Debug: FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: ‘dot’

文章目录

• • • 问题描述
    • 尝试过程
    • 解决方法
    • 拓展参考

问题描述

在用sklearn可视化决策树, 使用graphviz时报错：

报错：

尝试过程

参考：https://github.com/WillKoehrsen/Data-Analysis/issues/36
在MACOS系统中

brew install graphviz

失败。

再次尝试将

更换为

import sys
!{sys.executable} -m conda install graphviz -y

!{sys.executable} -m conda install pydot -y

报错：

RemoveError: 'setuptools' is a dependency of conda and cannot be removed from
conda's operating environment.

参考
https://stackoverflow.com/questions/57549872/removeerror-setuptools-is-a-dependency-of-conda-and-cannot-be-removed-from-co
尝试

conda update --force conda -y
conda update anaconda -y

(注意：使用-y 在jupyter notebook中以便执行时能够自动输入y）
再执行

import sys
!{sys.executable} -m conda install graphviz -y
!{sys.executable} -m conda install pydot -y

报错：

AssertionError: "dot" with args ['-Tpdf', '/var/folders/k0/4p98b7gn5cxc60_kvmtm31840000gn/T/tmp13v4uvz5'] returned code: -9

解决方法

网上没有多少相关资料。

许多资料的error code 都是1，没有搜到-9的。

参考官方git下有关断言错误的issue：https://github.com/keras-team/keras/issues/12640
其中有一句：

因此决定尝试安装一下tensorflow。

安装tensorflow报错找不到包。

通过查询资料，得知可能需要先卸载numpy。

根据经验决定升级一下numpy试试。

最终版代码：

!conda update --force conda -y
!conda update anaconda -y
import sys
!{sys.executable} -m conda install graphviz -y
!{sys.executable} -m conda install pydot -y
!pip install -U numpy

成功！

拓展参考

据其他人说可行的文章：
https://blog.csdn.net/gj18405655459/article/details/123234866?spm=1001.2101.3001.6650.1&utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7ECTRLIST%7ERate-1.pc_relevant_paycolumn_v3&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7ECTRLIST%7ERate-1.pc_relevant_paycolumn_v3

https://stackoverflow.com/questions/40243753/exception-dot-not-found-in-path-in-python-on-mac