数据框(data.frame)是R中最常处理的数据结构。
函数:data.frame(col1,col2,col3,....,row.name=NULL, check.rows = FALSE, check.names=TRUE, stringsAsFactors = default.stringsAsFactors())
其中的列向量col1, col2, col3,...可为任何类型(如字符型、数值型或逻辑型),每一列的名称可由函数names指定;
row.name用于指定各行(样本)的名称,默认没有名称,使用从1开始自增的序列来标识每一行;
check.rows用于用来检查行的名称和数量是否一致,默认为FALSE;
check.names来检查变量(列)的名称是否唯一且符合语法,默认为TRUE;
stringsAsFactors用来描述是否将字符型向量自动转换为因子,默认转换,若不改变的话使用stringsAsFactors = FALSE来指定即可。
每一列数据的模式必须唯一,不过你却可以将多个模式的不同列放到一起组成数据框。
先构建向量,再组成数据框。
直接用data.frame函数构建数据框。
R语言的下标索引是从1开始的,且下标索引为负数的话表示删除某个元素。
[] 可进行索引,括号内对应的是[行下标, 列下标]。
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8
[1] "four"
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8
[1] "four"
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8
[1] "one" "two" "three"
attach、detach和with()
函数attach()可将数据框添加到R的搜索路径中。
函数detach()将数据框从搜索路径中移除。
函数attach()和detach()最好在你分析一个单独的数据框,并且不太可能有多个同名对象时使用。
with()就是把所有 *** 作都限制在数据框上。
The following objects are masked by .GlobalEnv:
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8
[1] "n1" "n2" "n3" "n4" "n5" "n6" "n7" "n8"
[1] 8
[1] 3
[1] 8
[1] "name""values" "values2"
[1] "r1" "r2" "r3" "r4" "r5" "r6" "r7" "r8"
[1] 8 3
[1] "data.frame"
[1] "numeric"
[1] "character"
Length:8 Min. :1.00 Min. :1.00
Class :character 1st Qu.:2.75 1st Qu.:2.75
Mode :character Median :4.50 Median :4.50
Mean :4.50 Mean :4.50
3rd Qu.:6.25 3rd Qu.:6.25
Max. :8.00 Max. :8.00
[1] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
r语言中添加新列的方法:
假设你数据是data,那么前几列的和是rowSums(data);
然后你可以重新做一个dataframe
data_new<-data.frame(data,sum=rowSums(data))
R语言Data Frame数据框常用 *** 作:
Data Frame一般被翻译为数据框,感觉就像是R中的表,由行和列组成,与Matrix不同的是,每个列可以是不同的数据类型,而Matrix是必须相同的。
Data Frame每一列有列名,每一行也可以指定行名。如果不指定行名,那么就是从1开始自增的Sequence来标识每一行。
使用data.frame函数就可以初始化一个Data Frame。比如我们要初始化一个student的Data Frame其中包含ID和Name还有Gender以及Birthdate,那么代码为:
student<-data.frame(ID=c(11,12,13),Name=c("Devin","Edward","Wenli"),Gender=c("M","M","F"),Birthdate=c("1984-12-29","1983-5-6","1986-8-8”))
另外也可以使用read.table() read.csv()读取一个文本文件,返回的也是一个Data Frame对象。读取数据库也是返回Data Frame对象。
查看student的内容为:
ID Name Gender Birthdate
1 11 Devin M 1984-12-29
2 12 Edward M 1983-5-6
3 13 Wenli F 1986-8-8
这里只指定了列名为ID,Name,Gender和Birthdate,使用names函数可以查看列名,如果要查看行名,需要用到row.names函数。这里我们希望将ID作为行名,那么可以这样写:
row.names(student)<-student$ID
R语言之创建数据集数据集通常是由数据构成的一个矩形数组,行表示观测,列表示变量。
R中有许多用于存储数据的结构,包括标量、向量、数组、数据框和列表。
在R中,对象(object)是指可以赋值给变量的任何事物,包括常量、数据结构、函数、甚至是图形。因子(factor)是名义型变量或有序型变量,在R中被特殊地存储和处理。
R中的数据结构:
1.1向量
向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。创建向量使用函数c(),如下例所示:
数值型向量:a<-c(1,2,5,3,6,-2,4)
字符型向量:b<-c("one","two","three")
逻辑型向量:c<-c(TRUE,TRUE,TRUE,FALSE,TRUE)
注:单个向量中的数据必须拥有相同的类型或模式。
标量是只含一个元素的向量,例如f<-3、g<-"US"和h<-TRUE。它们用于保存常量。
访问向量中的元素,可在方括号中给定元素所处位置的数值,如:a[c(2,4)]用于访问向量a中的第二个和第四个元素。
1.2矩阵
矩阵是一个二维数组,只是每个元素都拥有相同的模式(数值型、字符型或逻辑型),可以通过matrix创建矩阵
一般使用格式为:
mymatrix<-matrix(vector,nrow=number_of_rows,ncol=number_of_columns,byrow=logical_value,dimnames=list(
char_vector_rownames,char_vector_colnames)) ,其中vector包含了矩阵的元素,nrow和ncol用以指定
行和列的维数,dimnames包含了可选的以字符型向量表示的行名和列名。选项byrow则表明矩阵应当按行
填充(byrow=TRUE)还是按列填充(byrow=FALSE),默认情况下按列填充。代码演示如下:
[plain] view plain copy
>cells<-c(1,23,56,485)
>rnames<-c("R1","R2")
>cnames<-c("c1","c2")
[plain] view plain copy
<pre name="code" class="html">>mymatrix<-matrix(cells ,nrow=2,ncol=2,byrow=TRUE,dimnames=list(rnames,cnames))
>mymatrix
c1 c2
R1 1 23
R2 56 485
1.3数组
数组与矩阵类似,但是维数可以大于2。数组可通过array函数创建,形式如下:
myarray<-array(vector,dimensions,dimnames),其中vector包含了数组中的数据,dimensions是一个数值型向量,给出了各个维度下标的最大值,而dimnames是可选的、各维度名称标签的列表。代码如下:
[html] view plain copy
>dim<-c("A1","A2")
>dim1<-c("A1","A2")
>dim2<-c("B1","B2","B3")
>dim3<-c("C1","C2","C3","C4")
>z<-array(1:24,c(2,3,4),dimnames=list(dim1,dim2,dim3))
>z
, , C1
B1 B2 B3
A1 1 3 5
A2 2 4 6
, , C2
B1 B2 B3
A1 7 9 11
A2 8 10 12
, , C3
B1 B2 B3
A1 13 15 17
A2 14 16 18
, , C4
B1 B2 B3
A1 19 21 23
A2 20 22 24
1.4数据框
数据框中不同的列可以包含不同模式(数值型、字符型等)的数据,是R中最常处理的数据结构。数据框可以通过函数data.frame()创建:mydata<-data.frame(col1,col2,col3,...),其中的列向量col1,col2,col3,...可为任何类型(如字符型、数值型或逻辑型)。每一列的名称可由函数names指定。代码如下:
[html] view plain copy
>age<-c(25,34,28,53)
>patientID<-c(1,2,3,4)
>diabetes<-c("Type1","Type2","Type1","Type1")
>status<-c("Poor","Improved","Excellent","Poor")
>patientdata<-data.frame(patientID,age,diabetes,status)
>patientdata
patientID age diabetesstatus
1 1 25Type1 Poor
2 2 34Type2 Improved
3 3 28Type1 Excellent
4 4 53Type1 Poor
>patientdata$age
[1] 25 34 28 53
<pre name="code" class="html">>table(patientdata$diabetes,patientdata$status)
Excellent Improved Poor
Type1 102
Type2 010
$被用来选取一个给定数据框中的某个特定变量,上面table(patientdata$diabetes,patientdata$status)生成了 diabetes和status的列联表。
函数attach()可将数据框添加到R的搜索路径中。
函数detach()将数据框从搜素路径中移除。
相对于attach。多数的R书籍更推荐使用函数with()。
1.5因子
变量可归结为名义型、有序型或连续型变量。类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子。因子在R中非常重要,因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。
函数factor()以一个整数向量的形式存储类别值,整数的取值范围是[1...k](其中k是名义变量中唯一值得个数),同时一个由字符串(原始值)组成的内部向量将映射到这些整数上。
名义型eg:假设有向量:diabetes<-c("Type1","Type2","Type1","Type1")
语句diabetes<-factor(diabetes)将此向量存储为(1,2,1,1).
有序型eg: 对于给定变量status<-c("Poor","Improved","Excellent","Poor")
语句status<-factor(status,ordered=TRUE)会将向量编码为(3,2,1,3)。
1.6列表(list)
列表是R的数据类型中最为复杂的一种。列表就是一些对象的(或成分,component)的有序集合。列表允许你整合若干(可能无关)的对象到单个对象名下。例如,某个列表中可能是若干向量、矩阵、数据框,甚至是其他列表的组合。可以使用函数list()创建列表:
mylist<-list(object1,object2,...)
注:列表成为了R中的重要数据结构。
1.列表允许以一种简单的方式组织和重新调用不相干的信息;
2.许多R函数的运行结果都是以列表的形式返回的。
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