如何查找一个基因参与的代谢通路

代谢通路：目前在通路数据库(PATHWAY database) 中代谢通路是建立得最好的，有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。

利用如下方法可通过计算机构建出生物体特有 的代谢通路：

先根据基因的序列相似性和位置相关性确定基因组中酶的基因。

然后合理地安排EC号。

最后将基因组中的基因和参照通路中用EC号编号的基因产物 结合起来。

kegg是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库。全称Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（京都基因和基因组百科全书）。

与其他数据库相比，kegg的一个显著特点就是具有强大的图形功能，它利用图形而不是繁缛的文字来介绍众多的代谢途径以及各途径之间的关系，这样可以使研究者能够对其所要研究的代谢途径有一个直观全面的了解。

kegg是一个综合数据库，它们大致分为系统信息、基因组信息和化学信息和健康信息，进一步可细分为18个主要的数据库。可以通过不同的颜色编码来区分。

我们可以根据自己所要查询的信息，在不同子数据库里具体查询，也可以在总页面的上方输入关键字查询，输入的关键词越多，查询到的结果越快捷精确。

kegg建立了kegg直系同源系统(theKEGG Orthology (KO)system)，这个系统通过把分子网络的相关信息连接到基因组中，从而发展和促进了跨物种注释流程。

结果表明，kegg被当做一个参考知识库，被广泛的用于基因组测序和其他高通量实验技术得到的大规模数据集的整合和解释中。

除了保持对基础研究的支持，随着kegg分子网络的一些小变化，kegg正在朝着更加偏向于实际应用的方向发展，这些应用主要集中在整合人类疾病、药物和其他与健康相关的物质。

你好，这个可能是sql服务没开启导致在HMDB的数据库中搜不到数据了。 所以建议先进服务，开启该服务。 如果还是无法开启，就将把系统时间往前退几天，再启动服务试试。人类代谢组数据库(HMDB)于2007年首次发布，被认为是人类代谢研究的标准代谢组学资源，包含有关人类代谢物及其生物学作用、生理浓度、疾病相关性、化学反应、代谢途径和参考光谱的综合信息。HMDB包含114222个代谢物条目，包括水溶性和脂溶性代谢物以及被视为丰富（>1μm）或相对罕见（<1nm）的代谢物。

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