基因定位 如何设计引物

你是做什么物种。如果是已经测序全基因组的物种，找这两个标记在染色体上的位置，然后下载其间的序列，一段一段做blast，找同源物种（或亚种）之间有indel的区段设计引物，包含indel在里面，长度为90-200bp之间都可以，我一般用110bp左右。如果初步定位区段比较大，可以隔500kb一个标记先再确定一下。如果是做大群体定的话，那就卡在两端了，关键是找到好用的引物。

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