企业根CA与企业从属CA

CA（证书权威）分为独立CA和分布式CA。
分页式CA指多级CA，根CA、二级CA、三级CA、四级CA。。。
具体有多少级，由企业自主决定。
现在一般分为二级CA。也称为根CA、从属CA。
根CA是信任的源头，管理下级CA，即你说的从属CA。
根CA制定根策略、如有效期等，从属CA的有效期不会超过根CA。
区别：
根CA：负责管理从属CA，包括签发、废除等，还有发布ARL
从属CA：负责管理用户证书（含个人用户、企业用户、管理员、服务器、代码签名证书等），包括签发、废除、冻结、解冻等，还有发布CRL

你的概念理解得有点错误。
根证书是指根CA证书，是信任的源头。根证书是自签发证书，就是自己签发自己，要不为何叫做根？
CA证书包括根CA证书、二级CA证书、三级。。。
CA证书不参与通信，只有服务器证书和用户证书等参与通信过程的建立。
不是证书之间建立通信，而是通过通信协议在通信的建立过程中使用到了证书，如SSL协议，具体如何建立通信过程，请参见SSL的握手协议。
服务器证书和用户证书，即使不是一个CA签发的，也可以使用证书达到互相通信的目的。只需要进行配置做到相互信任对方的CA证书即可。
你还需要进一步理清概念。。。

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