vcf是什么格式的文件

vcf是什么格式的文件,第1张

本教程 *** 作环境:windows10系统、DELL G3电脑。

vcf是什么格式文件VCF是通讯录导出的一种格式。

VCF格式是Windows系统中outlook的名片存储格式,简单地说就是我们俗称的通讯录,打开VCF格式需要使用各手机的配套软件,例如vcf通讯录编辑器打开等,用outlook也可以打开VCF文件。但是问题是要么乱码,要么outlook只能导入第一个号码。

VCF格式通讯录格式用途广泛,一般诺基亚、摩托罗拉手机导出通讯录的格式即为VCF。可以把VCF格式保存到电脑上以备不时之需。而且很多网上通讯录的导入格式也是VCF,例如飞信就加入了导入联系人的功能,可以把手机通讯录导入飞信的通讯录里,这样不管你手机在不在,只要有一台电脑就可以对自己的通讯录里的人了如指掌了。

需要强调的的是,一般导入VCF基本都有乱码,可以用工具VCFEncoding工具重新导入一下,这样就可以解决乱码了。还可以在网上找一些网络通讯录,里面基本都会有用记事本改VCF的功能,可是,一个一个改比较繁琐,建议用第一种方法,省时省力。

上面说导入VCF格式通讯录。下面方法是比较简便的,即向电脑导入CSV通讯录格式。因为VCF格式是一个联系人一个VCF文件,导入网络通讯录时得一个一个导入,而CSV则是所有通讯录都集成在一个文件里,这样导入的话就比较方便。先下载转换工具超级强档,之后安装,安装后运行,点文件,其中有一栏为导入,导入VCF的文件夹就可以,之后在点文件,有一栏为导出,导出CSV文件就可以了,例如将通讯录里的人导入飞信就可以用以上步骤,最后将CSV导入飞信就可以了。CSV可以用Excel编辑,自己看情况可以另外编辑。

也可以直接用WPS表格Excel打开VCF格式文件,打开后是表格。也可以对表格进行修改。

vcf通讯录编辑器下载如下:

更多相关知识,请访问常见问题栏目!

什么是VCF文件:全称“The variant call format”,变体调用格式,是一种用于存储DNA多态性数据如snp、插入、删除和结构变体和丰富注释的通用格式。

什么是VCFtools:VCFtools是一个软件套件,它实现了处理VCF文件的各种工具,包括验证、合并、比较,还提供了一个通用的Perl API。

VCF格式:由标题部分(header)和数据部分(Body)组成。标头包含任意数量的元信息行,每一行都以字符' ## '开头,用TAB键分隔开的字段定义行(field definition line)以单个' # '字符开头。元信息头行提供了数据部分中使用的标记和注释的标准化描述。

字段定义行(field definition line)强制有八个列,相应的数据列代表

染色体 chromosome (CHROM);

基于1的位置开始的变体 a 1-based position of the start of the variant (POS);

变体的惟一标识符 unique identifiers of the variant (ID);

参考等位基因 the reference allele(REF);

替代非引用等位基因的逗号分隔列表  a comma separated list of alternate non-reference alleles(ALT);

phred-scaled质量分数  a phred-scaled quality score(QUAL);

网站过滤信息site filtering information (FILTER);

一个额外的分号分隔的列表和用户可扩展的注释 a semicolon separated list of additional, user extensible annotation (INFO)。

GT,genotype,基因型,将等位基因编码为数字:0表示参考等位基因,1表示ALT列中列出的第一个等位基因,2表示ALT列中列出的第二个等位基因,以此类推。等位基因的数量表明样本的倍性,而分隔符表明相对于其他数据线,等位基因是阶段性的(' | ')还是非阶段性的(' / ')。

PS, phase set,表明具有相同PS值的基因型等位基因排列顺序相同。

DP,读取深度。

GL,genotype likelihoods,给定REF和ALT字段中定义的等位基因集,所有可能的基因型的基因型可能性。

GQ, genotype quality,在位点变异的情况下,基因型调用错误的概率。

手机vcf是windows系统中的outlook名片存储格式文件。

VCF是一个C++编写的开源项目,全名Visual Component Framework,中文名:可视化组件框架。

VCF格式通讯录格式现在用途广泛,一般诺基亚、摩托罗拉手机导出通讯录的格式即为VCF。可以把VCF格式保存到电脑上以备不时之需。

很多网上通讯录的导入格式也是VCF,例如飞信加入了导入联系人的功能,可以把手机通讯录导入飞信的通讯录里,这样不管手机在不在,只要有一台电脑就可以对自己的通讯录里的人了如指掌了。

扩展资料:

VCF文件的基本结构

VCF文件由两个主要部分组成:

1、the variant call records

该部分为主体部分,记录了每个样品每个位点处的基因分型信息。

2、the header

以‘##’为前缀,通常包含fileformat、fileDate、reference等信息,头行信息( header line )

参考资料来源:百度百科-VCF


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