症中表达异常的lncRNA进行功能研究。“一般来说，我们可以用计算机对深度测序所得数据进行分析，以此确定疾病中表达异常的lncRNA。而要阐明这些lncRNA的功能则依赖于传统的生化方法，”Gibb说。“解析lncRNA在人类癌症中的功能，不仅能大大拓展癌症治疗的靶标，也将有助于人们开发新的癌症治疗方法。例如，可以通过反义RNA或靶标lncRNA-蛋白相互作用来进行基因调控。”
已有许多研究显示，lncRNA不仅是调控者，也可以作为疾病的生物指标，例如名为HOTAIR的lncRNA。HOTAIR在原发乳腺肿瘤和转移瘤中的表达都会增加，原发肿瘤中HOTAIR的表达水平可以用来有效预测癌转移和死亡。还有一种称为PCA3（prostate cancer antigen 3）的lncRNA在前列腺癌中高度过表达。这种lncRNA是在尿液中发现的，相当便于临床检测。最近FDA已经批准了一个可以用于临床的商业化检测试剂盒Progensa PCA3 test。此外，据Arraystar的Davis介绍，在肝细胞癌中lncRNA-HEIH也高度表达，可以用Arraystar的LncRNA芯片进行检测。
除了癌症以外，lncRNA调控在一些遗传疾病中有重要作用，例如lncRNA调控异常与短指/趾畸形和HELLP综合症有关。而且有研究显示，lncRNA能够稳定阿尔茨海默症关键酶的mRNA。lncRNA能为我们揭示编码基因以外的疾病调控机制么？“在我看来，最令人兴奋的进展是，有越来越多的证据显示lncRNA与主要人类疾病密切相关，而且lncRNA与蛋白编码RNA相比，能够更好的用于疾病诊断和预后，”Arraystar的Davis说。希望有朝一日，非编码RNA能够成为帮助人们抵御疾病的有力武器。
基因组的基因剂量(盒)-复制号码为某一特定gene-data先前reported4所使用sex-matched参考脱氧核糖核酸(Promega,威斯康辛州麦迪逊广场,)和斯坦福大学人类互补的DNA(一)芯片包含41 421综合分子分析和表达的基因组(图像)财团克隆objects9一(以下简称克隆)对应于27日UniGene集群IDs(290不同功能基因组学设施、斯坦福、加利福尼亚的斯坦福大学。相应的,这些肿瘤的基因表达谱,汇集了正常大脑Stratagene核糖核酸(RNA,加利福尼亚拉)以前reported.10-11原始数据为基因剂量和表达都可以在基因表达的综合性(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)和GSE2223加入GSE1991数字分别在斯坦福芯片的数据库(SMD)(http://smd.stanford.edu/)。一种将计算全息芯片244A安捷伦人类基因组的基因数据量、分型研究技术平台HT人类基因组U133A阵列基因表达的数据集,盘子和临床数据为219,188,207恶性胶质瘤,分别从开放存取和Controlled-Access数据层传送门(http://tcga-data.nci.nih.gov/tcga/findArchives.htm)http://cancergenome.nih.gov/index.asp)对TCGA(国家人类基因组研究所批准。当时的数据检索中,有完整的重叠,TCGA的数据类型用于每个样本。欢迎分享，转载请注明来源：内存溢出
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