生物信息学进 有基因组蛋白序列,如何将每个序列匹配到COG数据库,如一条序列对应J,及翻译,在线等多谢

生物信息学进 有基因组蛋白序列,如何将每个序列匹配到COG数据库,如一条序列对应J,及翻译,在线等多谢,第1张

用COG数据库下的COGNITOR程序进行

下载地址:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/old/xognitor.html

可以进行:

1,蛋白的注解。COG的一个蛋白成员的已知功能(以及扰帆二维或三维结构)可以直接应用到COG的其他成员上去。然而,这里也要警告,因为有些COG含有paralogs,它们的功缓乱雹能并非对应与那些已知蛋白。

2,种系发生图谱。这给出在一个特定的COG中一个给定物种是否存在某些蛋白。系统使用,这些图谱可以用来确定在一个物种中是否一个特定的代谢途径。

3,多重对齐。每一个COG页面包括了一个链接到COG成员的一个多重对齐,那可以被用来确定保守序列残基和分析成员蛋白的进化陪野关系。

你遇到该问题的原因有:

1、可能你的版本低比如sp1及sp2/home版本造成内联保护服务的对象(系统文件)无法识别;

2、你可能在近期安装或下载了一些工具软件,使用其后野扒由于 *** 作不当,使得其无法模脊册正常运行;

3、每次开机响旦宏完音乐后会听到“咚”的一声,而没有什么应用程序显示出来:这是正常的现象,一般一开始时可能会跳出来,但使用一段时间后这种现象就会变成程序显示快速无法看到即先得其声而无其影一样;

4、你可能删除了某些软件的同时破坏了系统软件,建议日后在删除前先进行数据备份或系统还原,在安全模式下删除。解决问题的办法:

1、只要进行更新系统就好(等待自动更新或手动更新);

2、进行系统还原;

3、重装系统或是对系统进行升级安装。

TORAY的设备有个特点,尽管设备程序在更新,但 *** 作方面都是差不多的。就FG2000来说:首先你需要搞清楚它由6个单元组成:上料单元,ACF单元,邦预单元,IC供应单元,主邦单元,出料单元。软件系统有两个,一个是LOCAL(本地),一个是HOST(主机),前者是管生产程序资料的,后者是管系统参数的。 *** 作较简单:1、开气(后面),2,开主电源(后面),3,按POWER ON(前面),4,复位孙备芦(HOME RETURN),5,选自动运行(AUTO),设备可自动运行。关于异常处理,它每步有提则带示要懂点英文的,可以查说明书来解滚兄决的。若要详细资料可联系我邮箱:[email protected]


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