(二)单细胞转录组数据分析之数据质控与归一化

(二)单细胞转录组数据分析之数据质控与归一化,第1张

如果大家没有自己的数据或者没有选到合适的数据集的话,可以直接拿示例数据(10X官网演示数据)就行了。
10X官网里多个演示数据: >xshell连接NCBI服务器 输入命令 ftp
连接成功后输入账号 密码
mkdir命令创建一个文件夹,以你的BioProject accession命名
FTP 连接成功后连接成功后
进入刚才建立的BioProject文件夹
把原始数据拖进去即可
传输过程中,如果一定时间(五分钟?)没有激活传输界面,可能会导致连接断开
进度可能会一直停在99%,重新连接成功后,也一直卡在99%,不过似乎数据还是上传成功了的
传输成功的会显示linked,同时FTP里对应的文件会消失 传输成功的会显示linked,同时FTP里对应的文件会消失
全部文件夹都传输成功了会变成queued
然后就等NCBI处理了

写在前面:本内容面向无服务器、无生信团队可依靠的个人小白学习者。本系列文章是我知乎专栏《 学习·持续输出 》转录组入门中的内容重新整理和更新,本系列内容得益于生信技能树、生信媛、果子学生信、基因课、高通量测序技术等公众号长期推广生信分析技术,在此向这些公众号及其创立者、运营者一并表示感谢!!

原文链接:>

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原文地址: https://outofmemory.cn/zz/10879886.html

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