GO分析（cytoscape）

1.下载安装软件

访问生信自学网或官方网站自行下载安装

note:软件路径地址需要英文路径，否则很难使用

2.软件BiNGO的安装

打开cytoscape软件—点击Apps—Apps Manager—Install Apps—在搜索框内搜索BiNGO—点击选中中间框中的BiNGO—点击右下角的Install安装—关闭Apps Manager窗口

 3.打开BiNGO

选择Apps—点击安装的BiNGO，打开BiNGO界面

 4.使用BiNGO进行GO分析

（1）在Cluster name中输入GO分析后产生的文件名称

（2）选中Paste genes from text，并在下面框中填入进行GO分析的基因名称

（3）在Choose a significance level填入显著性—0.05或者0.01

（4）在Select ontology file中填入进行GO分析的类别，细胞分析的是BP，CC和MF分析

（5）在Select organism/annotation中选择物种

（6）最后选中Save BiNGO data file in并填入生成文件的保存路径

5.最后使用Excel打开生成的文件就完成GO分析了，也可以利用表中数据进行绘图分析。或者，根据研究的功能在相应的功能中选取感兴趣的基因进行研究。