蛋白质结构预测的一般流程 能不能详细一点...

蛋白质察没结构预测简单流程：

1 提取和纯化目标蛋白.

2 蛋白结晶洞没渗

3 X光衍射或核磁共振检测.

4 解谱

5 重纳脊构晶体结构

6 验证

1、通过实验的方法预测蛋白质结构，即对蛋白质晶体使用X射线衍射或核磁敏则共振，得到晶体电子密度等方面的信桥链棚息，从而分析蛋白质结构。这是结构生物学的方法。该方法结果准确可信，但是工作量大，难度也比较高。例如要结晶得到纯度高的蛋白质晶体有时候是很困难的，各种条件要慢慢摸索，往往要靠运气。

2、用计算机程序，根据已有的蛋白质序列只是推测未知蛋白的结构。因为蛋白质序列有保守性，而且一定的序列其折叠方式是有规律的。这样的方法依靠好的算法，推测结构唤陪速度比较快，但是精确性比较差。

二级结构预测的方法大体分为三代：①第一代是基于单个氨基唤差逗酸残基统计分析：从有限的数据集中提取各种残基形成特定二级结构的倾向，以此作为二级结构预测的依据。②第二代预测方法是基于氨基酸片段的统计分析：统计的对象是氨基酸片段，片段的长度通常为11-21个。片段体现了中心残基所处的环境。③第三代方法（考虑多条序列）运用长程信息和蛋白质序列的进化信息，准确度有了比较大的提高。蛋白质二级结构预测方法：首先预测蛋白质的结构类型，然后再预测二级结构。①经验参数法：是一种基于单个氨基酸残基统计的经验预测方法。通过统计分析，获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子，进而利用这些倾庆并向性因子预测蛋白质的二级结构。②GOR方法：是一种基于信息论和贝叶和卖斯统计学的方法。GOR将蛋白质序列当作一连串的信息值来处理；GOR方法不仅考虑被预测位置本身氨基酸残基种类的影响，而且考虑相邻残基种类对该位置构象的影响③Lim方法-立体化学方法：氨基酸的理化性质对二级结构影响较大，在进行结构预测时考虑氨基酸残基的物理化学性质。④同源分析法：将待预测的片段与数据库中已知二级结构的片段进行相似性比较，利用打分矩阵计算出相似性得分，根据相似性得分以及数据库中的构象态，构建出待预测片段的二级结构。该方法对数据库中同源序列的存在非常敏感，若数据库中有相似性大于30%的序列，则预测准确率可大大上升。⑤更为合理的方法：是将待预测二级结构的蛋白质U与多个同源序列进行多重比对，对于U的每个残基位置，其构象态由多个同源序列对应位置的构象态决定，或取出现次数最多的构象态，或对各种可能的构象态给出得分值。⑥综合方法：综合方法不仅包括各种预测方法的综合，而且也包括结构实验结果、序列对比结果、蛋白质结构分类预测结果等信息的综合。多个程序同时预测，综合评判�0�3一致结果；序列比对与二级结构预测；双重预测。

---