关于利用POWER+FPGA云, 加速生命科学的基因数据研究的分析

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人类从未停止对生命奥秘的探索,随着高性能计算和大数据技术应用于生命科学,生命科学的神秘面纱正在一点点被揭开。

一些开源社区提供开源的基因数据预处理工具,例如Picard, SAM Tool等,旨在利用开源的力量,加速生命科学的研究。然而,在基因数据预处理层面上,有一些问题始终难以解决。第一是处理速度,第二是输出基因文件过于庞大,动辄几百GB甚至上T的数据,使得数据传输非常困难。而利用传统的软件压缩方法,虽然可以减少文件的大小,但耗费了更多的时间。

如何在处理速度和文件压缩上取得较好性能? SuperVessel超能云提供的FPGA硬件加速服务,良好地解决了这个问题。SuperVessel超能云已经演进至支持认知计算的2.0阶段,利用异构计算和虚拟化技术,提供远程的FPGA加速服务,使开发者在有网络的情况下,就可以进行FPGA应用开发。独特的GenWQE FPGA加速引擎,提供硬件加速服务,助力生命科学研究。

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在2015 Super CompuTIng大会上,SuperVessel超能云展示了生命科学领域中的三个应用实例,从不同的角度加速基因数据的处理。您可以通过访问SuperVessel ApplicaTIon AcceleraTIon Store ,亲身体验极速处理的威力。

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